Frank You

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Chercheur Scientifique

Recherche en génomique et en bio-informatique des cultures, en particulier le blé et le lin. Principaux domaines d’expertise : bio-informatique des végétaux, génétique quantitative et génomique statistique, séquençage génomique, évolution des génomes et conception d’outils logiciels et de bases de données.

Recherche et / ou projets en cours

  • Variantes génétiques et épigénétiques des cultures de céréales canadiennes pour la production et l’analyse fonctionnelle; projet de l’IRDG

  • Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi; projet de la WGRF

  • Caractérisation des gènes de la résistance à la rouille chez le lin; projet de l’ADF

  • Mise au point de variétés et de matériel génétique de haricots secs à maturation précoce pour le Manitoba et l’Ouest canadien; grappe des légumineuses du PCA.

  • Plateformes de préreproduction pour l’amélioration du blé canadien; grappe du blé du PCA

  • Marqueurs génomiques et moléculaires permettant d’identifier les gènes de résistance chez le lin; projet du PCA

  • Projet 4DWheat : diversité, découverte, design et diffusion; projet de Génome Canada et d’AAC

  • Étude de la génomique de l’avoine et de l’orge pour trouver des traits spécifiques et utilitaires; projet d’AAC

 

Énoncés de recherches/projets

  • Mise au point d’une nouvelle génération de génomes de référence pour le lin

  • Identification des QTL et exploration génomique en vue de déterminer les caractéristiques importantes, en particulier au chapitre du rendement des semences et de la résistance aux maladies, du blé et du lin

  • Mise au point d’une stratégie de développement génomique en vue de maximiser l’exactitude des prévisions et diminuer le coût de la sélection en réduisant le nombre de marqueurs

  • Conception d’outils et de bases de données bio-informatiques pour faciliter l’analyse de grandes quantités de données génomiques et phénotypiques, ainsi que l’exploration génomique.

Prix et études

  • Ph. D., Génétique et amélioration des végétaux, Université agricole de Nanjing, 1989

  • M.Sc., Génétique et amélioration des végétaux (génétique statistique), Université agricole de Nanjing, 1985

  • B.Sc., Sciences informatiques, Université du Manitoba, 1999

  • B.Sc., Agronomie, Université agricole du Sichuan, 1982

Principales publications

  1. Fatima F, McCallum B, Hiebert C, McCartney C, Fedak G, Pozniak C, Edwards T, Ravichandran S, You FM, Cloutier S (2020) Single and multi-locus genome-wide association study for leaf rust resistance in cultivated, progenitor and wild wheat. Proc 28th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, Jan 11-15, PO0937

    2020 - Consulter les détails de la publication

  2. Cloutier S, You F, Rashid K, Zheng C, Lam S, Khan N, He L, Xiao X, Yao J, Li P (2020) Insights into genetic structure and genomic prediction of powdery mildew resistance in flax (Linum usitatissimum L.). Proc 28th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, Jan 11-15, PO0499

    2020 - Consulter les détails de la publication

  3. Cloutier S, You FM, Soto-Cerda BJ (2019) Linum Genetic Markers, Maps and QTL Discovery. In: Genetics and Genomics of Linum, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models 23, Cullis CA (ed), Springer Nature, Switzerland, Chap 7, doi.org/10.1007/978-3-030-23964-0_7

    2019 - Consulter les détails de la publication

  4. You FM, Cloutier S (2019) Assembly of the Flax Genome into Chromosomes. In: Genetics and Genomics of Linum, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models 23, Cullis CA (ed), Springer Nature, Switzerland, Chap 5, doi.org/10.1007/978-3-030-23964-0_5

    2019 - Consulter les détails de la publication

  5. Fatima F, Edwards T, Hiebert C, McCartney C, McCallum B, Henriquez MA, Humphreys G, Cao W, Fedak G, You FM, Cloutier S (2019) Diversity analysis of wheat and wild relatives using the wheat 90K Infinium array. Proc 1st International Wheat Congress, Saskatoon, July 21-27, P217 (poster)

    2019 - Consulter les détails de la publication

  6. Young LW, Trouve J-P, Speck A, Kutcher R, Rashid KY, You FM, Cloutier S and Booker HM. Mapping rust and powdery mildew resistant genes in flax. XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019 (PO0871).

    2019 - Consulter les détails de la publication

  7. Jia G, You FM, Cloutier S, Deyholos MK, and Booker H. The flax breeding database (FlaxDB). XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019. PE1082

    2019 - Consulter les détails de la publication

  8. Bruskiewich RM, Caron CT, Kucheran LS, Jia G, Young LW, Staton SE, Légaré J-S, Wang Z, Huellas-Bruskiewicz K, Warfield A, Marden E, Bett K, Booker HM, Cloutier S, You FM and Rieseberg LH. The DivSeek Canada Initiative: out of the starting gate. XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019 (PO0035)

    2019 - Consulter les détails de la publication

  9. Soto-Cerda, B.J., Cloutier, S., Quian, R., Gajardo, H.A., Olivos, M., You, F.M. (2018). Genome-wide association analysis of mucilage and hull content in flax (Linum usitatissimum l.) seeds, 19(10), http://dx.doi.org/10.3390/ijms19102870

    2018 - Consulter les détails de la publication

  10. You, F.M., Xiao, J., Li, P., Yao, Z., Jia, G., He, L., Kumar, S., Soto-Cerda, B., Duguid, S.D., Booker, H.M., Rashid, K.Y., Cloutier, S. (2018). Genome-wide association study and selection signatures detect genomic regions associated with seed yield and oil quality in flax, 19(8), http://dx.doi.org/10.3390/ijms19082303

    2018 - Consulter les détails de la publication

  11. Sandhu, K.S., You, F.M., Conner, R.L., Balasubramanian, P.M., Hou, A. (2018). Genetic analysis and QTL mapping of the seed hardness trait in a black common bean (Phaseolus vulgaris) recombinant inbred line (RIL) population, 38(3), http://dx.doi.org/10.1007/s11032-018-0789-y

    2018 - Consulter les détails de la publication

  12. You FM, Rashid K, Cloutier S, Chen W, Luo M-C, Zhu (2018) High-quality genome sequences of cultivated (Linum usitatissimum) and wild (L. bienne) flax. Proc 26th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P0911 (poster)

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  13. Jorden M, You FM (2018) Improved markers for a pre-harvest sprouting QTL on wheat chromosome 3B. Proc 26th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P1042 (poster)

    2018 - Consulter les détails de la publication

  14. Zhu S, Wang L, You FM, Rodriguez JC, Deal KR, Chen L, Li J, Chakraborty S, Balan B, Jiang CZ, Brown PJ, Leslie CA, Aradhya M, Dandekar AM, Kluepfel DA, Dvorak J, LuoM-C (2017) A novel and efficient approach for phasing highly heterozygous plant genomes. Proc 26th Plant & Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P0193 (poster)

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  15. Bruskiewich RM, Bett K, Booker HM, Cloutier S, You FM, Evan Staton S, Warfield A, Warfield E, Rieseberg LH (2018) Divseek Canada Initiative. Proc 26th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, W314 (workshop oral talk)

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  16. Luo, M.C., Gu, Y.Q., Puiu, D., Wang, H., Twardziok, S.O., Deal, K.R., Huo, N., Zhu, T., Wang, L., Wang, Y., McGuire, P.E., Liu, S., Long, H., Ramasamy, R.K., Rodriguez, J.C., Van Sonny, L., Yuan, L., Wang, Z., Xia, Z., Xiao, L., Anderson, O.D., Ouyang, S., Liang, Y., Zimin, A.V., Pertea, G., Qi, P., Bennetzen, J.L., Dai, X., Dawson, M.W., Müller, H.G., Kugler, K., Rivarola-Duarte, L., Spannagl, M., Mayer, K.F.X., Lu, F.H., Bevan, M.W., Leroy, P., Li, P., You, F.M., Sun, Q., Liu, Z., Lyons, E., Wicker, T., Salzberg, S.L., Devos, K.M., Dvoák, J. (2017). Genome sequence of the progenitor of the wheat D genome Aegilops tauschii, 551(7681), 498-502. http://dx.doi.org/10.1038/nature24486

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  17. You FM, Jia G, Xiao J, Duguid D, Rashid K, Booker H, Cloutier S (2017) Genetic variability of 27 traits in a core collection of flax (Linum usitatissimum L.). Frontiers in Plant Science, 8:1636.

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  18. You FM, Rashid K, Yao Z, Cloutier S (2017) Genome-wide association study for Fusarium wilt resistance in flax (Linum usitatissimum L.). Joint Meeting of Canadian Phytopathological Society and Canadian Society of Agronomy, Winnipeg, MB, June 18-22 (poster).

    2017 - Consulter les détails de la publication

  19. Sandhu K, You FM, Conner R, Balasubramanian P, Hou A (2018) QTL mapping of seed hardness trait in common bean (Phaseolus vulgaris). Joint Annual Meeting of Canadian Phytopathological Society and Canadian Society of Agronomy, Winnipeg, MB, June 18-22 (poster).

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  20. Ravichandran S, You FM, Rashid KY, Young L, Booker HM, Cloutier S (2017) Structural organization and haplotypes of rust resistance genes in flax. Joint Meeting Canadian Phytopathological Society and Canadian Society of Agronomy, Winnipeg, June 18-22, P3 (poster)

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Installation de recherche

960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Affiliations

Professeur invité, Université agricole de Nanjing

Professeur auxiliaire, Université du Manitoba

Language

Anglais

Other languages

Mandarin/Chinese