La cartographie du polymorphisme de nucléotide simple (SNP) à haute densité et analyse des loci de caractères quantitatifs (QTL) dans une population biparentale de triticale de printemps a permis de localiser la résistance à effet majeur et mineur à la f

Citation

Dhariwal, R., Fedak, G., Dion, Y., Pozniak, C., Laroche, A., Eudes, F., Randhawa, H.S. (2018). High density single nucleotide polymorphism (SNP) mapping and quantitative trait loci (QTL) analysis in a biparental spring triticale population localized major and minor effect fusarium head blight resistance and associated traits QTL. Genes, [online] 9(1), http://dx.doi.org/10.3390/genes9010019

Résumé en langage clair

Nous avons cartographié des QTL de résistance à la FHB sur 10 chromosomes différents du triticale et avons constaté qu’ils étaient associés à de nombreux caractères agronomiques.

Résumé

© 2018 par les auteurs. Licencié MDPI, Bâle, Suisse. Le triticale (xTriticosecale Wittmack) est une importante culture fourragère qui subit d’importantes pertes de rendement, de grade et de qualité à l’utilisation finale en raison de la fusariose de l’épi. La mise au point de cultivars de triticale résistants est entravée par l'absence de sources efficaces de résistance génétique. Pour analyser la résistance à la fusariose, nous avons déterminé le phénotype d'une population haploïde doublée de triticale de printemps issue du croisement TMP16315/AC Ultima à l’aide d’une méthode de culture de microspores pour évaluer l’incidence et la gravité de la fusariose, l’indice de classement visuel (ICV), le désoxynivalénol (DON) et certains caractères associés (ergot , concentration en protéines du grain, poids spécifique, rendement, hauteur de la plante et verse) suivi d’un génotypage par polymorphisme de nucléotide simple (SNP). Nous avons construit une carte à haute densité comprenant 5274 SNP cartographiés sur les 21 chromosomes avec une densité de 0,48 cM/SNP. Ensemble, 17 loci de caractères quantitatifs majeurs ont été relevés pour la fusariose sur les chromosomes 1A, 2B, 3A, 4A, 4R, 5A, 5R et 6B; deux des loci d’incidence (sur 2B et 5R) étaient également situés au même endroit que des loci de gravité et d’ICV, et deux autres loci d’ICV (sur 1A et 4R) présentaient une accumulation de DON. Des loci majeurs et mineurs ont également été recensés pour tous les autres caractères, en plus des nombreux loci d’épistasie. Cette étude fournit un nouvel éclairage sur les fondements génétiques de la résistance à la fusariose et leur association avec d’autres caractères chez le triticale.