Genetic diversity of Streptomyces spp. causing common scab of potato in eastern Canada

Citation

St-Onge, R., Goyer, C., Coffin, R.H., et Filion, M. (2008). « Genetic diversity of Streptomyces spp. Causing common scab of potato in eastern Canada. », Systematic and Applied Microbiology, 31(6-8), p. 474-484. doi : 10.1016/j.syapm.2008.09.002

Résumé

La gale commune est une maladie importante de la pomme de terre causée par Streptomyces scabies et d’autres espèces étroitement apparentées. Dans le présent article, nous présentons pour la première fois une étude de la diversité génétique de Streptomycess spp. responsable de la gale commune de la pomme de terre dans l’est du Canada. Nous avons obtenu 41 isolats de Streptomyces spp. à partir de lésions nécrotiques de tubercules de pomme de terre récoltés dans différentes régions du Nouveau-Brunswick, de la Nouvelle-Écosse et de l’Île-du-Prince-Édouard, au Canada. La plupart des isolats étaient étroitement apparentés à des souches de S. scabies pathogènes connues, à en juger par des analyses de l’ARNr 16 S et de la séquence du gène rpoB. Nous avons identifié une espèce pathogène de Streptomyces acidicabies dans deux isolats. À notre connaissance, cette espèce n’a jamais été isolée auparavant dans ces régions. Des études de cartographie du génome à l’aide de l’amplification d’éléments répétitifs par la réaction en chaîne de la polymérase (rep-PCR) ont révélé 10 groupes génétiques distincts dans l’est du Canada. La répartition géographique des groupes génétiques variait selon les régions. Une amplification des gènes liés à la pathogénicité et à la virulence (txtA, txtC et tomA) de chaque isolat par la PCR, suivie d’une analyse de la séquence des nucléotides de fragments partiels des gènes a révélé de légers polymorphismes chez les gènes txtA et txtC. Nous n’avons observé aucune variation génétique dans les séquences partielles du gène tomA.