A comparison of the molecular organization of genomic regions associated with resistance to common bacterial blight in two Phaseolus vulgaris genotypes

Chez Phaseolus vulgaris, la résistance à la graisse bactérienne commune causée par le Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli est conditionnée par plusieurs loci situés sur différents chromosomes. Des travaux antérieurs portant sur le cultivar OAC-Rex, un haricot d’origine mésoaméricaine résistant à la graisse bactérienne commune, ont permis de repérer deux loci de résistance, associés aux marqueurs moléculaires Pv-CTT001 et SU91, sur les chromosomes 4 et 8, respectivement. La résistance à la graisse bactérienne commune résulterait d’un croisement interspécifique avec le Phaseolus acutifolius chez les ancêtres du cultivar OAC-Rex. Les travaux de séquençage du génome d’OAC-Rex que nous menons actuellement nous ont donné l’occasion de comparer les régions génomiques associées à la résistance à la graisse bactérienne commune d’OAC-Rex avec la séquence génomique v1.0 de la lignée G19833 du P. vulgaris, un haricot à grosses graines d’origine andine présumé sensible à la graisse bactérienne commune. De plus, nous avons comparé les régions génomiques renfermant le SAP6, un marqueur situé sur le chromosome 10 et associé à la résistance à la graisse bactérienne commune provenant du P. vulgaris. Ces analyses ont indiqué la forte conservation du contenu génique entre la lignée G19833 et le cultivar OAC-Rex dans les régions étudiées (> 80 %). Toutefois, 59 gènes propres au cultivar OAC‑Rex ont été identifiés, les homologues des gènes de résistance (10 gènes identifiés) constituant le groupe le plus important. Deux gènes propres au cultivar OAC-Rex, situés dans le QTL de résistance SU91, une homologie avec des EST de P. acutifolius et pourraient être des sources de résistance à la graisse bactérienne commune. Lorsque l’assemblage de la séquence génomique du cultivar OAC-Rex sera terminé, nous pensons que d’autres comparaisons avec le génome de la lignée G19833 nous permettront de mieux comprendre la résistance à la graisse bactérienne commune chez le haricot.