In situ detection of starch-hydrolyzing microorganisms in activated sludge

Les polysaccharides constituent une partie importante de la matière organique dans les eaux usées domestiques, et l’hydrolyse joue un rôle important dans leur transformation et l’élimination des éléments nutritifs dans les usines de traitement des eaux usées par boues activées. Toutefois, on ne possède aucune donnée sur l’identité, l’écophysiologie et l’abondance des organismes qui hydrolysent l’amidon (OHA) dans ces usines. Dans la présente étude, nous avons appliqué et optimisé le procédé de coloration enzymatique in situ par fluorescence au moyen d’amidon marqué au BODIPY pour tracer les OHA exprimant l’activité α amylase dans les usines de boues activées. Nous avons pu visualiser clairement la fluorescence à la surface des bactéries exprimant l’activité α amylase. Dans les 11 usines de traitement des eaux usées à grande échelle procédant à une élimination des éléments nutritifs que nous avons examinées, les morphotypes d’OHA dominants étaient toujours représentés par des cocci groupés en tétrades, des courts bâtonnets groupés et certains organismes filamenteux. Nous avons identifié les OHA en associant la coloration enzymatique in situ et la technique d’hybridation in situ en fluorescence à l’aide de toute une gamme de sondes oligonucléotidiques. Tous les OHA observés étaient des actinobactéries, et la plupart présentaient le phénotype des organismes accumulant du polyphosphate étroitement apparentés au genre Tetrasphaera, dans la famille des Intrasporangiaceae. Les OHA étaient présents dans la plupart des usines de traitement des eaux usées examinées et comprenaient, au total, jusqu’à 11 % du biovolume de bactéries, ce qui représente une partie importante des communautés microbiennes.