Dr James T. Tambong

Image James T. Tambong
Chercheur scientifique

Le laboratoire de Dr Tambong travaille sur la taxonomie moléculaire, la phylogénomique, l'identification, la détection, la phylogénétique et la biodiversité des bactéries phytopathogènes et bénéfiques pour l'agriculture (lutte biologique).

Recherche et / ou projets en cours

  • Gestion des collections biologiques d'AAC. Les objectifs de ce projet sont: 1) Soutenir la conservation des collections de banques de gènes vivantes et des collections de référence préservées; 2) Amélioration des technologies de préservation des spécimens de référence ou du matériel génétique vivant; 3) Amélioration de la caractérisation et  exploitations de collection; et 4) soutien aux services nationaux d'identification.
  • Biosystématique des champignons nuisibles et bactéries - Reliant taxonomie et technologie d’omics à la recherche et la réglementation agricoles. L'objectif de ce projet est de relier la taxonomie traditionnelle et basée sur l'ADN en tirant parti des opportunités rendues possibles par les nouvelles technologies génomiques et métabolomiques.
  • Levures et/ou bactéries produisant des caroténoïdes d'importance en biotechnologique. La recherche proposée mènera à l'identification des levures et /ou des souches de bactéries produisant des caroténoïdes naturels comme sous-produits alternatifs de transformation des aliments. Utilisations des sous-produits naturels agricoles / agro-alimentaires réduit les problèmes environnementaux.
  • Surveillance d’un agent pathogène bactérien envahissant (Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis) du maïs à l’aide d’une méthode de séquençage de nouvelle generation.
  • Séquençage de nouvelle génération – génomique et métagénomique d’agents pathogènes fongiques et bactériens justiciables de quarantaine chez les plantes cultivées.
  • Mise au point d’outils métagénomiques d’identification et d’analyse fondés sur les amplicons et ciblant principalement les agents pathogènes réglementés ou à haut risqué.

Énoncés de recherches/projets

Domaines d'expertise :

  • Phytopathogènes bactériens envahissants/justiciables de quarantaine
  • Génomique et Métagénomique des phytobactéries
  • Taxonomie et Détection moléculaire d’agents pathogènes phytobactériens
  • Biodiversité bactérienne dans la santé des sols et la durabilité de l’agriculture
  • Bactéries utiles et pathogènes des céréales et des légumineuses
  • Biopesticides (bioressources)

Prix et études

Education

Ph.D.     Biological Sciences Universiteit Gent, Belgium                                    2000

MSc.       Plant Pathology/Breeding   Alabama A & M University, USA              1994

Ingènieur Agronome    Biotechnology      Université de Dschang, Cameroon   1988

 

Awards and Recognition

(1) 2015 Algonquin College Award of recognition and appreciation for providing IBioTP students with invaluable Canadian work experience;

(2) 2011 American Society for Microbiology, Outstanding Service as an Online Mentor of the ASM Minority Mentoring Program;

(3)  2010  Recipient of the Agriculture and Agri-Food Research Branch Science Achievement Award for research conducted on DNA array technology for detection and quantification of multiple soilborne pathogens under the supervision of Dr. André Lévesque. 

(4) 1996 Award for Outstanding Contribution to Root and Tuber Research project funded by United States Agency for International Development.

Expérience et / ou de travail international

1988 - 1996. Chercheur Scientifique, Institut de recherche agricole pour le développement (IRAD, Cameroun): mener des recherches sur la biotechnologie microbienne et végétale pour améliorer notre compréhension des pathogènes bactériens / fongiques des plantes tropicales dans le cadre d'un projet financé par l'USAID.

Principales publications

  1. Xu, R., Falardeau, J., Tyler, J.A., et Tambong, J.T. (2015). « HybProbes-based real-time PCR assay for specific identification of Streptomyces scabies and Streptomyces europaescabiei, the potato common scab pathogen. », Letters in Applied Microbiology. doi : 10.1111/lam.12522

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  2. Tchagang CF, R. Xu, S. Mehrtash, S. Rahimi, A. Sidibé, X. Li, ESP. Bromfield et J.T. Tambong. 2016. Draft genome sequences of two novel Pseudomonas strains exhibiting differential hypersensitivity reactions on tobacco and corn seedlings. Genome Announc 4(5):e01057-16. doi:10.1128/genomeA.01057-16.

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  3. Khan, I.U.H., Topp, E., Chen, W., Lapen, D.R., Lévesque, C.A., Pintar, K.D.M., Tambong, J.T., Talbot, G., et Wilkes, G.A. (2015). « Assessment of Zoonotic Pathogens in Agroecosystem. », Biodiversity, Bioresources and Collection Science Day, Ottawa Research and Development Center, Agriculture and Agri-Food Canada, Ottawa, ON, Canada, December 1-2, 2015. (Présentation)

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  4. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Topp, E., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. DRDC-RDDC-2015-C148. Final Close-Out Report. (Rapport)

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  5. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. Final Report. 54. http://cradpdf.drdc-rddc.gc.ca/PDFS/unc195/p802330_A1b.pdf. (Rapport)

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  6. Tambong, J.T. (2015). « Specific identification and detection of Pantoea stewartii subsp. stewartii using a membrane-based multi-gene oligonucleotide array. », Canadian Journal of Plant Pathology. doi : 10.1080/07060661.2015.1113442

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  7. Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Cloutier, M., Tambong, J.T., Xu, R., Topp, E., Arts, M.T., Chao, J., Adam, Z., Lévesque, C.A., Lapen, D.R., Villemur, R., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2015). « Arcobacter lanthieri sp. nov., isolated from pig and dairy cattle manure. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM). doi : 10.1099/ijs.0.000318

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  8. Nejjari, M., Xu, R., et Tambong, J.T. (2015). « Detection, identification and differentiation of corn pathogen pantoea stewartii subspecies by membrane-based multi-gene oligonucleotide array. », Jurnal Teknologi, 77(24), p. 123-129. doi : 10.11113/jt.v77.6719

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  9. Adam, Z., Chen, Q., Xu, R., Diange, A.E., Bromfield, E.S.P., et Tambong, J.T. (2015). « Draft Genome Sequence of Pseudomonas simiae Strain 2-36, an In Vitro Antagonist of Rhizoctonia solani and Gaeumannomyces graminis. », Genome Announcements, 3(1: e01534-14). doi : 10.1128/genomeA.01534-14

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  10. Yuan, K., Cullis, J., Lévesque, C.A., Tambong, J.T., Chen, W., Lewis, C.T., De Boer, S.H., et Li, X. (2015). « Draft genome sequences of Ralstonia solanacearum race 3 biovar 2 strains with different temperature adaptations. », Genome Announcements, 3(4: e00815-15), p. 1-2. doi : 10.1128/genomeA.00815-15

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  11. Tambong, J.T., Xu, R., Adam, Z., Cott, M., Rose, K., Reid, L.M., Daayf, F., Brière, S.C., et Bilodeau, G.J. (2015). « Draft genome sequence of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis strain DOAB 397, isolated from an infected field corn plant in Manitoba, Canada. », Genome Announcements, 3(4: e00768-15), p. 1-2. doi : 10.1128/genomeA.00768-15

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  12. Yuan, K., Li, X., Adam, Z., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., Chen, W., Lewis, C.T., et De Boer, S.H. (2014). « Comparative genomics for re-classification of Pectobacterium wasabiae. », 3rd International Workshop on Erwinia, Shanghai, China, June 8-13, 2014, p. 27-28. (Résumé)

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  13. Tambong, J.T., Adam, Z., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Chen, W., Khan, I.U.H., Bromfield, E.S.P., et Xu, R. (2014). « Comparative genomics of Pantoeastewartii subspecies and development of a TaqManReal-Time PCR assay for specific detection of P. stewartii subsp.stewartii. », 13th International Conference of Plant Pathogenic Bacteria, Shanghai, China, June 8-13, 2014, p. 34. (Résumé)

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  14. Khan, I.U.H., Cloutier, M., Topp, E., Lapen, D.R., Lévesque, C.A., Edge, T.A., Tambong, J.T., Talbot, G., et Wilkes, G.A. (2014). « Quantitative Detection and Identification of Arcobacter, Campylobacter and Helicobacter Species in a Canadian Agricultural Watershed. », XVIth International Congress of Virology - International Union of Microbiological Societies (IUMS 2014), July 27 - August 1, 2014, Montréal, Québec, Canada, July 27-August 1, 2014.

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  15. Adam, Z., Tambong, J.T., Chen, Q., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., et Xu, R. (2014). « Draft Genome Sequence of Pseudomonas sp. 2-92, a biological control strain isolated from a field plot under long-term mineral fertilization. », Genome Announcements, 2(1: e01121-13). doi : 10.1128/genomeA.01121-13

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  16. Li, X., Yuan, K., Nie, J., Adam, Z., Tambong, J.T., Chen, W., Lewis, C.T., De Boer, S.H., et Lévesque, C.A. (2014). « Comparative Genomics Approaches for Detection and Identification of Ralstonia solanacearum race 3 bv 2. », 13th International Conference of Plant Pathogenic Bacteria, Shanghai, China, June 8-13, 2014, Oral presentation. (Résumé)

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  17. Yuan, K., Li, X., Adam, Z., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., Chen, W., Lewis, C.T., et De Boer, S.H. (2014). « Draft genome sequence of Pectobacterium wasabiae strain CFIA1002. », 3rd International Workshop on Erwinia, Shanghai, China, June 8-13, 2014.

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  18. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequence of Arcobacter cibarius Strain LMG21996{SUP}T{/SUP} isolated from broiler carcasses. », Genome Announcements, 2(1), p. e00034-14. doi : 10.1128/genomeA.00034-14

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  19. Tambong, J.T., Xu, R., Kaneza, C.A., et Nshogozabahizi, J.C. (2014). « An In-depth Analysis of a Multilocus Phylogeny Identifies leuS As a Reliable Phylogenetic Marker for the Genus Pantoea. », Evolutionary Bioinformatics, 10, p. 115-125. doi : 10.4137/EBO.S15738

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  20. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Tambong, J.T., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequences of three Arcobacter strains of pig and dairy cattle manure origin. », Genome Announcements, 2(3:e00377-14). doi : 10.1128/genomeA.00377-14

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Installation de recherche

960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Affiliations

  • Professeur affilié, Département des sciences végétales, Université du Manitoba, Manitoba, Canada
  • Membre, comité de bactériologie de l'American Phytopathological Society (APS)
  • Membre, Comité de génétique évolutive et génomique (APS)
  • Membre, Comité de détection des phytopathogènes et des maladies (APS)
  • Membre, comité consultatif du Baccalauréat spécialisé en biotechnologie à La Cité Collégiale, Ottawa, Ontario, Canada.
  • Rédacteur associé, Bacteria and Phytoplasmas, Canadian Journal of Plant Pathology
  • Membre, American Phytopathological Society (ancien président, Tropical Plant Pathology Committee)
  • Membre, American Society for Microbiology (récipiendaire du prix ASM Online Minority Mentoring Award, 2011)
  • Membre, Société canadienne de phytopathologie

Language

Anglais
Français