Whole-cell protein and ITS rDNA profiles as diagnostic tools to discriminate Fusarium avenaceum intraspecific variability and associated virulence

Un total de 91 isolats de Fusarium avenaceum ont été regroupés en 15 phénotypes et en 10 groupes de compatibilité végétative, présentant en électrophorèse sur gel de polyacrylamine-sodium docécyl sulfate à un dimension (SDS-PAGE 1-D) des profils protéiques spécifiques mais des profils d’ADNr de l’espaceur interne transcrit (ITS) moins spécifiques. Chaque isolat possédait une signature reproductible quant aux bandes de protéines. En effet, l’algorithme de regroupement « unweighted pair group method with arithmetic averages » a révélé que le profil protéique de chaque groupe d’isolats était corrélé avec la virulence du champignon. L’utilisation de SDS-PAGE offre une technique simple et sensible pour différencier de routine les isolats pathogènes des isolats non pathogènes au sein de populations inconnues de F. avenaceum. Cette découverte a des implications significatives pour l’évaluation des risques dans un contexte de sécurité alimentaire des récoltes de céréales. Cette approche à bas coût peut être optimisée et étendue à un large spectre de pathogènes associés à la fusariose des panicules.