Seed coat phenolics and the developing silique transcriptome of brassica carinata

Nous avons élucidé la structure de neuf composés dans le tégument des graines de deux lignées génétiquement apparentées de Brassica carinata. La lignée à graines jaunes accumulait des kaempférols, phénylpropanoïdes et lignanes monomériques, mais présentait une forte réduction des proanthocyanidines extractibles et non extractibles et d’un pic de chromatographie liquide haute performance contenant des structures de type polymérique apparentées à la quercétine et aux lignanes. La lignée à graines brunes accumulait de grandes quantités des deux types de proanthocyanidines (extractibles et non extractibles), ainsi que des phénylpropanoïdes et des lignanes en quantités équivalentes à celles mesurées dans le téguments des graines de la lignée à graines jaunes, mais le tégument des graines de la lignée à graines brunes était dépourvu de kaempférols. Une expérience à l’aide d’une oligopuce de 15K de Brassica napus a indiqué que les siliques de la lignée à graines jaunes présentaient des modifications plus importantes de l’expression génique et un nombre 2,4 fois plus élevé de gènes régulés positivement que les siliques de la lignée à graines brunes, y compris une foule de facteurs de transcription et de gènes dont la fonction était inconnue. Les transcrits de six gènes codant des flavonoïdes (CHS, F3H, FOMT, DFR, GST et TTG1) étaient en plus faible quantité et ceux de deux gènes (F3H et FLS) étaient en plus grande quantité dans les siliques de la lignée à graines jaunes, mais l’expression des gènes CHI et PAP1 et des gènes codant les phénylpropanoïdes n’était pas modifiée.