Fusarium poae et les nouvelles mycotoxines associés au fusariose au Canada.

Fusarium graminearum Schwabe est réputé être le principal agent causal de la fusariose dans les céréales, mais Fusarium avenaceum (Fr.) Sacc., Fusarium equiseti (Corda) Sacc., Fusarium sporotrichioides Sherb. et Fusarium poae (Peck) Wollenw. sont aussi fréquemment trouvés dans des grains contaminés à la fusariose. Ces espèces sont capables de produire leur propre éventail de mycotoxines. Dans le monde, il a été rapporté que F. poae produit des trichothécènes de type A et de type B ainsi que de la beauvéricine, du cyclonérodiol et des énniatines, mais on en sait peu sur le potentiel mycotoxigène des isolats canadiens. Des études récentes réalisées en Ontario laissent croire que F. poae et F. graminearum sont les principaux Fusarium qui peuvent être isolés de l’orge tandis que F. poae est souvent trouvé dans l’avoine contaminée. Nous avons entamé l’étude de la diversité génétique et de la production de mycotoxines de la population de F. poae au Canada. Des prélèvements faits en Ontario, au Québec et en Saskatchewan, dans des champs d’avoine, d’orge et de blé, de 2006 à 2016, ont permis de recueillir 160 isolats de monospores de F. poae. L’identification des espèces a été validée par le séquençage du gène TEF1-ɑ. Ces isolats ont été mis en culture dans un milieu liquide et solide pour que soit déterminé le profil de métabolites par UPLC-HRMS-CAD. Nous recherchons dans cette collection d’isolats deux séquences géniques non liées codant la biosynthèse de mycotoxine, soit TRI1 et TRI8, lesquelles pourraient contribuer aux variations observées dans le chimiotype. L’analyse phylogénétique fondée sur le gène TRI8 a révélé 27 SNP et quatre grands groupes dans la population canadienne. Notre objectif est de déterminer le potentiel mycotoxigène de F. poae au Canada et d’examiner si la diversité génétique a des effets sur la contamination par F. poae de différentes céréales hôtes.