Profilage du miRNome hépatique bovin et analyse de l’expression différentielle des miARN chez des bouvillons de boucherie ayant des phénotypes d’efficacité alimentaire divergents

Les micro-ARN (miARN) sont de petites molécules d’ARN intervenant dans la régulation de multiples processus biologiques par la modulation de l’expression de leurs gènes cibles. Dans le cadre de la présente étude, nous avons effectué le séquençage global de l’expression des micro-ARN (miRNome) dans les tissus hépatiques de bovins de boucherie afin d’identifier les miARN présentant une expression différentielle (ED) et leurs gènes ciblés liés à l’ingestion alimentaire résiduelle (IAR), une mesure de l’efficacité alimentaire. À un seuil de facteur de variation > 1,5 et un taux de faux positifs < 5 %, nous avons détecté 12 miARN ED (7 régulés positivement et 5 régulés négativement chez les animaux ayant une faible IAR), 18 miARN ED (12 régulés positivement et 6 régulés négativement) et 13 miARN ED (8 régulés positivement et 5 régulés négativement) chez les bouvillons Angus, Charolais et KC, respectivement. La plupart des miARN ED étaient propres à la race, et bta-miR-449a et bta-miR-AB-2 présentaient une expression différentielle chez les trois races. Les gènes cibles prédits des miARN ED identifiés interviennent principalement dans le cycle cellulaire, la mort et la survie des cellules, la signalisation cellulaire, la croissance et la prolifération cellulaires, le transport des protéines, la morphologie des cellules, la signalisation et les interactions entre cellules, le développement des cellules, le transport moléculaire, la modification post-traductionnelle ainsi que le métabolisme des nutriments (lipides, glucides, protéines et acides aminés). Nos résultats donnent un aperçu du miRNome hépatique bovin et de son rôle potentiel dans la régulation moléculaire de l’IAR chez les bovins de boucherie. Les miARN ED et leurs gènes ciblés aideront à identifier des marqueurs d’ADN qui peuvent être utilisés pour sélectionner des bovins de boucherie présentant une efficacité alimentaire accrue.