Dr. Sarah Hambleton

Chercheuse scientifique

Domaines d'expertise:

• études en systématique des champignons de la rouille et du charbon des plantes cultivées et des mauvaises herbes en vue d'améliorer les systèmes d'identification et d'enrichir les bilans de biodiversité
• élaboration de bases de données de séquençage d'ADN pour les champignons de la rouille et du charbon dans les collections nouvelles et les spécimens d'herbier
• identification de marqueurs moléculaires spécifiques aux espèces
• détection rapide et surveillance des champignons pathogènes des plantes à haut risque

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Édifice K.W. Neatby, Ottawa, Ontario, Canada

Recherche et / ou projets en cours

Biosystématique des champignons et des bactéries – Pont entre la taxonomie et les sciences « omiques » pour la recherche et la réglementation dans le secteur agricole; J-002272; Chefs de projet : Sarah Hambleton, Hai Nguyen; Budgets : 2 495 000 $; Durée : du 1er avril 2019 au 31 mars 2024; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.
Agropathogenic fungi in omics big data; J-002216; Chefs de projet: Wen Chen; Budgets: 296,000 $; Durée : du 1er avril 2019 au 31 mars 2022; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.

Principales publications

Liu, M. et Hambleton, S. (2013). « Laying the foundation for a taxonomic review of Puccinia coronata s.l. in a phylogenetic context. », Mycological Progress, 12(1), p. 63-89. doi : 10.1007/s11557-012-0814-1
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Liu, M., Szabo, L.J., Hambleton, S., Anikster, Y., et Kolmer, J.A. (2013). « Molecular phylogenetic relationships of the brown leaf rust fungi on wheat, rye and other grasses. », Plant Disease, 97(11), p. 1408-1417. doi : 10.1094/PDIS-02-13-0152-RE
2013 - Consulter les détails de la publication
Seifert, K.A., Graefenhan, T., Chen, W., Lewis, C.T., Bilkhu, S., Chapados, J.T., Hambleton, S., et Lévesque, C.A. (2012). « Prospects for using quantitative PCR and metagenomics to detect mycotoxigenic fungi without culturing. », MycoRed International Conference, Carleton University, Ottawa, ON, Canada, June 2012.
2012 - Consulter les détails de la publication
Chen, W., Lewis, C.T., Chapados, J.T., Hambleton, S., Seifert, K.A., Temple, K., Biernacka-Larocque, A., Robleh Djama, Z., et Lévesque, C.A. (2012). « Canada-wide spore-trapping network provides effective monitoring of microbial phytopathogens in air and rain samples. », Annual meeting of the American Phytopathological Society, Providence, RI, USA, August 4-8, 2012, In: Phytopathology 102: S4.22.
2012 - Consulter les détails de la publication
Lévesque, C.A., Bilkhu, S., Chapados, J.T., Chen, W., Hambleton, S., Lewis, C.T., Oliver, K., et Seifert, K.A. (2012). « AeroNet: A Canadian spore trapping network monitoring fungi and bacteria with DNA barcodes and next generation sequencing. », The Role of Genomics & Bioinformatics in Protecting Canadians from Microbial Food Safety Risks Workshop, Southway Hotel and Conference Centre, Ottawa, ON, Canada, February 21-22, 2012, Invited oral presentation.
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Rintoul, T.L., Rintoul, T., Lévesque, C.A., Robideau, G.P., Eggertson, Q.A., Rodrigue, N., Chen, W., Spies, C.F.J., Bala, K., de Cock, A.W.A.M., Coffey, M.F., Hamilton, J.P., Hambleton, S., Adhikari, B., et Buell, C.R. (2012). « Molecular diagnosis, identification and phylogeny of Pythium, Phytopythium and related genera. », 4th International Workshop on Phytophthora, Pythium and Phytopythium, College Park, MD, USA, May 21-25, 2012, Invited oral presentation.
2012 - Consulter les détails de la publication
Liu, M. et Hambleton, S. (2012). « Puccinia chunjii, a close relative of the cereal stem rusts revealed by molecular phylogeny and morphological study. », Mycologia, 104(5), p. 1056-1067. doi : 10.3852/11-251
2012 - Consulter les détails de la publication
Schoch, C.L., Seifert, K.A., Huhndorf, S.M., Robert, V.A., Spouge, J.L., Lévesque, C.A., Chen, W., et Fungal Barcoding Consortium, (2012). « Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. », Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS), 109(16), p. 6241-6246. doi : 10.1073/pnas.1117018109
2012 - Consulter les détails de la publication
Gorzelak, M.A., Hambleton, S., et Massicotte, H.B. (2012). « Community structure of ericoid mycorrhizas and root-associated fungi of Vaccinium membranaceum across an elevation gradient in the Canadian Rocky Mountains. », Fungal Ecology, 5(1), p. 36-45. doi : 10.1016/j.funeco.2011.08.008
2012 - Consulter les détails de la publication
Hambleton, S., Chen, W., Lewis, C.T., Bilkhu, S., Chapados, J.T., Oliver, K., Tenuta, A.U., et Lévesque, C.A. (2011). « AeroNet Canada: Profiling rust fungus diversity in spore trap samples with DNA barcoding and next generation sequencing. », North American Rust Workers Meeting (NARW), St. Paul, MN, USA, June 12, 2011. (Présentation)
2011 - Consulter les détails de la publication
Chen, W., Lewis, C.T., Chapados, J.T., Bilkhu, S., Hambleton, S., Seifert, K.A., et Lévesque, C.A. (2011). « Aerobiota diversity in Canada’s air: Mining the metagenomic data. », Great Lakes - St. Lawrence Spring Workshop in Mycology, Peterborough, ON, Canada, May 7-8, 2011. (Présentation)
2011 - Consulter les détails de la publication
Lévesque, C.A., Bilkhu, S., Chapados, J.T., Chen, W., Hambleton, S., Lewis, C.T., Oliver, K., et Seifert, K.A. (2011). « AeroNet: A Canadian spore trapping network monitoring fungi and bacteria with DNA barcodes and next generation sequencing. », iBOL-Canada: The future of DNA Barcoding in Canada, Beaty Biodiversity Museum, UBC, Vancouver, BC, Canada, April 29-May 1, 2011. (Présentation)
2011 - Consulter les détails de la publication
Tsuneda, A., Hambleton, S., et Currah, R.S. (2011). « The anamorph genus Knufia and its phylogenetically allied species in Coniosporium, Sarcinomyces, and Phaeococcomyces., [Botany/Botanique, 89(8), pp. 523-536.] (Corrigendum). », Botany, 89(12), p. 887.
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Marsh, K., McCallum, B.D., Wang, X., Tenuta, A.U., Hambleton, S., et Saville, B. (2011). « Investigating emerging wheat pathogens, new wheat leaf rust virulence in Ontario. », 1st Canadian Wheat Symposium, Winnipeg, MB, Canada, November 30-December 2, 2011.
2011 - Consulter les détails de la publication
Johnson, R.S.P., Sangster, C.R., Sigler, L., Hambleton, S., et Paré, J.A. (2011). « Deep fungal dermatitis caused by the Chrysosporium anamorph of Nannizziopsis vriesii in captive coastal bearded dragons (Pogona barbata). », Australian Veterinary Journal, 89(12), p. 515-519. doi : 10.1111/j.1751-0813.2011.00851.x
2011 - Consulter les détails de la publication
Isard, S.A., Barnes, C.W., Hambleton, S., Ariatti, A., Russo, J.M., Tenuta, A.U., Gay, D.A., et Szabo, L.J. (2011). « Predicting Soybean Rust Incursions into the North American Continental Interior Using Crop Monitoring, Spore Trapping, and Aerobiological Modeling. », Plant Disease, 95(11), p. 1346-1357. doi : 10.1094/PDIS-01-11-0034
2011 - Consulter les détails de la publication
Vialle, A., Frey, P., Hambleton, S., Bernier, L., et Hamelin, R.C. (2011). « Poplar rust systematics and refinement of Melampsora species delineation. », Fungal Diversity, 50(1), p. 227-248. doi : 10.1007/s13225-011-0129-6
2011 - Consulter les détails de la publication
Tsuneda, A., Hambleton, S., et Currah, R.S. (2011). « The anamorph genus Knufia and its phylogenetically allied species in Coniosporium, Sarcinomyces, and Phaeococcomyces. », Botany, 89(8), p. 523-536. doi : 10.1139/B11-041
2011 - Consulter les détails de la publication
Liu, M. et Hambleton, S. (2010). « Taxonomic study of stripe rust, Puccinia striiformis sensu lato, based on molecular and morphological evidence. », Fungal Biology, 114(10), p. 881-899. doi : 10.1016/j.funbio.2010.08.005
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Tsuneda, A., Hambleton, S., et Currah, R.S. (2010). « Endoconidioma populi from aspen and alder: phylogeny, and variations in cleistopycnidial morphology and their ecological implications. », Botany, 88(7), p. 675-684. doi : 10.1139/B10-043
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