Genetic variation in field populations of baculoviruses: Mechanisms for generating variation and its potential role in baculovirus epizootiology

Les Baculoviridae constituent une famille de virus à ADN spécifiques des insectes utilisés comme agents de lutte biologique contre les insectes. Dans la plupart des cas, les baculovirus utilisés comme agents de lutte biologique sont des isolats prélevés dans la nature qui ont été choisis en fonction de leur infectiosité et de leur virulence. L’utilisation des nouveaux outils moléculaires comme les endonucléases de restriction, la réaction en chaîne de la polymérase ciblée et les nouvelles stratégies de séquençage de l’ADN a permis une détection et une caractérisation efficaces des variants génotypiques chez les isolats des espèces de baculovirus selon l’endroit et le moment de leur isolement. Il est devenu évident qu’il existe plusieurs variantes génotypiques, même chez des larves individuelles infectées. On a montré que les souches clonales d’espèces de baculovirus issues de méthodes in vitro ou in vivo varient sur les plans de l’infectiosité et de la virulence. Nombre des souches purifiées sur plaque issues de cultures cellulaires comportent des délétions qui interrompent l’expression du gène egt, ce qui mène à des souches de virus qui tuent les hôtes infectés plus rapidement. En outre, des clones obtenus in vitro comportent souvent des délétions génomiques plus étendues avec la perte du gène pif, ce qui donne des souches déficientes pour l’infectiosité orale. Il existe un nombre croissant d’espèces de baculovirus pour lesquelles on dispose des séquences du génome complet de plus d’une souche ou isolat obtenu sur le terrain. Les résultats d’une analyse comparative de ces souches ont indiqué que les régions hr et les gènes bro font souvent l’objet d’une variabilité génétique d’une souche à l’autre et d’événements de recombinaison éventuels. En outre, on commence à mesurer le degré de polymorphisme nucléotidique d’une souche à l’autre et au sein d’une même souche et le rôle de ces polymorphismes dans les substitutions d’acides aminés dans les ORF et les modifications dans les motifs des promoteurs. Dans cette courte mise au point, nous examinons les mécanismes potentiels qui produisent et maintiennent cette diversité génétique au sein des populations de baculovirus, ainsi que le rôle éventuel des variations génétiques dans les interactions hôte-pathogène.