Dr. Sarah Hambleton

Chercheuse scientifique

Domaines d'expertise:

• études en systématique des champignons de la rouille et du charbon des plantes cultivées et des mauvaises herbes en vue d'améliorer les systèmes d'identification et d'enrichir les bilans de biodiversité
• élaboration de bases de données de séquençage d'ADN pour les champignons de la rouille et du charbon dans les collections nouvelles et les spécimens d'herbier
• identification de marqueurs moléculaires spécifiques aux espèces
• détection rapide et surveillance des champignons pathogènes des plantes à haut risque

Recherche et / ou projets en cours

  • Biosystématique des champignons et des bactéries – Pont entre la taxonomie et les sciences « omiques » pour la recherche et la réglementation dans le secteur agricole; J-002272; Chefs de projet : Sarah Hambleton, Hai Nguyen; Budgets : 2 495 000 $; Durée : du 1er avril 2019 au 31 mars 2024; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.
  • Agropathogenic fungi in omics big data; J-002216; Chefs de projet: Wen Chen; Budgets: 296,000 $; Durée :  du 1er avril 2019 au 31 mars 2022; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.

Principales publications

  1. Chen, W., Hambleton, S., et Lévesque, C.A. (2015). « Environmental metagenomics for plant pathogen surveillance: the promise and the practice. », Invited Oral Presentation at Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China, September 30, 2015. (Présentation)

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  2. Stielow, J.B., Lévesque, C.A., Seifert, K.A., Meyer, W., Irinyi, L., Smits, D., Renfurm, R., Verkley, G.J.M., Groenewald, M., Chaduli, D., Welti, S., Lesage-Meessen, L., Favel, A., Al-Hatmi, A.M.S., Damm, U., Yilmaz, N., Houbraken, J.A.M.P., Lombard, L., Quaedvlieg, W., Binder, M., Vaas, L.A.I., Vu, K.D., Yurkov, A., Begerow, D., Roehl, O., Guerreiro, M., Fonseca, A., Samerpitak, k., Van Diepeningen, A.D., Dolatabadi, S., Moreno, L.F., Casaregola, S., Jacques, N., Roscini, L., Egidi, E., Bizet, C., Garcia-Hermoso, D., Martin, M., Deng, S., Groenewald, J.Z., Boekhout, T., De Beer, Z.W., Barnes, D.I., Duong, T.A., Wingfield, M.J., de Hoog, G.S., Crous, P.W., Lewis, C.T., Hambleton, S., Moussa, T.A.A., Al-Zahrani, H.S., Almaghrabi, O.A., Louis-Seize, G.W., Assabgui, R., McCormick, W.A., Omer, G., Dukik, K., Cardinali, G., Eberhardt, U., Mallet, S., de Vries, M., et Robert, V.A. (2015). « One fungus, which genes? Development and assessment of universal primers for potential secondary fungal DNA barcodes. », Persoonia, 35, p. 242-263. doi : 10.3767/003158515X689135

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  3. Mulvey, R.L. et Hambleton, S. (2015). « Stem rust of highbush-cranberry (Viburnum edule) caused by Puccinia linkii near Juneau, Alaska. », Plant Disease, 99(6), p. 893.

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  4. Liu, M., McCabe, E., Chapados, J.T., Carey, J., Wilson, S.K., Tropiano, R., Redhead, S.A., Lévesque, C.A., et Hambleton, S. (2015). « Detection and identification of selected cereal rust pathogens by TaqMan® real-time PCR. », Canadian Journal of Plant Pathology, 37(1), p. 92-105. doi : 10.1080/07060661.2014.999123

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  5. Rioux, S., Mimee, B., Gagnon, A.-È., et Hambleton, S. (2015). « First report of stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) on wheat in Quebec, Canada. », Phytoprotection, 95(1), p. 7-9. doi : 10.7202/1028400ar

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  6. Hambleton, S., Eggertson, Q.A., Edwards, T., Barasubiye, T., Redhead, S.A., et Lévesque, C.A. (2014). « DNA-barcoding herbarium specimens of obligate fungal pathogens – targeting the gaps in reference databases. », 10th International Mycological Conference (IMC10), Bangkok, Thailand, August 3-8, 2014. (Affiche)

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  7. Hambleton, S., Temple, K., et Liu, M. (2014). « Taxonomy and DNA sequence variation of the rust fungi infecting four prairie grass species. », APS-CPS Joint Meeting, Hilton Minneapolis, Minneapolis, MN, USA, August 9-13, 2014. (Affiche)

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  8. Hambleton, S., Chen, W., Chapados, J.T., Lewis, C.T., et Lévesque, C.A. (2014). « Application of NGS technology in fungal pathogen detection and challenges in identification at species level. », 10th International Mycological Conference (IMC10), Bangkok, Thailand, August 3-8, 2014, Invited oral presentation.

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  9. Kesanakurti, P., Richards, L., Gerdis, S., et Hambleton, S. (2014). « Developing a DNA-based toolkit for detection and identification of wheat rust pathogens. », APS-CPS Joint Meeting, Hilton Minneapolis, Minneapolis, MN, USA, August 9-13, 2014. (Affiche)

    2014 - View publication details

  10. Seifert, K.A., Hambleton, S., et les autres (2014). « Finding needles in haystacks: linking scientific names, reference specimens and molecular data for Fungi. », Database: The Journal of Biological Databases and Curation, 2014(bau061), p. 1-21. doi : 10.1093/database/bau061

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  11. Lewis, C.T., Chen, W., Zhang, N., El-Kayssi, N., Fung, S., Diarra, M.S., Bilkhu, S., Hambleton, S., et Lévesque, C.A. (2013). « Developing an integrated bioinformatics platform to support real-time monitoring of agricultural environments. », 21st Annual Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Berlin, Germany, July 19-23, 2013.

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  12. Malloch, D., Sigler, L., et Hambleton, S. (2013). « Leuconeurospora capsici comb. nov. and Leuconeuorspora polypaeciloides sp. nov. - New Species Name registration. », Index Fungorum, 20.

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  13. Ordoñez, M.E., Vivvanco, C.E., Hambleton, S., et Barnes, C.W. (2013). « Puccinia on wheat and other Poaceae in the Ecuadorian highlands. », Phytopathology, 103(Suppl.2:S2), p. 108. (Résumé)

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  14. Kesanakurti, P., Setia, R., Temple, K., Hambleton, S., Lévesque, C.A., et Lewis, C.T. (2013). « Genome data mining and diagnostic marker development of Tilletia indica for Agri-food system detection screening. », Phytopathology, 103(Suppl.2:S2), p. 73. (Résumé)

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  15. Sigler, L., Hambleton, S., et Paré, J.A. (2013). « Ophidiomyces gen. nov. and Ophidiomyces ophiodiicola comb. nov. - New Species Name registration. », Index Fungorum, 19.

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  16. Lévesque, C.A., Lewis, C.T., Assabgui, R., McCormick, W.A., Ponovera, E., Hambleton, S., et Seifert, K.A. (2013 internal). « Development of additional DNA barcodes for Fungi based on conserved Pfam families and domains. », 21st Annual Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Berlin, Germany, July 19-23, 2013, Invited oral presentation.

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  17. Fung, S., Rempel, H., Block, G.S., Chen, W., Janzen, T., Lewis, C.T., Zhang, N., El-Kayssi, N., Bilkhu, S., Hambleton, S., Amoako, K.K., Lévesque, C.A., Bach, S.J., Delaquis, P.J., et Diarra, M.S. (2013). « Bacillus species across Canada's agriculture environment: an ecological perspective. », International conference on Bacillus antracis, B. cereus, and B. thurengiensis, Victoria, BC, Canada, September 1-5, 2013, Abstract. (Affiche)

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  18. Sigler, L., Hambleton, S., et Paré, J.A. (2013). « Molecular characterization of reptile pathogens currently known as members of the Chrysosporium anamorph of Nannizziopsis vriesii (CANV) complex and relationship with some human-associated isolates. », Journal of Clinical Microbiology, 51(10), p. 3338-3357. doi : 10.1128/JCM.01465-13

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  19. Shoemaker, R.A., Hambleton, S., et Liu, M. (2013). « Vialaea insculpta revisited. », North American Fungi, 8(10), p. 1-13. doi : 10.2509/naf2013.008.010

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  20. Shoemaker, R.A., Malloch, D., Hambleton, S., et Liu, M. (2013). « A new Vestigium on Abies balsamea. », North American Fungi, 8(9), p. 1-6. doi : 10.2509/naf2013.008.009

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