Evaluation of seed and soil treatments with novel Bacillus subtilis strains for control of soybean root rot caused by Fusarium oxysporum and F. graminearum

Le piétin fusarien est une maladie importante des cultures de soja de l’Ontario, au Canada. La présente étude avait pour objet de trouver des agents bactériens efficaces pour remplacer les produits chimiques dans la lutte contre le Fusarium oxysporum et le F. graminearum, agents du piétin fusarien. Vingt-deux souches de Bacillus subtilis extraites de racines de soja et de maïs ont été évaluées en cultures mixtes quant à leur potentiel d’inhibition de la croissance mycélienne chez le F. oxysporum et le F. graminearum. Toutes les souches ont réduit la croissance mycélienne de façon significative, d’environ 17 à 48 % chez le F. oxysporum et 10 à 32 % chez le F. graminearum. Dix des souches de B. subtilis ont été sélectionnées sur la base de la grandeur de la zone d’inhibition puis évaluées quant à leur potentiel d’inhibition de la germination des macroconidies. Les dix souches ont inhibé la germination des spores en filtrats acellulaires, de 20 à 48 % chez le F. oxysporum et de 14 à 32 % chez le F. graminearum. L’efficacité de deux modes d’inoculation, sur les graines et dans le sol, a été évaluée en serre contre les deux agents pathogènes. Les critères d’évaluation étaient la gravité de la maladie, le taux de levée, la hauteur des plantes et le poids sec des racines. Six souches (SB01, SB04, SB23, SB24, SB28 et SB33) extraites de racines de soja et deux souches (CB01 et CH22) extraites de racines de maïs ont réduit de façon significative la gravité de la maladie causée par les deux agents pathogènes, dans les deux modes d’inoculation. Les souches SB01, SB04, SB23 et SB24 se sont avérées les plus efficaces contre les deux agents pathogènes, dans les deux modes d’inoculation. Inoculées sur les graines, ces quatre souches ont réduit la gravité de la maladie de 43 à 63 % et ont augmenté le taux de levée de 13 à 17 %, la hauteur des plantes de 9 à 18 % et le poids sec des racines de 8,4 à 19 %. Inoculées dans le sol, elles ont réduit la gravité de la maladie de 68 à 74 % et ont augmenté le taux de levée de 14 à 18 %, la hauteur des plantes de 11 à 23 % et le poids sec des racines de 16 à 24 %. Ces résultats donnent à croire que les nouvelles souches de B. subtilis évaluées dans la présente étude pourraient remplacer avantageusement les fongicides employés contre les agents du piétin fusarien du soja et que l’inoculation dans le sol accroît leur efficacité par rapport à l’inoculation sur les graines.