Assessing the agronomic potential of linseed genotypes by multivariate analyses and association mapping of agronomic traits

Les prix élevés de l’huile de poisson rendent le lin oléagineux attrayant pour la fabrication d’aliments pour animaux, y compris pour l’aquaculture. Pour qu’un approvisionnement constant de lin oléagineux puisse être maintenu, il est essentiel de mettre au point des cultivars stables. Dans le cadre de la présente étude, nous avons évalué 35 génotypes de lin oléagineux dans cinq environnements (E) du Chili, de 2009 à 2012. Nous avons réalisé une analyse des effets principaux additifs et des interactions multiplicatives (AMMI) et une analyse de diagrammes de double projection GGE (génotype (G) plus interaction génotype × environnement (GE)) et avons utilisé trois paramètres de stabilité en vue de trouver des génotypes adaptés pour la mise au point de cultivars de lin oléagineux. En outre, nous avons réalisé une analyse par cartographie d’association avec quatre caractères agronomiques et avons évalué la stabilité des marqueurs associés au moyen de l’approche QQE (effet principal du QTL et interaction QTL ×environnement). Une analyse de variance combinée visant le rendement, le nombre de graines par capsule, la hauteur de la plante et la précocité de floraison a donné des résultats significatifs dans le cas de G, E et GE (P < 0,001). Selon l’analyse de stabilité combinée, certains génotypes du Canada, d’Argentine et du Chili se sont révélés les mieux adaptés et ont présenté les meilleurs rendements. L’analyse de la parenté héréditaire a montré que le croisement de génotypes canadiens et chiliens pourrait maximiser la ségrégation transgressive du rendement. Les associations significatives observées dans le cas de la précocité de floraison, de la hauteur de la plante et du nombre de graines par capsule étaient responsables de jusqu’à 59 % de la variation phénotypique de ces caractères. Les analyses QQE et AM ont toutes deux indiqué que le marqueur LGM27B était le plus stable et le plus significatif pour l’ensemble des environnements et qu’il était particulièrement important pour l’amélioration de la précocité de floraison. L’utilisation combinée de l’analyse de stabilité et des analyses AM et QQE pourrait nous permettre d’accélérer la mise au point de cultivars de lin oléagineux commercialisables adaptés au sud du Chili.