N (FR)Analyse de transcriptomes liés à la survie et à l’éclosion de nématodes à kyste de la pomme de terre, Globodera rostochiensis et G. pallid

2017 Le ou les auteurs. Les nématodes à kyste de la pomme de terre (NKP), Globodera rostochiensis et G. pallida, sont à l’origine de pertes économiques importantes. Il est difficile de s’attaquer à ces organismes en raison de leur capacité à demeurer dormants dans le sol durant de nombreuses années. Même si les connaissances générales sur ces nématodes parasitaires de végétaux se sont considérablement améliorées dans les dernières décennies, on en sait très peu sur les événements moléculaires qui jouent un rôle dans la dormance des kystes et leur éclosion, deux étapes importantes de leur développement. Nous avons étudié l’évolution de transcriptomes de NKP, de l’étape de kystes déshydratés à juvénile éclos, en utilisant des séquences d’ARN. D’après nos résultats, plusieurs gènes liés à la détoxification de la cellule étaient très actifs dans les kystes déshydratés. De nombreux gènes liés à une augmentation de l’absorption de calcium et d’eau étaient régulés à la hausse durant le passage de la dormance à l’hydratation. L’exposition de kystes hydratés à des exsudats racinaires de la plante hôte a donné lieu à différentes réponses transcriptionnelles entre les espèces. Après 48 h d’exposition, les kystes de G. pallida ne présentaient aucune modulation importante de l’expression génique, tandis que G. rostochiensis présentait 278 gènes exprimés de manière différentielle. Le premier gène de G. rostochiensis régulé à la hausse de façon importante a été observé après 8 heures et codait une métalloprotéase transmembranaire. Cet enzyme est capable d’activer ou d’inactiver des hormones peptidiques et pourrait jouer un rôle dans une cascade d’événements menant à l’éclosion. Plusieurs gènes effecteurs connus ont aussi été régulés à la hausse au cours de l’éclosion.