Natalia V. Bykova, Ph.D.

Image Natalia V Bykova
Chercheuse scientifique

Protéomique des céréales, analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications post‑traductionnelles par spectrométrie de masse

Agriculture et Agroalimentaire Canada
101 Route 100, Unit 100, Morden, Manitoba, R6M 1Y5

Recherche et / ou projets en cours

Le programme de recherche est axé sur l’analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications; la coordination post-traductionnelle des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences; les technologies quantitatives fondées sur la spectrométrie de masse en protéomique végétale pour une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires qui régulent les fonctions et les interactions des protéines.

Intégration de la protéomique quantitative, de la métabolomique d’oxydoréduction et de la protéogénomique afin de déterminer les sources de résistance à la germination avant la récolte dans le blé canadien.

Atténuation des nouvelles menaces pour le blé – menace de rouille sur le blé dur mexicain. Découverte de protéines effectrices ciblant le noyau – analyse protéomique nucléaire quantitative de l’interaction hôte‑pathogène, intégration des données omiques et bio‑informatiques, validation et analyses fonctionnelles des effecteurs candidats, dont les gènes R et les cibles de l’hôte.

 

Énoncés de recherches/projets

Protéomique végétale fonctionnelle et caractérisation des protéines par spectrométrie de masse, réaction aux maladies et au stress

    Analyse protéomique des modifications – identification et caractérisation par spectrométrie de masse des modifications post‑traductionnelles que sont la phosphorylation, la glycosylation et l’oxydoréduction cystéinique, et élucidation des relations entre les modifications et les fonctions.

    Détermination du rôle des modifications protéiques post‑traductionnelles dans la coordination des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences

    Détermination des éléments des voies de signalisation et des mécanismes moléculaires liés aux interactions entre les plantes et les agents pathogènes

Activités professionnelles / intérêts

Membre de la Société canadienne de biologie végétale et de l’American Society of Plant Biologists; membre de l’International Plant Proteomics Organization (INPPO) et représentante du Canada et porte‑parole au Conseil exécutif de l’INPPO (depuis 2011), un organisme qui facilite la mise au point de nouvelles technologies en sciences végétales, fait la promotion de la protéomique végétale et intensifie la coopération internationale en vue de l’intégration des activités liées à la protéomique végétale.

Prix et études

Ph. D. en biochimie, Université d’État de Voronej, Russie

M. Sc. en biochimie et physiologie végétales, Université d’État de Voronej, Russie

Bourse d’études de cycle supérieur – G. Soros International Science Foundation, États‑Unis, 1996

Expérience et / ou de travail international

Professeure adjointe – Département de biologie, Memorial University of Newfoundland (MUN), 2008 à 2012

Associée de recherche – Applications de spectrométrie de masse en biologie, Time-of-Flight Mass Spectrometry Laboratory, Département de physique et d’astronomie, Université du Manitoba, 2002 à 2004

Poste postdoctoral – Protéomique, Département de recherche sur les végétaux, Risø National Laboratory, Danemark, 2001 à 2002

Bourse postdoctorale – Quatrième programme cadre de biotechnologie de l’UE, Département de physiologie végétale, Umeå Plant Science Centre, Université d’Umeå, Suède, 1998 à 2001

Bourse d’études du Swedish Institute (total de 7 mois) – Département de physiologie végétale, Université de Lund, Suède, 1998

 

Principales publications

  1. Ma, Z., Marsolais, F., Igamberdiev, A.U., et Bykova, N.V. (2014). « Metabolism of organic acids in barley seeds during germination. », Plant Biology 2014, Portland, Oregon, USA, July 12-16, 2014, Presentation. (Affiche)

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  2. Tailor, S., Bykova, N.V., et Debnath, S.C. (2014). « Genetic diversity in blueberry (Vaccinium spp. L.) using molecular markers. », Canadian Society of Agronomy & Canadian Society for Horticultural Science Joint Annual Conference, University of Lethbridge, Lethbridge, Alberta, Canada, July 10-12, 2014, p. 33. (Résumé)

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  3. Bykova, N.V., Møller, I.M., Gardeström, P., et Igamberdiev, A.U. (2014). « The function of glycine decarboxylase complex is optimized to maintain high photorespiratory flux via buffering of its reaction products. », Mitochondrion, 19(Part B), p. 357-364. doi : 10.1016/j.mito.2014.01.001

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  4. Ahmed, A.A., Balogun, K.A., Bykova, N.V., et Cheema, S.K. (2014). « Novel regulatory roles of omega-3 fatty acids in metabolic pathways: a proteomics approach. », Nutrition & Metabolism, 11(6), p. 11 pages. doi : 10.1186/1743-7075-11-6

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  5. Bykova, N.V., Hoehn, B., Rampitsch, C., Hu, J.-N., et Fan, T. (2013). « Redox-mediated regulation of wheat seed dormancy revealed through modification specific proteomics. », 11th International Conference on Reactive Oxygen and Nitrogen Species in Plant, Warsaw, Poland. (Affiche)

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  6. Hu, J.-N., Stebbing, J.A., Fan, T., Rampitsch, C., et Bykova, N.V. (2013). « Proteomic analysis reveals changes in abundance, composition, and phosphorylation of membrane-associated protein complexes from wheat aleurone in response to alteration in seed dormancy. », CSPB Annual Meeting, Quebec City, Canada. (Affiche)

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  7. Bykova, N.V., Hu, J.-N., Rampitsch, C., Stebbing, J.A., et Fan, T. (2013). « Proteomic profiling of membrane-associated protein complexes in wheat aleurone tissue using Blue Native gels and label-free semi-quantitative LC-MS/MS approach. », 5th Canadian National Proteomics Network Symposium, Vancouver, BC, Canada. (Affiche)

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  8. Agrawal, G.K., Sarkar, A., Righetti, P.G., Pedreschi, R., Carpentier, S., Wang, T., Barkla, B.J., Kohli, A., Ndimba, B.K., Bykova, N.V., Rampitsch, C., Zolla, L., Rafudeen, M.S., Cramer, R., Bindschedler, L.V., Tsakirpaloglou, N., Ndimba, R.J., Farrant, J.M., Renaut, J., Job, D., Kikuchi, S., et Rakwal, R. (2013). « A decade of plant proteomics and mass spectrometry: Translation of technical advancements to food security and safety issues. », Mass Spectrometry Reviews, 32(5), p. 335-365. doi : 10.1002/mas.21365

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  9. Bykova, N.V. et Rampitsch, C. (2013). « Modulating protein function through reversible oxidation: Redox-mediated processes in plants revealed through proteomics. », Proteomics, 13(3-4), p. 579-596. doi : 10.1002/pmic.201200270

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  10. Bykova, N.V. (2012). « Differential and redox-sensitive proteomic analysis of pre-harvest sprouting tolerance. », 1st Canadian Wheat Symposium, Winnipeg, MB, Canada, November 30-December 2, 2011, Published in: Can. J. Plant Sci., 92(3), pp. 600.

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  11. Ma, Z., Igamberdiev, A.U., et Bykova, N.V. (2012). « Metabolism of reactive oxygen and nitrogen species during germination of barley seeds with different levels of dormancy. », Canadian Society of Plant Biologists Meeting (CSPB 2012), University of Alberta Campus, Edmonton, AB, Canada, June 25-27, 2012. (Présentation)

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  12. Bykova, N.V. et Igamberdiev, A.U. (2012). « Metabolism of reactive oxygen and nitrogen species during germination of barley seeds with different levels of dormancy. », Annual Meeting of the Canadian Society of Plant Physiologists (CSPP/SCPV 2012), University of Alberta Campus, Edmonton, AB, Canada, June 25-27, 2012. (Présentation)

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  13. An, D., Bykova, N.V., et Debnath, S.C. (2012). « Identifying wild and cultivated cranberries and evaluating their relationships using morphology, and EST-PCR and ISSR markers. », Plant Canada 2012 (joint meeting of the Canadian Society of Agronomy (CSA), Canadian Society for Horticultural Science (CSHS), Certified Crop Advisors (CCA), North American Fruit Explorers (NAFEX)): Adapting Crops to Change, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada, July 16-19, 2012, P1 Abstract Id 3764, p. p.44.

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  14. Shah, J.K., Hebelstrup, K.H., Bykova, N.V., et Igamberdiev, A.U. (2012). « The biotechnological use of hemoglobin overexpression in barley. », Annual Meeting of the American Society of Plant Biology, Austin, TX, USA, July 31-August 3, 2012, Poster P02048. (Résumé)

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  15. Debnath, S.C., Siow, Y.L., Petkau, J.C., An, D., et Bykova, N.V. (2012). « Analyse de la diversité génétique des petits fruits grâce aux marqueurs moléculaires et à l’activité des antioxydants. », Canadian Journal of Plant Science, 92(6), p. 1121-1133. doi : 10.4141/cjps2011-240

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  16. Rampitsch, C. et Bykova, N.V. (2012). « The beginnings of crop phosphoproteomics: exploring early warning systems of stress. », Frontiers in Plant Science, 3(144), p. 1-15. doi : 10.3389/fpls.2012.00144

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  17. Rampitsch, C. et Bykova, N.V. (2012). « Proteomics and plant disease: Advances in combating a major threat to the global food supply. (Review). », Proteomics, 12(4-5), p. 673-690. doi : 10.1002/pmic.201100359

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  18. Ma, Z., Igamberdiev, A.U., et Bykova, N.V. (2011). « The glycolytic and antioxidant H₂O₂ scavenging capacity of germinating barley seeds with different levels of dormancy. », Plant Canada 2011, Saint Mary’s University, Halifax, NS, Canada, July 17-21, 2011. (Présentation)

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  19. Debnath, S.C., Siow, Y.L., Petkau, J.C., An, D., et Bykova, N.V. (2011). « Molecular markers and antioxidant activity in berry crop diversity analysis. », Plant Canada 2011, Saint Mary’s University, Halifax, NS, Canada, July 17-21, 2011, 78, Session 1. (Présentation)

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  20. Hu, J., Hoehn, B., Rampitsch, C., et Bykova, N.V. (2011). « Impact of dormancy genotypes on differential protein expression profiles and redox-sensitive landscape of the proteome in hybrid spring wheat lines. », Plant Canada 2011, Saint Mary’s University, Halifax, NS, Canada, July 17-21, 2011. (Affiche)

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