Ébauche de la séquence du génome de Lactobacillus crispatus JCM5810, une bactérie qui réduit la colonisation de l’intestin du poulet par Campylobacter jejuni

Dans le présent article, nous présentons une ébauche de la séquence du génome de Lactobacillus crispatus, une bactérie isolée dans les matières fécales de poulet ayant démontré un potentiel probiotique par coagrégation avec l’agent pathogène d’origine alimentaire Campylobacter jejuni dans le cadre d’études in vitro préliminaires. Le séquençage du génome entier a été effectué à l’aide de la plateforme Illumina MiSeq, générant une banque de paires appariées contenant 5 226 355 lectures d’une longueur moyenne de 300 pb. L’assemblage de novo du génome a été réalisé à l’aide du système CLC Genomics Workbench. Les lectures de séquençage ont été assemblées en 12 contigs d’une longueur moyenne de 170 057.