Frank You

Chercheur Scientifique

Recherche en génomique et en bio-informatique des cultures, en particulier le blé et le lin. Principaux domaines d’expertise : bio-informatique des végétaux, génétique quantitative et génomique statistique, séquençage génomique, évolution des génomes et conception d’outils logiciels et de bases de données.

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Ottawa, Ontario, Canada

Recherche et / ou projets en cours

Variantes génétiques et épigénétiques des cultures de céréales canadiennes pour la production et l’analyse fonctionnelle; projet de l’IRDG
Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi; projet de la WGRF
Caractérisation des gènes de la résistance à la rouille chez le lin; projet de l’ADF
Mise au point de variétés et de matériel génétique de haricots secs à maturation précoce pour le Manitoba et l’Ouest canadien; grappe des légumineuses du PCA.
Plateformes de préreproduction pour l’amélioration du blé canadien; grappe du blé du PCA
Marqueurs génomiques et moléculaires permettant d’identifier les gènes de résistance chez le lin; projet du PCA
Projet 4DWheat : diversité, découverte, design et diffusion; projet de Génome Canada et d’AAC
Étude de la génomique de l’avoine et de l’orge pour trouver des traits spécifiques et utilitaires; projet d’AAC

Énoncés de recherches/projets

Mise au point d’une nouvelle génération de génomes de référence pour le lin
Identification des QTL et exploration génomique en vue de déterminer les caractéristiques importantes, en particulier au chapitre du rendement des semences et de la résistance aux maladies, du blé et du lin
Mise au point d’une stratégie de développement génomique en vue de maximiser l’exactitude des prévisions et diminuer le coût de la sélection en réduisant le nombre de marqueurs
Conception d’outils et de bases de données bio-informatiques pour faciliter l’analyse de grandes quantités de données génomiques et phénotypiques, ainsi que l’exploration génomique.

Prix et études

Ph. D., Génétique et amélioration des végétaux, Université agricole de Nanjing, 1989
M.Sc., Génétique et amélioration des végétaux (génétique statistique), Université agricole de Nanjing, 1985
B.Sc., Sciences informatiques, Université du Manitoba, 1999
B.Sc., Agronomie, Université agricole du Sichuan, 1982

Liens additionnels

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Principales publications

Sertse, D., You, F.M., Ravichandran, S., Cloutier, S. (2019). The Complex Genetic Architecture of Early Root and Shoot Traits in Flax Revealed by Genome-Wide Association Analyses. Frontiers in Plant Science, [online] 10 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2019.01483
2019 - Consulter les détails de la publication
Cloutier S, You FM, Soto-Cerda BJ (2019) Linum Genetic Markers, Maps and QTL Discovery. In: Genetics and Genomics of Linum, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models 23, Cullis CA (ed), Springer Nature, Switzerland, Chap 7, doi.org/10.1007/978-3-030-23964-0_7
2019 - Consulter les détails de la publication
You FM, Cloutier S (2019) Assembly of the Flax Genome into Chromosomes. In: Genetics and Genomics of Linum, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models 23, Cullis CA (ed), Springer Nature, Switzerland, Chap 5, doi.org/10.1007/978-3-030-23964-0_5
2019 - Consulter les détails de la publication
Sertse, D., You, F.M., Ravichandran, S., Cloutier, S. (2019). The genetic structure of flax illustrates environmental and anthropogenic selections that gave rise to its eco-geographical adaptation. Molecular Phylogenetics and Evolution, [online] 137 22-32. http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2019.04.010
2019 - Consulter les détails de la publication
Fatima F, Edwards T, Hiebert C, McCartney C, McCallum B, Henriquez MA, Humphreys G, Cao W, Fedak G, You FM, Cloutier S (2019) Diversity analysis of wheat and wild relatives using the wheat 90K Infinium array. Proc 1st International Wheat Congress, Saskatoon, July 21-27, P217 (poster)
2019 - Consulter les détails de la publication
Jia G, You FM, Cloutier S, Deyholos MK, and Booker H. The flax breeding database (FlaxDB). XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019. PE1082
2019 - Consulter les détails de la publication
Bruskiewich RM, Caron CT, Kucheran LS, Jia G, Young LW, Staton SE, Légaré J-S, Wang Z, Huellas-Bruskiewicz K, Warfield A, Marden E, Bett K, Booker HM, Cloutier S, You FM and Rieseberg LH. The DivSeek Canada Initiative: out of the starting gate. XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019 (PO0035)
2019 - Consulter les détails de la publication
Young LW, Trouve J-P, Speck A, Kutcher R, Rashid KY, You FM, Cloutier S and Booker HM. Mapping rust and powdery mildew resistant genes in flax. XXVII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 12-16, 2019 (PO0871).
2019 - Consulter les détails de la publication
He, L., Xiao, J., Rashid, K.Y., Yao, Z., Li, P., Jia, G., Wang, X., Cloutier, S., You, F.M. (2019). Genome-wide association studies for pasmo resistance in flax (Linum usitatissimum L.). Frontiers in Plant Science, [online] 9 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2018.01982
2019 - Consulter les détails de la publication
He, L., Xiao, J., Rashid, K.Y., Jia, G., Li, P., Yao, Z., Wang, X., Cloutier, S., You, F.M. (2019). Evaluation of genomic prediction for Pasmo resistance in flax. International Journal of Molecular Sciences, [online] 20(2), http://dx.doi.org/10.3390/ijms20020359
2019 - Consulter les détails de la publication
Cloutier, S., Ravichandran, S., Edwards, T., McCallum, B., Henriquez, M.A., Humphreys, G., Cao, W., Fedak, G., Pozniak, C., You, F.M. 2018. Identifying and transferring genetic diversity from the wild to improve wheat. 9th Canadian Workshop on FHB & 4th Canadian Wheat Symposium, November 19–22, 2018 Winnipeg, Manitoba.
2018 - Consulter les détails de la publication
Soto-Cerda, B.J., Cloutier, S., Quian, R., Gajardo, H.A., Olivos, M., You, F.M. (2018). Genome-wide association analysis of mucilage and hull content in flax (Linum usitatissimum l.) seeds. International Journal of Molecular Sciences, [online] 19(10), http://dx.doi.org/10.3390/ijms19102870
2018 - Consulter les détails de la publication
Zhao, K., Xiao, J., Liu, Y., Chen, S., Yuan, C., Cao, A., You, F.M., Yang, D., An, S., Wang, H., Wang, X. (2018). Rht23 (5Dq′) likely encodes a Q homeologue with pleiotropic effects on plant height and spike compactness. Theoretical and Applied Genetics (TAG), [online] 131(9), 1825-1834. http://dx.doi.org/10.1007/s00122-018-3115-5
2018 - Consulter les détails de la publication
You, F.M., Xiao, J., Li, P., Yao, Z., Jia, G., He, L., Kumar, S., Soto-Cerda, B., Duguid, S.D., Booker, H.M., Rashid, K.Y., Cloutier, S. (2018). Genome-wide association study and selection signatures detect genomic regions associated with seed yield and oil quality in flax. International Journal of Molecular Sciences, [online] 19(8), http://dx.doi.org/10.3390/ijms19082303
2018 - Consulter les détails de la publication
Dvorak, J., Wang, L., Zhu, T., Jorgensen, C.M., Deal, K.R., Dai, X., Dawson, M.W., Müuller, H.G., Luo, M.C., Ramasamy, R.K., Dehghani, H., Gu, Y.Q., Gill, B.S., Distelfeld, A., Devos, K.M., Qi, P., You, F.M., Gulick, P.J., McGuire, P.E. (2018). Structural variation and rates of genome evolution in the grass family seen through comparison of sequences of genomes greatly differing in size. Plant Journal, [online] 95(3), 487-503. http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13964
2018 - Consulter les détails de la publication
You, F.M., Xiao, J., Li, P., Yao, Z., Jia, G., He, L., Zhu, T., Luo, M.C., Wang, X., Deyholos, M.K., Cloutier, S. (2018). Chromosome-scale pseudomolecules refined by optical, physical and genetic maps in flax. Plant Journal, [online] 95(2), 371-384. http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13944
2018 - Consulter les détails de la publication
Sandhu, K.S., You, F.M., Conner, R.L., Balasubramanian, P.M., Hou, A. (2018). Genetic analysis and QTL mapping of the seed hardness trait in a black common bean (Phaseolus vulgaris) recombinant inbred line (RIL) population. Molecular Breeding, [online] 38(3), http://dx.doi.org/10.1007/s11032-018-0789-y
2018 - Consulter les détails de la publication
You FM, Rashid K, Cloutier S, Chen W, Luo M-C, Zhu (2018) High-quality genome sequences of cultivated (Linum usitatissimum) and wild (L. bienne) flax. Proc 26th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P0911 (poster)
2018 - Consulter les détails de la publication
Jorden M, You FM (2018) Improved markers for a pre-harvest sprouting QTL on wheat chromosome 3B. Proc 26th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P1042 (poster)
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Zhu S, Wang L, You FM, Rodriguez JC, Deal KR, Chen L, Li J, Chakraborty S, Balan B, Jiang CZ, Brown PJ, Leslie CA, Aradhya M, Dandekar AM, Kluepfel DA, Dvorak J, LuoM-C (2017) A novel and efficient approach for phasing highly heterozygous plant genomes. Proc 26th Plant & Animal Genome Conference, San Diego, CA, January 13-17, P0193 (poster)
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