Émergence du circovirus porcin du génotype 2b chez le porc au Canada.

Depuis la fin de 2004, l’industrie porcine au Québec est aux prises avec une augmentation importante de la mortalité associée au syndrome de dépérissement multisystémique en post-sevrage (SDMP). Deux hypothèses ont été avancées pour expliquer ce phénomène : 1) la présence d’un 2e pathogène qui pourrait exacerber l’infection par le circovirus 2 porcin (PCV-2) ou 2) il pourrait s’agir d’une nouvelle souche de PCV-2 plus virulente. En 2005, 13 cas de SDMP ont été soumis au laboratoire provincial de diagnostic du Québec et le PCV-2 s’est avéré le seul virus à être détecté systématiquement par PCR dans les 13 échantillons. La PCR a également montré que 61,5 p. 100 des échantillons contenaient le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire du porc; 30,8 p. 100, le virus de la grippe porcine; 15,4 p. 100, le parvovirus porcin; 69,2 p. 100, le torque teno virus porcin (swTTV); 38,5 p. 100, le virus de l’hépatite E porcine (swHEV) et 84,6 p. 100, le Mycoplasma hyorhinis. Le virus de la gastro-entérite transmissible du porc et le coronavirus respiratoire porcin (TGEV/PRCV) n’ont pas été détectés. Des séquences du génome entier révèlent que les souches de PCV-2 appartiennent à au génotype désigné PCV-2b, lequel n’a jamais été signalé au Canada. Des analyses plus poussées des séquences de 83 autres cas canadiens de PCV-2 envoyés au laboratoire provincial de diagnostic en 2005 et en 2006 montrent que 79,5 p. 100 des séquences virales étaient similaires à celle du génotype PCV-2b. L’émergence de ce génotype au Canada pourrait expliquer l’augmentation de la mortalité liée au SDMP, un lien qui reste toutefois à confirmer.