Neuf ébauches de séquences du génome de Claviceps purpurea s.lat., y compris C. arundinis, C. humidiphila et C. cf. spartinae, pseudomolécules du chancre Fusarium circinatum, ébauche du génome de Davidsoniella eucalypti, Grosmannia galeiformis, Quambalar
Citation
Wingfield, B.D., Liu, M., Nguyen, H.D.T., Lane, F.A., Morgan, S.W., De Vos, L., Markus Wilken, P., Duong, T.A., Aylward, J., Coetzee, M.P.A., Dadej, K., De Beer, Z.W., Findlay, W., Havenga, M., Kolarík, M., Menzies, J.G., Naidoo, K., Pochopski, O., Shoukouhi, P., Santana, Q.C., Seifert, K.A., Soal, N., Steenkamp, E.T., Tatham, C.T., van der Nest, M.A., Wingfield, M.J. (2018). Nine draft genome sequences of Claviceps purpurea s.lat., including C. arundinis, C. humidiphila, and C. cf. spartinae, pseudomolecules for the pitch canker pathogen Fusarium circinatum, draft genome of Davidsoniella eucalypti, Grosmannia galeiformis, Quambalaria eucalypti, and Teratosphaeria destructans. IMA Fungus, [online] 9(2), 401-418. http://dx.doi.org/10.5598/imafungus.2018.09.02.10
Résumé en langage clair
Nous avons séquencé et assemblé le génome entier de neuf champignons de l’ergot. Ces données nous aideront à comprendre les fondements génétiques de la toxicité et de la pathogénicité de ces importants champignons.
Résumé
© 2018 International Mycological Association. Cette présentation de génome comprend des ébauches du génome de Claviceps purpurea s.lat., y compris C. arundinis, C. humidiphila et C. cf. spartiates. Les ébauches du génome de Davidsoniella eucalypti, Quambalaria eucalypti et Teratosphaeria destructans, tous trois d’importants agents pathogènes de l’eucalyptus, sont présentées. L’insecte associé Grosmannia galeiformis est également décrit. Le génome de Fusarium circinatum, un agent pathogène du pin, a été assemblé en pseudomolécules, d’après des données de séquençage additionnelles, et la synténie connue qui existe au sein du complexe d’espèces de Fusarium fujikuroi. Ce nouvel assemblage du génome de F. circinatum fournit 12 pseudomolécules correspondant au nombre de chromosomes haploïdes de F. circinatum. Ces assemblages sont comparables à ceux d’autres assemblages chromosomiques de FFSC et permettront des comparaisons génomiques plus rigoureuses au sein de ce complexe d’espèces.