Genetic diversity and interaction between Pratylenchus spp. and Verticillium dahliae in potatoes in Canada

L’industrie de la pomme de terre est en pleine croissance au Canada. Par contre, les rendements stagnent ou déclinent dans plusieurs régions. La mort prématurée de la pomme de terre (Potato Early Dying, PED), un complexe de maladies causé par Verticillium dahliae et le nématode des lésions Pratylenchus spp., serait responsable de la majorité de ces pertes. L’objectif de cette recherche était d’approfondir les connaissances sur la distribution et la virulence de ces organismes à travers le Canada. Plus de 2500 individus du genre Pratylenchus ont été isolés à partir d’échantillons de sol provenant de six provinces. Le génotypage du gène cytochrome oxydase a permis de déterminer que l’espèce P. crenatus dominait dans toutes les provinces. La présence de P. neglectus était limitée au provinces de l’ouest alors que P. penetrans a surtout été observé dans l’est. La caractérisation génétique des isolats de V. dahliae, isolés à partir des mêmes échantillons de sol, a révélé la présence de deux groupes de compatibilité végétative (VCG) à travers le Canada. Le VCG4A était plus présent dans l’ouest alors que le VCG4B dominait dans l’est. Des cultures in vitro ont été établies pour les trois espèces de Pratylenchus ainsi que pour les souches de V. dahliae afin d’effectuer des tests de virulence et d’interaction en serre. L’espèce P. neglectus a démontré un taux de multiplication plus rapide que les deux autres espèces. Par contre, aucune interaction synergique n’a été observée entre les espèces de Pratylenchus et V. dahliae. Puisque les espèces de Pratylenchus et les groupes VCG de V. dahliae sont connus pour présenter des profils de pathogénicité différents, l’information sur leur distribution à travers le Canada permettra d’améliorer les recommandations de traitements pour une meilleure gestion du PED.