Interoperability with Moby 1.0 - It's better than sharing your toothbrush!
Citation
Wilkinson, M.D., Senger, M., Kawas, E., Bruskiewich, R., Gouzy, J., Noirot, C., Bardou, P., Ng, A., Haase, D., Saiz Ede, A., Wang, D., Gibbons, F., Gordon, P.M., Sensen, C.W., Carrasco, J.M., Fernández, J.M., Shen, L., Links, M.G., Ng, M., Opushneva, N., Neerincx, P.B., Leunissen, J.A., Ernst, R., Twigger, S., Usadel, B., Good, B., Wong, Y., Stein, L., Crosby, W., Karlsson, J., Royo, R., Párraga, I., Ramírez, S., Gelpi, J.L., Trelles, O., Pisano, D.G., Jimenez, N., Kerhornou, A., Rosset, R., Zamacola, L., Tarraga, J., Huerta-Cepas, J., Carazo, J.M., Dopazo, J., Guigo, R., Navarro, A., Orozco, M., Valencia, A., Claros, M.G., Pérez, A.J., Aldana, J., Rojano, M.M., Fernandez-Santa Cruz, R., Navas, I., Schiltz, G., Farmer, A., Gessler, D., Schoof, H., et Groscurth, A. (2008). « Interoperability with Moby 1.0 - it's better than sharing your toothbrush! », Briefings in Bioinformatics, 9(3), p. 220-231. doi : 10.1093/bib/bbn003
Résumé
Le projet BioMoby a été lancé en 2001 par des membres du groupe contribuant aux bases de données sur les organismes modèles. Le but était de normaliser les méthodologies afin de faciliter l’échange d’information et l’accès aux ressources analytiques en appliquant une approche fondée sur le consensus. Six ans plus tard, le groupe travaillant à la mise au point de BioMoby a le plaisir d’annoncer le lancement de la version 1.0 du cadre d’interopérabilité avec une interface de programmation d'applications de registres et une programmation basée sur les langages PERL et Java. La plateforme BioMoby permet ainsi l’accès interopérationnel à plus de 1 400 ressources bio-informatiques à l’échelle mondiale, et ce nombre continue de grossir. Ici, nous présentons et discutons les caractéristiques de BioMoby qui distinguent cette plateforme des autres services Web sémantiques et initiatives d’interopérabilité et qui ont été essentielles à son déploiement et à son utilisation par une vaste communauté de fournisseurs de services bio-informatiques. La norme, le logiciel client et les bibliothèques de codes sont tous accessibles gratuitement à l’adresse suivante : http://www.biomoby.org/.