Kristi Miller-Saunders

Directeur, Génétique des saumons
Pêches et Océans Canada

Recherche et / ou projets en cours

Je supervise, au MPO, un programme diversifié de recherche en génétique moléculaire depuis plus de 15 ans. Le but primordial de ce programme est le développement d’outils de génétique moléculaire qui peuvent être utilisés dans la gestion durable des ressources halieutiques et le développement d’espèces aquatiques aux fins d’aquaculture. Les résultats de nos recherches sur la génétique des populations ont servi à établir des unités de gestion et de conservation pour diverses espèces, ainsi qu’à bâtir des bases de données pour l’identification de stocks de saumon et l’identification judiciaire de sujets capturés aux fins d’application de la loi. Nous avons mené des études génétiques sur une gamme d’espèces de poissons et de mollusques marins : salmonidés, sébaste, morue franche, morue charbonnière, hareng, oursins, panope et ormeau. Bien que nous ayons développé et utilisé une panoplie de marqueurs moléculaires, y compris des loci minisatellites, des loci microsatellites et de l’ADN mitochondrial, je m’intéresse principalement à la variation adaptative. Le complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) est le principal complexe de gènes adaptatifs chez les vertébrés, et mon laboratoire a effectué des recherches poussées sur les gènes du CNH chez les téléostéens, la génétique adaptative des gènes du CMH chez des populations de saumon et les mécanismes de sélection exercés sur le CNH chez les téléostéens.

Mon groupe a également développé des techniques et des marqueurs génétiques pour l’identification d’espèces et nous les avons appliqués pour faire des analyses judiciaires aux fins d’application de la loi, des analyses des excréments de l’otarie de Steller et des analyses d’identification d’évadés du saumon d’élevage. Les résultats de nos travaux sur le typage de bactéries ont été appliqués dans le développement de probiotiques pour l’aquaculture, la délimitation de la complexité de la communauté bactérienne de ruisseaux et de lacs à saumon et le dépistage d’agents pathogènes chez le poisson. Pour l’aquaculture, nous avons développé des épreuves quantitatives PCR en temps réel pour les agents pathogènes, identifié la protéine de Kudoa thyrsites responsable de la liquéfaction post mortem des tissus du saumon et identifié les loci quantitatifs impliqués dans l’expression de la croissance rapide des muscles chez le pétoncle.

En 2004, suite à l’introduction du premier microréseau d’ADNc du saumon provenant du projet de recherche en génomique sur le saumon atlantique (GRASP ou Genomics Research on Atlantic Salmon Project; Ben Koop et Willie Davidson), j’ai amorcé la création, au Laboratoire de génétique moléculaire, d’un nouveau programme de génomique fonctionnelle, le Groupe de génomique et d’adaptation en écologie marine. Ce nouveau programme me permet d’élargir mon intérêt dans l’évolution adaptative au contrôle moléculaire de l’adaptation phénotypique. Les recherches menées dans le cadre de ce programme ont porté sur la réaction propre à un salmonidé hôte au virus de la NHI, visant à tirer au clair les réactions effectives de l’hôte aux fins de recherche ciblée sur les vaccins; la physiologie de migration du saumon, dans le but d’établir les profils physiologiques associés au moment de l’entrée en eau douce et le devenir des saumons rouges de montaison tardive dans le Fraser; et le stress causé par la densité des sujets chez le saumon élevé en cages, dans le but d’identifier les biomarqueurs du stress aux fins d’aquaculture. Ce programme se focalise principalement, mais pas exclusivement, sur des recherches sur la génomique écologique du saumon sauvage pour tirer au clair les interactions entre son phénotype et son milieu de vie, ainsi que les limites de sa capacité d’adaptation. Cliquez sur l’onglet GAEM du Laboratoire de génétique moléculaire pour plus de détails.

Principales publications

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