Dr. Sarah Hambleton

Chercheuse scientifique

Domaines d'expertise:

• études en systématique des champignons de la rouille et du charbon des plantes cultivées et des mauvaises herbes en vue d'améliorer les systèmes d'identification et d'enrichir les bilans de biodiversité
• élaboration de bases de données de séquençage d'ADN pour les champignons de la rouille et du charbon dans les collections nouvelles et les spécimens d'herbier
• identification de marqueurs moléculaires spécifiques aux espèces
• détection rapide et surveillance des champignons pathogènes des plantes à haut risque

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Édifice K.W. Neatby, Ottawa, Ontario, Canada

Recherche et / ou projets en cours

Biosystématique des champignons et des bactéries – Pont entre la taxonomie et les sciences « omiques » pour la recherche et la réglementation dans le secteur agricole; J-002272; Chefs de projet : Sarah Hambleton, Hai Nguyen; Budgets : 2 495 000 $; Durée : du 1er avril 2019 au 31 mars 2024; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.
Agropathogenic fungi in omics big data; J-002216; Chefs de projet: Wen Chen; Budgets: 296,000 $; Durée : du 1er avril 2019 au 31 mars 2022; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.

Principales publications

Hambleton, S., Eggertson, Q.A., et Liu, M. (2015). « The rust pathogens of Rubus in Canada – identification, nomenclature and DNA-barcoding. », Botany 2015, Shaw Convention Center, Edmonton, Alberta, Canada, July 25-29, 2015.
2015 - Consulter les détails de la publication
Stielow, J.B., Lévesque, C.A., Seifert, K.A., Meyer, W., Irinyi, L., Smits, D., Renfurm, R., Verkley, G.J.M., Groenewald, M., Chaduli, D., Welti, S., Lesage-Meessen, L., Favel, A., Al-Hatmi, A.M.S., Damm, U., Yilmaz, N., Houbraken, J.A.M.P., Lombard, L., Quaedvlieg, W., Binder, M., Vaas, L.A.I., Vu, K.D., Yurkov, A., Begerow, D., Roehl, O., Guerreiro, M., Fonseca, A., Samerpitak, k., Van Diepeningen, A.D., Dolatabadi, S., Moreno, L.F., Casaregola, S., Jacques, N., Roscini, L., Egidi, E., Bizet, C., Garcia-Hermoso, D., Martin, M., Deng, S., Groenewald, J.Z., Boekhout, T., De Beer, Z.W., Barnes, D.I., Duong, T.A., Wingfield, M.J., de Hoog, G.S., Crous, P.W., Lewis, C.T., Hambleton, S., Moussa, T.A.A., Al-Zahrani, H.S., Almaghrabi, O.A., Louis-Seize, G.W., Assabgui, R., McCormick, W.A., Omer, G., Dukik, K., Cardinali, G., Eberhardt, U., Mallet, S., de Vries, M., et Robert, V.A. (2015). « One fungus, which genes? Development and assessment of universal primers for potential secondary fungal DNA barcodes. », Persoonia, 35, p. 242-263. doi : 10.3767/003158515X689135
2015 - Consulter les détails de la publication
Mulvey, R.L. et Hambleton, S. (2015). « Stem rust of highbush-cranberry (Viburnum edule) caused by Puccinia linkii near Juneau, Alaska. », Plant Disease, 99(6), p. 893.
2015 - Consulter les détails de la publication
Liu, M., McCabe, E., Chapados, J.T., Carey, J., Wilson, S.K., Tropiano, R., Redhead, S.A., Lévesque, C.A., et Hambleton, S. (2015). « Detection and identification of selected cereal rust pathogens by TaqMan® real-time PCR. », Canadian Journal of Plant Pathology, 37(1), p. 92-105. doi : 10.1080/07060661.2014.999123
2015 - Consulter les détails de la publication
Rioux, S., Mimee, B., Gagnon, A.-È., et Hambleton, S. (2015). « First report of stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) on wheat in Quebec, Canada. », Phytoprotection, 95(1), p. 7-9. doi : 10.7202/1028400ar
2015 - Consulter les détails de la publication
Kesanakurti, P., Richards, L., Gerdis, S., et Hambleton, S. (2014). « Developing a DNA-based toolkit for detection and identification of wheat rust pathogens. », APS-CPS Joint Meeting, Hilton Minneapolis, Minneapolis, MN, USA, August 9-13, 2014. (Affiche)
2014 - Consulter les détails de la publication
Hambleton, S., Eggertson, Q.A., Edwards, T., Barasubiye, T., Redhead, S.A., et Lévesque, C.A. (2014). « DNA-barcoding herbarium specimens of obligate fungal pathogens – targeting the gaps in reference databases. », 10th International Mycological Conference (IMC10), Bangkok, Thailand, August 3-8, 2014. (Affiche)
2014 - Consulter les détails de la publication
Hambleton, S., Temple, K., et Liu, M. (2014). « Taxonomy and DNA sequence variation of the rust fungi infecting four prairie grass species. », APS-CPS Joint Meeting, Hilton Minneapolis, Minneapolis, MN, USA, August 9-13, 2014. (Affiche)
2014 - Consulter les détails de la publication
Hambleton, S., Chen, W., Chapados, J.T., Lewis, C.T., et Lévesque, C.A. (2014). « Application of NGS technology in fungal pathogen detection and challenges in identification at species level. », 10th International Mycological Conference (IMC10), Bangkok, Thailand, August 3-8, 2014, Invited oral presentation.
2014 - Consulter les détails de la publication
Seifert, K.A., Hambleton, S., et les autres (2014). « Finding needles in haystacks: linking scientific names, reference specimens and molecular data for Fungi. », Database: The Journal of Biological Databases and Curation, 2014(bau061), p. 1-21. doi : 10.1093/database/bau061
2014 - Consulter les détails de la publication
Lewis, C.T., Chen, W., Zhang, N., El-Kayssi, N., Fung, S., Diarra, M.S., Bilkhu, S., Hambleton, S., et Lévesque, C.A. (2013). « Developing an integrated bioinformatics platform to support real-time monitoring of agricultural environments. », 21st Annual Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Berlin, Germany, July 19-23, 2013.
2013 - Consulter les détails de la publication
Malloch, D., Sigler, L., et Hambleton, S. (2013). « Leuconeurospora capsici comb. nov. and Leuconeuorspora polypaeciloides sp. nov. - New Species Name registration. », Index Fungorum, 20.
2013 - Consulter les détails de la publication
Ordoñez, M.E., Vivvanco, C.E., Hambleton, S., et Barnes, C.W. (2013). « Puccinia on wheat and other Poaceae in the Ecuadorian highlands. », Phytopathology, 103(Suppl.2:S2), p. 108. (Résumé)
2013 - Consulter les détails de la publication
Kesanakurti, P., Setia, R., Temple, K., Hambleton, S., Lévesque, C.A., et Lewis, C.T. (2013). « Genome data mining and diagnostic marker development of Tilletia indica for Agri-food system detection screening. », Phytopathology, 103(Suppl.2:S2), p. 73. (Résumé)
2013 - Consulter les détails de la publication
Sigler, L., Hambleton, S., et Paré, J.A. (2013). « Ophidiomyces gen. nov. and Ophidiomyces ophiodiicola comb. nov. - New Species Name registration. », Index Fungorum, 19.
2013 - Consulter les détails de la publication
Lévesque, C.A., Lewis, C.T., Assabgui, R., McCormick, W.A., Ponovera, E., Hambleton, S., et Seifert, K.A. (2013 internal). « Development of additional DNA barcodes for Fungi based on conserved Pfam families and domains. », 21st Annual Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and European Conference on Computational Biology (ECCB), Berlin, Germany, July 19-23, 2013, Invited oral presentation.
2013 - Consulter les détails de la publication
Fung, S., Rempel, H., Block, G.S., Chen, W., Janzen, T., Lewis, C.T., Zhang, N., El-Kayssi, N., Bilkhu, S., Hambleton, S., Amoako, K.K., Lévesque, C.A., Bach, S.J., Delaquis, P.J., et Diarra, M.S. (2013). « Bacillus species across Canada's agriculture environment: an ecological perspective. », International conference on Bacillus antracis, B. cereus, and B. thurengiensis, Victoria, BC, Canada, September 1-5, 2013, Abstract. (Affiche)
2013 - Consulter les détails de la publication
Sigler, L., Hambleton, S., et Paré, J.A. (2013). « Molecular characterization of reptile pathogens currently known as members of the Chrysosporium anamorph of Nannizziopsis vriesii (CANV) complex and relationship with some human-associated isolates. », Journal of Clinical Microbiology, 51(10), p. 3338-3357. doi : 10.1128/JCM.01465-13
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Shoemaker, R.A., Hambleton, S., et Liu, M. (2013). « Vialaea insculpta revisited. », North American Fungi, 8(10), p. 1-13. doi : 10.2509/naf2013.008.010
2013 - Consulter les détails de la publication
Shoemaker, R.A., Malloch, D., Hambleton, S., et Liu, M. (2013). « A new Vestigium on Abies balsamea. », North American Fungi, 8(9), p. 1-6. doi : 10.2509/naf2013.008.009
2013 - Consulter les détails de la publication