Sequence variations and molecular phylogenetic analyses of the HMW-GS genes from different genomes in Triticeae

Nous avons tenté d’élucider l’évolution moléculaire des sous-unités à masse moléculaire élevée de la gluténine (HMW-GS) chez les Triticées par alignement multiple de séquences du domaine N-terminal chez 77 HMW GS. Nous avons observé une forte homologie de séquence pour le domaine N-terminal chez les sous-unités de type x et de type y. L’alignement de séquences a révélé que les sous-unités de type y avaient une structure primaire semblable, non seulement quant à la longueur du domaine N-terminal, mais aussi quant à la variation des acides aminés le composant, laquelle est moins importante que chez les sous-unités de type x. L’analyse des gènes codant les sous-unités HMW-GS de type x a permis de distinguer trois groupes de gènes conservés, définis respectivement par la présence ou l’absence d’un fragment de 24 pb ou la présence d’un fragment de 15 pb en début du domaine N-terminal des ORF. La fréquence des mutations chez les gènes codant les sous-unités HMW-GS de type x et de type y était respectivement de 1,89 et de 1,25 sur 10 bases. Il n’y avait pas suffisamment de variation dans les séquences des sous-unités HMW-GS de type y pour permettre une analyse de l’évolution. Les sous-unités HMW-GS codées par les génomes A, B et D du blé tendre se répartissent manifestement en trois groupes. Les sous-unités HMW-GS de type x provenant d’Aegilops bicornis, A. comosa, A. cylindrica, A. umbellulata et A. uniaristata sont plus étroitement associées aux sous-unités codées par le génome D qu’à celles codées par le génome B.