Formation de biofilm par les Escherichia coli non-O157 producteurs de shigatoxines dans des monocultures et des cocultures avec des bactéries de surface associées à la transformation de la viande

Les E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) constituent un problème de santé publique important et l’un de leurs principaux mécanismes de survie est la formation de biofilm. Les comptes rendus publiés portent principalement sur la formation de biofilm d’une seule espèce bactérienne, ce qui ne reflète pas la situation complexe dans les usines de transformation alimentaires où des bactéries commensales sont présentes. Cette étude a examiné l’impact des bactéries présentes à la surface des usines de transformation de la viande (BTV) sur la formation de biofilm par les STEC, ainsi que les liens possibles entre la formation de biofilm par les STEC et les gènes liés à la formation de biofilm dans leur génome. La formation de biofilm par six souches de STEC dans des cultures monospécifiques ou bispécifiques avec 50 souches de BTV a été évaluée par la méthode de coloration au cristal violet, tandis que le curli et la cellulose, deux substances extracellulaires jouant un rôle important dans la formation de biofilm, ont été déterminés à l’aide de la méthode de culture sur gélose colorée au rouge congo. La plupart des souches de BTV avaient des effets antagonistes sur la formation de biofilm par les souches de STEC. Parmi les gènes étudiés, 81 % étaient communs chez les souches de STEC et il semble y avoir une redondance génique d’impliquée dans la formation du biofilm. Dans l’ensemble, la formation de biofilm par les STEC a été affectée par l’expression de la curli-cellulose et les souches compagnes. Bien qu’une pléthore de gènes codant pour les protéines impliquées dans les étapes essentielles de la formation du biofilm était présente dans tous les génomes des STEC étudiées, la finesse de production du biofilm se situe probablement au niveau de la régulation, plutôt qu’au niveau de la présence ou de l’absence de gènes structurels. Il est donc essentiel de faire la caractérisation phénotypique de la formation de biofilm dans des conditions adéquates. Certaines BTV, en particulier certains membres des bactéries aérobies à Gram négatif, des bactéries lactiques et des entérobactériacées ont de forts effets antagonistes sur la formation de biofilm par diverses souches de STEC, ce qui pourrait être étudié plus à fond pour leur utilisation comme agents de lutte biologique contre la formation de biofilms.