Ébauche des séquences du génome de souches de Pseudomonas associées au noisetier, isolées en Ontario, au Canada

Citation

Ellouze, W., Nesbitt, D., Parcey, M., Gayder, S., Marchand, G., Svircev, A.M., Tambong, J.T. (2020). Draft Genome Sequences of Hazelnut-Associated Pseudomonas Strains Isolated in Ontario, Canada, 9(45), http://dx.doi.org/10.1128/MRA.01021-20

Résumé en langage clair

Deux souches de Pseudomonas ont été isolées à partir d’échantillons de noisetiers présentant des symptômes de dépérissement et de nécrose des pousses. Nous avons séquencé l’ébauche du génome des deux souches dans le but de déterminer leur position taxinomique par rapport à celle chez des lignées proches. Notre analyse a permis de classer les deux souches comme appartenant aux espèces Pseudomonas cerasi et P. congelans.

Résumé

Deux souches de Pseudomonas (H346 M et H346 S) ont été isolées à partir d’échantillons de noisetiers présentant des symptômes de dépérissement et de nécrose des pousses. L’ébauche des séquences du génome des souches H346 M et H346 S consiste en 66 et en 51 contigs, respectivement, avec une taille totale de 5 693 988 et de 5 889 925 pb et de 4 885 et de 5 045 séquences codant des protéines, respectivement.