Ébauche de séquence du génome d’Alternaria alternata ATCC 34957

Citation

Nguyen, H.D.T., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Gräfenhan, T. (2016). Draft genome sequence of Alternaria alternata ATCC 34957. Genome Announcements, [online] 4(1), http://dx.doi.org/10.1128/genomeA.01554-15

Résumé en langage clair

Alternaria alternata est un champignon qui infecte des centaines d’espèces de plantes hôtes et cause des taches foliaires et d’autres maladies. Dans la présente étude, nous avons séquencé et caractérisé le génome d’une souche particulière (ATCC 34957) à l’aide de la technologie de séquençage de longues lectures. Cette étude profite aux Canadiens, car les résultats obtenus soutiendraient la recherche en génomique et en métabolomique en aval sur les mycotoxines de ce champignon et de ses parents.

Résumé

© 2016 Nguyen et al. Nous présentons ici l’ébauche de séquence du génome d’Alternaria alternata ATCC 34957. On a déjà signalé que cette souche produisait de l’alternariol et de l’éther monométhylique d’alternariol sur le sorgho-grain altéré. Le génome a été séquencé à l’aide de la technologie de PacBio et assemblé en 27 échafaudages d’une taille totale de 33,5 Mb.

Date de publication

2016-01-01

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