Pharmaceuticals in the environment: Biodegradation and effects on natural microbial communities. A review

Les microorganismes de l’environnement jouent un rôle clé dans les processus écologiques fondamentaux comme les cycles biogéochimiques et la dégradation des contaminants organiques. Les microorganismes comprennent un vaste réservoir inexploré de diversité génétique et de capacité métabolique intervenant dans plusieurs écosystèmes, notamment dans le maintien de la qualité du sol et de l’eau. La présence, dans l’environnement, de produits pharmaceutiques peut compromettre la structure et l’activité des communautés microbiennes de plusieurs façons. Le devenir d’un produit pharmaceutique dans le sol ou dans l’eau dépend de nombreux facteurs, dont ses propriétés physicochimiques inhérentes (solubilité dans l’eau, lipophilicité, pression de vapeur), les facteurs environnementaux (température, rayonnement incident, pH) et, notamment, la présence et l’activité des microorganismes capables de le biodégrader. La présence d’une communauté microbienne naturelle est essentielle à une réponse efficace aux différents produits chimiques qui peuvent contaminer un écosystème. Le rétablissement d’un écosystème contaminé n’est possible que si la toxicité du contaminant n’empêche pas l’activité microbienne. Nous présentons ici l’état des connaissances actuelles sur les effets de certains produits pharmaceutiques et biocides couramment retrouvés sous forme de microcontaminants environnementaux sur les communautés naturelles de microorganismes.