Création de peptides contre le virus Zika au moyen des interactions protéines-protéines prédites entre l’humain et le virus Zika
Citation
azmirchuk T, Dick K, Burnside DJ, Barnes B, Moteshareie H, Hajikarimlou M,
Omidi K, Ahmed D, Low A, Lettl C, Hooshyar M, Schoenrock A, Pitre S, Babu M,
Cassol E, Samanfar B, Wong A, Dehne F, Green JR, Golshani A. Designing anti-Zika
virus peptides derived from predicted human-Zika virus protein-protein
interactions. Comput Biol Chem. 2017 Dec;71:180-187. doi:
10.1016/j.compbiolchem.2017.10.011.
Résumé en langage clair
Le virus Zika (ZIKV) est actuellement responsable d’une pandémie ayant une incidence humaine considérable. La propagation rapide du virus dans l’hémisphère occidental a mené à un cumul considérable de connaissances sur l’infection par le ZIKV. Les interactions protéines-protéines (PPI) hôte-virus sont essentielles à l’infection virale et à la propagation du virus ainsi qu’à la neuroinvasion. L’étude de l’interactome hôte-virus représente une étape importante pour la détermination de cibles pour de nouveaux produits thérapeutiques antiviraux. L’Organisation mondiale de la santé a levé l’état d’urgence relatif au ZIKV, de sorte qu’il est important de passer à des mesures de gestion du ZIKV puisque de nombreux mécanismes de pathogenèse sont encore mal compris. Les peptides mis au point présentés ici pourraient donc devenir des outils thérapeutiques utiles contre l’infection par le ZIKV, et ils pourraient contribuer à la lutte globale contre le ZIKV.
Résumé
© 2017. La production de produits thérapeutiques contre le virus Zika (ZIKV) devient de plus en plus importante, car ce virus dévastateur continue de se propager de façon plutôt inaperçue. Notamment, une relation de cause à effet entre l’infection par le ZIKV et des anomalies du développement neurologique a été largement signalée, mais aucun mécanisme précis expliquant les perturbations du développement neurologique n’a été déterminé. Nous traitons ici de plusieurs peptides synthétiques concurrents inhibant les principales protéines pathogènes du ZIKV, mis au point d’après les interactions protéines-protéines (PPI) prédites. Souvent, les PPI entre les protéines de l’hôte et du virus sont essentielles à l’infection et à la pathogenèse, ce qui en fait des cibles intéressantes pour la mise au point de produits thérapeutiques. Nous avons utilisé deux outils complémentaires de prédiction PPI fondés sur les séquences pour produire une carte exhaustive des PPI prédites humain-ZIKV (209 protéines humaines candidates). Nous avons ensuite mis au point plusieurs peptides destinés à perturber les interactions hôte pathogène correspondantes et ayant conséquemment un effet thérapeutique contre le ZIKV. Les données produites dans le cadre de la présente étude représentent une ressource de base pouvant être utilisées dans le cadre des efforts multidisciplinaires destinés à combattre le ZIKV, notamment pour la mise au point de protéines synthétiques additionnelles.