Reclassification de la sous-espèce Clavibacter michiganensis sur la base d’analyses du génome entier et de séquences multilocus

Citation

Li, X., Tambong, J., Yuan, K.X., Chen, W., Xu, H., André Lévesque, C., De Boer, S.H. (2018). Re-classification of clavibacter michiganensis subspecies on the basis of whole-genome and multi-locus sequence analyses, 68(1), 234-240. http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.002492

Résumé en langage clair

Bien que l’on ait d’abord proposé que les bactéries du genre Clavibacter faisaient partie d’une seule espèce comptant plusieurs sous-espèces, de récentes données sur l’analyse du génome entier et de gènes multiples montrent qu’il s’agit en fait d’espèces distinctes. Cet article présente des données scientifiques confirmant que les six sous-espèces bactériennes sont en fait des espèces authentiques et uniques.

Résumé

© 2018, Sa Majesté la Reine du chef du Canada. Bien que l’on ait d’abord proposé que le genre Clavibacter englobe toutes les espèces de bactéries corynéformes phytopathogènes dont les molécules de peptidoglycane contiennent du B2γ diaminobutyrate. Cependant, depuis lors, toutes ces espèces, sauf une, ont été reclassées dans d’autres genres, de sorte qu’une seule espèce fait aujourd’hui partie du genre Clavibacter, à savoir Clavibacter michiganensis. Cette espèce comprend plusieurs sous-espèces, qui sont toutes des agents phytopathogènes hautement spécifiques de l’hôte. L’analyse du génome entier fondée sur l’identité nucléotidique moyenne et l’hybridation numérique ADN-ADN, ainsi que l’analyse de séquences multilocus (MLSA) de sept gènes domestiques, permettent d’élever chacune des sous-espèces de C. michiganensis au rang d’espèce. À la lumière des résultats de ces analyses, nous proposons deux nouvelles espèces et trois nouvelles combinaisons, soit Clavibacter capsici sp. nov., comb. nov. et Clavibacter tessellarius sp. nov., comb. nov., ainsi que Clavibacter insidiosus comb. nov., Clavibacter nebraskensis comb. nov. et Clavibacter sepedonicus comb. nov.

Date de publication

2018-01-01

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