Genetic diversity of seed storage proteins in diploid, tetraploid and hexaploid Avena species

Citation

Yan, H., Baum, B.R., Zhou, P., Zhao, J., Wei, Y.-M., Ren, C.Z., Xiong, F., Liu, G., Zhong, L., Zhao, G., et Peng, Y.-Y. (2014). « Genetic diversity of seed storage proteins in diploid, tetraploid and hexaploid Avena species. », Israel Journal of Ecology and Evolution. doi : 10.1080/15659801.2014.949114

Résumé

Nous avons caractérisé la diversité génétique de 106 spécimens d’Avena provenant de différents pays, dont des espèces diploïdes, tétraploïdes et hexaploïdes, en fonction du polymorphisme des protéines de réserve des graines, déterminé par électrophorèse SDS-PAGE. Au total, nous avons détecté 24 bandes de protéines et 72 profils protéiniques dans les 106 spécimens. La similarité génétique se situait entre 0,50 et 1,00. Les profils de protéines de réserve des graines étaient en grande partie indépendants des fluctuations environnementales. Les spécimens appartenant à une même espèce ou possédant une constitution génomique identique présentaient les mêmes profils protéiniques ou des profils similaires. Le taux de variation intraspécifique observé était relativement faible comparativement au taux de variation interspécifique. Les espèces hexaploïdes à génome AACCDD et les espèces diploïdes à génome AA présentaient davantage de divergences que les autres espèces, les pourcentages de bandes polymorphes s’établissant à 85,7 % et à 61,1 %, respectivement. Parmi les espèces diploïdes à génome AA, les espèces diploïdes à génome AsAs présentaient un taux de variation plus élevé que les espèces diploïdes à génome AA modifié. Les résultats de l’analyse typologique ont montré l’existence d’une relation étroite entre les espèces hexaploïdes et les espèces tétraploïdes à génome AACC. Les espèces tétraploïdes à génome AABB se sont révélées similaires aux espèces diploïdes à génome AsAs, à l’exception de l’espèce A. agadiriana, à constitution génomique AABB, qui présentait une relation étroite avec l’espèce diploïde à génome AcAc A. canariensis de même qu’avec les espèces polyploïdes porteuses des génomes A et C.

Date de publication

2014-01-01