Arbitrary multi-gene reference for normalization of real-time PCR gene expression data

L’analyse de l’expression génique à l’aide de la réaction en chaîne de la polymérase à transcription inverse (RT PCR) en temps réel exige le recours à des gènes de référence pour normaliser l’expression d’un échantillon à l’autre. Nous avons mis au point une nouvelle référence pour la RT PCR en temps réel en utilisant une amorce arbitraire pour amplifier un ensemble de gènes pris au hasard. L’amorce arbitraire amplifie plus de 30 gènes, dont l’expression cumulative mesurée par la RT-PCR en temps réel correspond étroitement à celle de l’UBQ11, un gène d’Arabidopsis thaliana utilisé comme référence dans les micropuces. Nous avons également comparé l’expression des gènes arbitraires à celle de gènes constitutifs de la pomme de terre (Solanum tuberosum spp. tuberosum); l’expression est demeurée stable durant une infection par Phytophthora infestans.