Frank You

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Chercheur Scientifique

Recherche en génomique et en bio-informatique des cultures, en particulier le blé et le lin. Principaux domaines d’expertise : bio-informatique des végétaux, génétique quantitative et génomique statistique, séquençage génomique, évolution des génomes et conception d’outils logiciels et de bases de données.

Recherche et / ou projets en cours

  • Variantes génétiques et épigénétiques des cultures de céréales canadiennes pour la production et l’analyse fonctionnelle; projet de l’IRDG

  • Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi; projet de la WGRF

  • Caractérisation des gènes de la résistance à la rouille chez le lin; projet de l’ADF

  • Mise au point de variétés et de matériel génétique de haricots secs à maturation précoce pour le Manitoba et l’Ouest canadien; grappe des légumineuses du PCA.

  • Plateformes de préreproduction pour l’amélioration du blé canadien; grappe du blé du PCA

  • Marqueurs génomiques et moléculaires permettant d’identifier les gènes de résistance chez le lin; projet du PCA

  • Projet 4DWheat : diversité, découverte, design et diffusion; projet de Génome Canada et d’AAC

  • Étude de la génomique de l’avoine et de l’orge pour trouver des traits spécifiques et utilitaires; projet d’AAC

 

Énoncés de recherches/projets

  • Mise au point d’une nouvelle génération de génomes de référence pour le lin

  • Identification des QTL et exploration génomique en vue de déterminer les caractéristiques importantes, en particulier au chapitre du rendement des semences et de la résistance aux maladies, du blé et du lin

  • Mise au point d’une stratégie de développement génomique en vue de maximiser l’exactitude des prévisions et diminuer le coût de la sélection en réduisant le nombre de marqueurs

  • Conception d’outils et de bases de données bio-informatiques pour faciliter l’analyse de grandes quantités de données génomiques et phénotypiques, ainsi que l’exploration génomique.

Prix et études

  • Ph. D., Génétique et amélioration des végétaux, Université agricole de Nanjing, 1989

  • M.Sc., Génétique et amélioration des végétaux (génétique statistique), Université agricole de Nanjing, 1985

  • B.Sc., Sciences informatiques, Université du Manitoba, 1999

  • B.Sc., Agronomie, Université agricole du Sichuan, 1982

Principales publications

  1. You FM, Cloutier S (2023) Multi-trait multi-model QTL mapping strategies in flax. Proc 30th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, Jan 13-18 (Oral presentation)

    2023 - Consulter les détails de la publication

  2. Vasudevan A, Zheng C, Ens J, Pozniak CJ, You FM, Cloutier S (2023) SHW × elite wheat backcross introgression lines: Is there any bias in retention of SHW genome fraction during pre-breeding? Proc 30th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, Jan 13-18, PO0521 (poster)

    2023 - Consulter les détails de la publication

  3. Cloutier S, Zheng C, Rashid K, Molina O, Edwards T, Lévesque-Lemay, Froese S, Jackle K, House M, Young L, Booker H, Ta’ran B, You F (2023) Fusarium wilt resistance in flax is controlled by a major gene on chromosome 1. Flax Genomics Workshop, Proc 30th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, Jan 13-18 (oral – invited)

    2023 - Consulter les détails de la publication

  4. Cloutier S, Sertse D, Ravichandran S, Duguid S, Soto-Cerda BJ, You FM (2022) Gene banks for crop improvement under climate change: a case study of flax drought. ProciNorte-NORGEN – Task Force on Genetic Resouces, Nov 15, Virtual (oral – invited)

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  5. Cloutier S, Fedak G, Fatima F, Bartaula S, McCallum B, Henriquez MA, Blackwell B, Aboukhaddour R, Foster A, Hiebert C, Humphreys G, McCartney C, Pozniak C, You F (2022) Tapping into wild relatives to improve wheat. ProciNorte Disease Task Force Webinars - Wheat & Grapes: Mitigating the effects brought on by climate change, Sept 13 & 15, Virtual (oral – invited)

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  6. Khadka B, Lévesque-Lemay M, Edwards T, Zheng C, Ens J, Chawla HS, You FM, Pozniak CJ, Cloutier S (2022) Transcriptome analysis and annotation of multiple Aegilops genomes. 2nd International Wheat Congress, Beijing, China, Sept 12-16 (e-poster)

    2022 - Consulter les détails de la publication

  7. Cloutier S, Fedak G, Fatima F, Bartaula S, McCallum B, Henriquez MA, Blackwell B, Aboukhaddour R, Foster A, Hiebert C, Humphreys G, Mccartney C, Pozniak C, You F (2022) Wheat Pre-breeding: the struggle(s) and potential. Proc. 37th Plant Sciences Graduate Students’ Symposium 2022, March 4-5, Virtual (oral)

    2022 - Consulter les détails de la publication

  8. Cloutier S, Fedak G, Fatima F, Bartaula S, McCallum B, Henriquez MA, Blackwell B, Aboukhaddour R, Foster A, Hiebert C, Humphreys G, McCartney C, Pozniak C, You F (2021) The challenges and promises of pre-breeding. Can Soc Plant Biol – Eastern Regional Meeting. Virtual, Nov 27 (oral keynote plenary)

    2021 - Consulter les détails de la publication

  9. Suo, R.Z., Mwaniki, A., Zheng, C.F., Jia, B., You, F.M., Conner, R.L., Xu, W.1 and Hou, A. QTL identification of seed hardness traits in a diverse genetic panel of common bean (Phaseolus vulgaris). Poster presentation. Bean Improvement Cooperative Biennial Meeting (Virtual), November 2-3, 2021.

    2021 - Consulter les détails de la publication

  10. Xu, W., Tucker, J.R., Bekele, W.A., You, F.M., Fu, Y.B., Khanal, R., Yao, Z., Singh, J., Boyle, B., Beattie, A.D., Belzile, F., Mascher, M., Tinker, N.A., Badea, A. (2021). Genome assembly of the canadian two-row malting barley cultivar AAC synergy. G3: Genes, Genomes, Genetics, [online] 11(4), http://dx.doi.org/10.1093/g3journal/jkab031

    2021 - Consulter les détails de la publication

  11. Sertse, D., You, F.M., Ravichandran, S., Soto-Cerda, B.J., Duguid, S., Cloutier, S. (2021). Loci harboring genes with important role in drought and related abiotic stress responses in flax revealed by multiple GWAS models. Theoretical and Applied Genetics (TAG), [online] 134(1), 191-212. http://dx.doi.org/10.1007/s00122-020-03691-0

    2021 - Consulter les détails de la publication

  12. Khan, N., You, F.M., Datla, R., Ravichandran, S., Jia, B., Cloutier, S. (2020). Genome-wide identification of ATP binding cassette (ABC) transporter and heavy metal associated (HMA) gene families in flax (Linum usitatissimum L.). BMC Genomics, [online] 21(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12864-020-07121-9

    2020 - Consulter les détails de la publication

  13. Fatima, F., McCallum, B.D., Pozniak, C.J., Hiebert, C.W., McCartney, C.A., Fedak, G., You, F.M., Cloutier, S. (2020). Identification of New Leaf Rust Resistance Loci in Wheat and Wild Relatives by Array-Based SNP Genotyping and Association Genetics. Frontiers in Plant Science, [online] 11 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2020.583738

    2020 - Consulter les détails de la publication

  14. Yao, Z., You, F.M., N'Diaye, A., Knox, R.E., McCartney, C., Hiebert, C.W., Pozniak, C., Xu, W. (2020). Evaluation of variant calling tools for large plant genome re-sequencing. BMC Bioinformatics, [online] 21(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12859-020-03704-1

    2020 - Consulter les détails de la publication

  15. Lan, S., Zheng, C., Hauck, K., McCausland, M., Duguid, S.D., Booker, H.M., Cloutier, S., You, F.M. (2020). Genomic prediction accuracy of seven breeding selection traits improved by QTL identification in flax. International Journal of Molecular Sciences, [online] 21(5), http://dx.doi.org/10.3390/ijms21051577

    2020 - Consulter les détails de la publication

  16. Fatima F, McCallum B, Hiebert C, McCartney C, Fedak G, Pozniak C, Edwards T, Ravichandran S, You FM, Cloutier S (2020) Single and multi-locus genome-wide association study for leaf rust resistance in cultivated, progenitor and wild wheat. Proc 28th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, Jan 11-15, PO0937

    2020 - Consulter les détails de la publication

  17. Cloutier S, You F, Rashid K, Zheng C, Lam S, Khan N, He L, Xiao X, Yao J, Li P (2020) Insights into genetic structure and genomic prediction of powdery mildew resistance in flax (Linum usitatissimum L.). Proc 28th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, Jan 11-15, PO0499

    2020 - Consulter les détails de la publication

  18. Soto-Cerda, B.J., Cloutier, S., Gajardo, H.A., Aravena, G., Quian, R., You, F.M. (2020). Drought response of flax accessions and identification of quantitative trait nucleotides (QTNs) governing agronomic and root traits by genome-wide association analysis. Molecular Breeding, [online] 40(1), http://dx.doi.org/10.1007/s11032-019-1096-y

    2020 - Consulter les détails de la publication

  19. Sertse, D., You, F.M., Ravichandran, S., Cloutier, S. (2019). The Complex Genetic Architecture of Early Root and Shoot Traits in Flax Revealed by Genome-Wide Association Analyses. Frontiers in Plant Science, [online] 10 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2019.01483

    2019 - Consulter les détails de la publication

  20. Cloutier S, You FM, Soto-Cerda BJ (2019) Linum Genetic Markers, Maps and QTL Discovery. In: Genetics and Genomics of Linum, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models 23, Cullis CA (ed), Springer Nature, Switzerland, Chap 7, doi.org/10.1007/978-3-030-23964-0_7

    2019 - Consulter les détails de la publication

Installation de recherche

960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Affiliations

Professeur invité, Université agricole de Nanjing

Professeur auxiliaire, Université du Manitoba

Language

Anglais

Other languages

Mandarin/Chinese