Identification et caractérisation des microARN et de leurs cibles au moyen d’étiquettes de séquences transcrites (EST) chez Ribes nigrum

Les micro-ARN (miARN) sont une classe d’ARN endogènes, non codants, monocaténaires, d’environ 21 nucléotides de longueur, qui jouent des rôles cruciaux dans les processus biologiques et métaboliques des végétaux. Même si de nombreux miARN ont été identifiés chez plusieurs espèces végétales, ces éléments demeurent encore totalement inconnus chez cette Ribes nigrum. Dans cette étude, nous avons découvert deux miARN (rni-miR5021 et rni-miR5185) chez cette espèce en utilisant une approche de génomique comparative des étiquettes de séquences transcrites (EST, pour Expression Sequence Tag). Par la suite, l’analyse des organismes transgéniques semblait indiquer que les gènes putatifs codant ces miARN (rni-miR5021 et rni-miR5185) pouvaient générer leur miARN correspondant in vivo. De plus, la PCR quantitative précédée d’une transcription inverse (qRT-PCR) a révélé que les profils d’expression des gènes MIR varient selon les tissus du cassis, et les deux miARN matures s’accumulaient plus dans les fruits que dans les autres tissus. Enfin, 47 cibles ont été prédites pour les deux miARN, lesquels interviennent dans la réponse aux stress et dans d’autres procédés biologiques des végétaux. Ces résultats faciliteront les études futures sur les fonctions et les mécanismes de régulation des miARN chez Ribes nigrum.