Étude des relations génétiques entre le Brassica juncea et le B. nigra au moyen d’une stratégie d’allopolyploïdie et d’hexaploïdie virtuelles

© 2021, les auteurs, sous licence exclusive de Springer Nature B.V. faisant partie de Springer Nature. Le Brassica juncea est une plante d'importance économique dans le monde; Cependant, la base génétique limitée de cette plante a considérablement réduit sa productivité. En tant qu’espèce ancestrale du B. juncea, le B. nigra joue un rôle important dans l’élargissement de la diversité génétique du B. juncea. Dans la présente étude, nous avons utilisé 42 marqueurs SSR pour évaluer la diversité génétique de 83 spécimens de B. nigra, de 16 spécimens de B. juncea et d’autres spécimens de Brassica. Les caractéristiques moléculaires de 498 lignées virtuelles de B. juncea ont été déduites des bandes du B. nigra et du B. rapa au moyen d’une stratégie d'allopolyploïdie virtuelle, puis comparées à celles d’obtentions naturelles de B. juncea. Nous avons constaté que le B. nigra possédait une riche diversité génétique et pouvait être classé en quatre sous-groupes, parmi lesquels le sous-groupe B-III et le sous-groupe B-IV présentaient respectivement la relation génétique la plus proche et la plus éloignée. Pour le vérifier, nous avons appliqué une stratégie d’hexaploïdie au B. juncea synthétique généré à partir de 20 obtentions de B. nigra, ce qui nous a permis d’obtenir 45 nouveaux types de génotypes de B. juncea. Les analyses génétiques ont révélé que le B. juncea synthétique dérivé du B. nigra du sous-groupe B-III était proche du B. juncea naturel, tandis que le B. juncea synthétisé avec le B. nigra du sous-groupe B-IV présentait une grande diversité génétique et était le plus éloigné du B. juncea actuel. Cette étude a montré que le B. nigra avait un grand potentiel dans l’élargissement de la diversité génétique du B. juncea, particulièrement le sous-groupe B-IV du B. nigra, en plus d'offrir une meilleure compréhension de la relation génétique entre le B. nigra et le B. juncea.