Natalia V. Bykova, Ph.D.

Image Natalia V Bykova
Chercheuse scientifique

Protéomique des céréales, analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications post‑traductionnelles par spectrométrie de masse

Agriculture et Agroalimentaire Canada
101 Route 100, Unit 100, Morden, Manitoba, R6M 1Y5

Recherche et / ou projets en cours

Le programme de recherche est axé sur l’analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications; la coordination post-traductionnelle des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences; les technologies quantitatives fondées sur la spectrométrie de masse en protéomique végétale pour une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires qui régulent les fonctions et les interactions des protéines.

Intégration de la protéomique quantitative, de la métabolomique d’oxydoréduction et de la protéogénomique afin de déterminer les sources de résistance à la germination avant la récolte dans le blé canadien.

Atténuation des nouvelles menaces pour le blé – menace de rouille sur le blé dur mexicain. Découverte de protéines effectrices ciblant le noyau – analyse protéomique nucléaire quantitative de l’interaction hôte‑pathogène, intégration des données omiques et bio‑informatiques, validation et analyses fonctionnelles des effecteurs candidats, dont les gènes R et les cibles de l’hôte.

 

Énoncés de recherches/projets

Protéomique végétale fonctionnelle et caractérisation des protéines par spectrométrie de masse, réaction aux maladies et au stress

    Analyse protéomique des modifications – identification et caractérisation par spectrométrie de masse des modifications post‑traductionnelles que sont la phosphorylation, la glycosylation et l’oxydoréduction cystéinique, et élucidation des relations entre les modifications et les fonctions.

    Détermination du rôle des modifications protéiques post‑traductionnelles dans la coordination des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences

    Détermination des éléments des voies de signalisation et des mécanismes moléculaires liés aux interactions entre les plantes et les agents pathogènes

Activités professionnelles / intérêts

Membre de la Société canadienne de biologie végétale et de l’American Society of Plant Biologists; membre de l’International Plant Proteomics Organization (INPPO) et représentante du Canada et porte‑parole au Conseil exécutif de l’INPPO (depuis 2011), un organisme qui facilite la mise au point de nouvelles technologies en sciences végétales, fait la promotion de la protéomique végétale et intensifie la coopération internationale en vue de l’intégration des activités liées à la protéomique végétale.

Prix et études

Ph. D. en biochimie, Université d’État de Voronej, Russie

M. Sc. en biochimie et physiologie végétales, Université d’État de Voronej, Russie

Bourse d’études de cycle supérieur – G. Soros International Science Foundation, États‑Unis, 1996

Expérience et / ou de travail international

Professeure adjointe – Département de biologie, Memorial University of Newfoundland (MUN), 2008 à 2012

Associée de recherche – Applications de spectrométrie de masse en biologie, Time-of-Flight Mass Spectrometry Laboratory, Département de physique et d’astronomie, Université du Manitoba, 2002 à 2004

Poste postdoctoral – Protéomique, Département de recherche sur les végétaux, Risø National Laboratory, Danemark, 2001 à 2002

Bourse postdoctorale – Quatrième programme cadre de biotechnologie de l’UE, Département de physiologie végétale, Umeå Plant Science Centre, Université d’Umeå, Suède, 1998 à 2001

Bourse d’études du Swedish Institute (total de 7 mois) – Département de physiologie végétale, Université de Lund, Suède, 1998

 

Principales publications

  1. RM1. The activity of key fermentative enzyme Alcohol Dehydrogenase 1 from Arabidopsis thaliana is differentially altered by several redox post-translational modifications. S. Dumont1*, N.V. Bykova2, A. Khaou1, Y. Besserour1, J. Rivoal1.Canadian Society of Plant Biologists. Eastern Regional Meeting 2017. November 24-25, 2017. Montreal, Canada.

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  2. Bykova NV, Jordan M, Radovanovic N, Rampitsch M, Hu-Skrzenta J (2017) Proteogenomics analysis of seed dormancy identifies genotype- and phenotype-associated proteomic signatures of pre-harvest sprouting resistance in dormant and non-dormant hybrid genotypes of wheat. In: Plants from Sea to Sky. A joint meeting of the CSPB and the Canadian Society for Horticultural Science, Vancouver, British Colombia, Canada, July 4-7, 2017. Poster number 246-DV.

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  3. Hu-Skrzenta J, Radovanovic N, Rampitsch M, Igamberdiev AU, Bykova NV (2017) Redox regulation of after-ripening induced wheat seed dormancy release revealed through tissue-specific proteomics and antioxidant capacity profiling. In: Plants from Sea to Sky. A joint meeting of the CSPB and the Canadian Society for Horticultural Science, Vancouver, British Colombia, Canada, July 4-7, 2017. Oral presentation, student

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  4. Bykova NV, Jordan M, Hu J, Radovanovic N, Rampitsch M (2016) Integrated proteogenomics approach to reveal sources of pre-harvest sprouting resistance in Canadian wheat. 3rd Canadian Wheat Symposium, Ottawa, Ontario, Canada, November 22-25. Poster - P42.

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  5. Fan, T., Bykova, N.V., Rampitsch, C., Xing, T. (2016). Identification and characterization of a serine protease from wheat leaves. European Journal of Plant Pathology, [online] 146(2), 293-304. http://dx.doi.org/10.1007/s10658-016-0914-x

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  6. Bykova NV, Igamberdiev AU (2016) Redox state in plant mitochondria and its role in stress tolerance. In: Redox State as a Central Regulator of Plant-Cell Stress Responses. D.K. Gupta, J. M. Palma, F. J. Corpas (Editors), Springer International Publishing AG Switzerland. DOI 10.1007/978-3-319-44081-1_5; pp 93-115.

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  7. Bykova NV, Jordan M, Hu J, Radovanovic N, Rampitsch M (2016) Integration of quantitative proteomics, redox metabolomics and proteogenomics to identify sources of seed dormancy control and pre-harvest sprouting resistance in wheat. 2nd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Bratislava, Slovakia, September 4th-8th, 2016. Oral presentation

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  8. Ma, Z., Marsolais, F., Bernards, M.A., Sumarah, M.W., Bykova, N.V., et Igamberdiev, A.U. (2016). « Glyoxylate cycle and metabolism of organic acids in scutellum of barley seeds during germination. », Plant Science. doi : 10.1016/j.plantsci.2016.04.007

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  9. Hu J, Radovanovic N, Bykova NV (2016) Integration of proteome and targeted redox metabolome profiling of seed dormancy genotype and after-ripening induced changes in wheat. Plant Biotech 2016, A joint meeting of the CSPB and the Canadian Association for Plant Biotechnology, Kingston, Ontario, Canada, June 19th-21st, 2016. Oral presentation, student.

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  10. Ma, Z., Marsolais, F., Bykova, N.V., et Igamberdiev, A.U. (2016). « Nitric oxide metabolism in barley seed embryo during germination. », Frontiers in Plant Science, p. 1-13. doi : 10.3389/fpls.2016.00138

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  11. Hu, J., Radovanovic, N., Fan, T., et Bykova, N.V. (2015). « Redox regulation of seed dormancy release in spring wheat revealed through tissue-specific proteomics, metabolomics and antioxidant activity profiling. », Canadian Plant Science Annual Meeting with Plant Canada and other plant societies at Botany 2015, Edmonton, Alberta, Canada, July 25-29, 2015. (Affiche)

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  12. Bykova, N.V. et Igamberdiev, A.U. (2015). « Non-coupled pathways of plant mitochondrial electron transport support high rates of glycine oxidation. », 9th International Conference for Plant Mitochondrial Biology ICPMB, Wrocław, Poland, May 17-22, 2015, P81. (Affiche)

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  13. Igamberdiev, A.U. et Bykova, N.V. (2015). « Non-coupled pathways of plant mitochondrial electron transport and the maintenance of high photorespiratory flux. », dans Gupta, K.J., Mur, L.A.J., and Neelwarne, B. (dir.) - Alternative Respiratory Pathways in Higher Plants, John Wiley & Sons, Ltd, Chapitre 2.

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  14. Bykova, N.V., Hu, J., et Radovanovic, N. (2015). « Redox control of metabolic reprogramming toward seed dormancy release in wheat. », 12th International Conference on Reactive Oxygen and Nitrogen Species in Plants: from model systems to field, Verona, Italy, June 24-26, 2015.

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  15. Bykova, N.V., Hu, J.-N., Ma, Z., et Igamberdiev, A.U. (2015). « The role of reactive oxygen and nitrogen species in bioenergetics, metabolism and signaling during seed germination. », dans Gupta, K.J. and Igamberdiev, A.U. (dir.) - Reactive Oxygen and Nitrogen Species Signaling and Communication in Plants, Springer Berlin / Heidelberg, p. 177-195.

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  16. An, D., Bykova, N.V., et Debnath, S.C. (2015). « Identification d'un ensemble de canneberges sauvages et évaluation de leurs liens de parenté grâce à des marqueurs EST-PCR, EST-SSR et ISSR. », Canadian Journal of Plant Science, 95(6), p. 1155-1165. doi : 10.4141/CJPS-2015-158

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  17. Hu, J., Rampitsch, C., et Bykova, N.V. (2015). « Advances in plant proteomics toward improvement of crop productivity and stress resistance. », Frontiers in Plant Science, 6(209), p. 1-15. doi : 10.3389/fpls.2015.00209

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  18. Bykova, N.V., Rampitsch, C., et les autres (2014). « Proteomic approaches to revealing mechanisms of physiological transition from seed dormancy to high germination potential in wheat. », Plant Biology 2014, Portland, Oregon, USA, July 12-16, 2014. (Affiche)

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  19. Bykova, N.V., Hu, J.-N., Radovanovic, N., You, F.M., et Fan, T. (2014). « Quantitative proteomic approaches to revealing mechanisms of seed dormancy control and pre-harvest sprouting resistance in wheat. », 1st INPPO World Congress on Plant Proteomics: Methodology to Biology, Hamburg, Germany, August 31- September 4, 2014, Member of the Scientific Organizing Committee; Presentation.

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  20. Bykova, N.V., Hu, J.-N., Rampitsch, C., Fan, T., et Radovanovic, N. (2014). « Quantitative comparative proteomic profiling of tissue-specific and membrane-associated seed proteomes in pre-harvest sprouting resistant and susceptible hybrid wheat genotypes. », 2nd Canadian Wheat Symposium, Saskatoon, SK, Canada, June 8-11, 2014. (Affiche)

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