N (FR)Identification moléculaire et caractérisation d’un nouveau sous-groupe de phytoplasmes 16SriX-J et cpn60 UT IX-J associé au rabougrissement de la chicorée en Arabie saoudite

Citation

Pérez-López, E., Omar, A.F., Al-Jamhan, K.M., Dumonceaux, T.J. (2018). Molecular identification and characterization of the new 16SriX-J and cpn60 UT IX-J phytoplasma subgroup associated with chicory bushy stunt disease in Saudi Arabia, 68(2), 518-522. http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.002530

Résumé en langage clair

Nous avons caractérisé une souche de bactérie phytoplasme qui s’attaque à la chicorée au Moyen-Orient. Il est essentiel de comprendre la distribution et la taxonomie de cette bactérie qui infecte pratiquement toutes les espèces végétales cultivées dans le monde à des fins de surveillance et de suivi de ce pathogène.

Résumé

© 2018 IUMS. La chicorée (Cichorium intybus) est une plante vivace (Asteraceae) poussant à l’état sauvage dans des pâturages en Arabie saoudite. Des plantes de chicorée au phénotype rabougri et touffu, des symptômes typiques d’une infection à phytoplasme, ont été observées dans la région de Mulayda, gouvernorat de Qassim, en Arabie Saoudite. Dans la présente étude, nous avons examiné des échantillons de trois plantes de chicorée symptomatiques et avons confirmé la présence d’ADN phytoplasmique. L’analyse des séquences du gène codant l’ARNr 16S a révélé la présence d’un phytoplasme appartenant au groupe des phytoplasmes 16Sr IX qui causent le balai de sorcière du pois cajan. Sur la base des résultats du séquençage du gène codant pour l’ARNr 16S, du séquençage partiel du gène codant pour la cpn60, d’une analyse RFLP simulée par ordinateur et de l’étude phylogénétique des deux marqueurs, le phytoplasme est représentatif d’un nouveau sous-groupe 16SrIX-J et cpn60 UT IX-IJ. L’étude a permis d’ajouter la chicorée au nombre des hôtes de certaines souches du groupe de phytoplasmes qui causent le balai de sorcière du pois cajan, élargissant ainsi la diversité connue de ce groupe.

Date de publication

2018-02-01

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