Identification of Pythium spp. From the rhizosphere of soybeans in Ontario, Canada.

Citation

Marchand, G., Chen, Y., Berhane, N.A., Wei, L., Lévesque, C.A., et Xue, A.G. (2014). « Identification of Pythium spp. From the rhizosphere of soybeans in Ontario, Canada. », Canadian Journal of Plant Pathology, 36(2), p. 246-251. doi : 10.1080/07060661.2014.920921

Résumé

La culture du soja dans les régions du Canada où la saison de croissance est courte est affectée par des espèces de Pythium causant la pourriture des semences, la fonte des semis et la pourriture racinaire chez les plantes adultes au début de la saison de croissance. Dans le but de déterminer l’identité des espèces de Pythium infectant le soja cultivé sous conditions locales, des échantillons de sols furent prélevés en Ontario en 2010, 2011 et 2012, dans des champs de soja où des symptômes de fonte des semis ou de pourriture racinaire étaient visibles. Les espèces de Pythium spp. furent isolées des échantillons de sol à l’aide d’une technique d’appâtage avec des semences et de l’utilisation de milieux sélectifs. L’amplification par PCR et le séquençage de la région intercalaire transcrite de l’ADN ribosomal nucléaire ont permis l’identification de six espèces différentes de Pythium (à partir d’un total de 104 souches). P. ultimum var. ultimum (56.7%) et P. sylvaticum (29.8%) furent les espèces les plus fréquemment isolées durant le total de trois années d’échantillonage. Les espèces P. dissotocum (6.7%), P. ultimum var. sporangiiferum (3.8%), P. irregulare (1.9%), and P. hypogynum (1.0%) étaient aussi représentées.