Molecular Characterization of Divergent Strawberry Mild Yellow Edge Virus Isolates from Eastern Canada

Nous avons déterminé et analysé la séquence génomique complète de quatre isolats du virus du jaunissement du bord des feuilles du fraisier, SMYEV (pour strawberry mild yellow edge virus). Les isolats désignés AB41-01, AB41-02, NB1165 et NS26 proviennent de champs de fraises présentant des symptômes de dépérissement dans l’est du Canada. Les isolats AB41-01 et AB41-02 provenaient du même échantillon d’une plante de l’Île-du-Prince-Édouard, alors que l’isolat NB1165 venait du Nouveau-Brunswick et le NS26, de la Nouvelle-Écosse. L’homologie entre les séquences de nucléotides est la suivante : 95,8 % entre AB41-01 et NB1165; 99,6 % entre AB41-02 et NS26; et 84 % entre AB41-01/NB1165 et AB41-02/NS26. L’homologie entre ces quatre isolats et deux isolats du SMYEV déjà identifiés, soit le MY18 et le D7, est de 83,5 à 89,9 %. L’analyse phylogénétique montre que les quatre isolats canadiens représentent deux nouveaux types de souches de SMYEV et que la divergence entre les souches ne vient probablement pas d’événements de recombinaison entre les isolats connus du SMYEV.