Des criblages génétiques systématiques révèlent l’organisation dynamique fonctionnelle globale de la machinerie de traduction chez la bactérie

Nous avons effectué un criblage à l’échelle du génome d’une levure à partir d’une banque de délétions de gènes non essentiels pour identifier les phénotypes devenus dysfonctionnels par anoxie. Grâce au criblage, nous avons obtenu une liste facilement gérable de 384 gènes potentiellement nouveaux et de gènes réactifs à l’oxygène (survie à l’anoxie) qui étaient déjà connus. Nous avons fait une analyse plus approfondie des mutants de délétion pour évaluer leur sensibilité à la ferrozine et au cobalt afin d’obtenir un sous-ensemble de 34 gènes candidats réactifs à l’oxygène, dont le gène MGA2, un activateur réactif à l’hypoxie. Avec chaque mutant dans ce sous-ensemble, nous avons effectué un essai de β-galactosidase plasmidique à l’aide du promoteur du gène OLE1 inductible par l’anoxie, et nous avons recensé 17 délétions géniques qui inhibent l’induction en anaérobiose. L’analyse des interactions génétiques de l’un de ces mutants, le gène POP2 qui code la RNase, a révélé des interactions synthétiques dysfonctionnelles avec un certain nombre de gènes impliqués dans la détection et la réponse à l’oxygène. Des expériences d’inhibition du CNOT8, homologue du POP2 chez l’humain, ont réduit la survie cellulaire en conditions anoxiques, ce qui suggère une fonction semblable dans les cellules humaines.