Characterization of barley Prp1 gene and its expression during seed development and under abiotic stress

Le gène de traitement de l’ARN pré-messager (Prp1), qui code un complexe protéique d’épissage, a d’abord été identifié chez la levure à fission et joue un rôle de régulation durant l’activation du complexe d’épissage et le cycle cellulaire. Chez les végétaux, des gènes Prp1 n’ont été identifiés que chez le riz, le Sorghum et l’Arabidopsis thaliana. Les travaux que nous présentons ici portent sur l’identification et l’isolement du gène Prp1 de l’orge. Nous avons également étudié le profil d’expression du gène par RT-PCR quantitative en temps réel, par prédiction de la région promotrice et par l’analyse des données de biopuces. Les caractéristiques de la structure primaire de la protéine Prp1 présumée de l’orge ressemblent à celles des autres Prp1 connues. La comparaison des acides aminés montre que les Prp1 de l’orge et des autres végétaux possèdent une région 3’ terminale hautement conservée, tandis que les séquences de l’extrémité 5’ varient beaucoup. L’analyse de l’expression révèle que chez l’orge, le niveau d’expression du gène Prp1 est stable, quel que soit le tissu, mais qu’il est régulé à la hausse au cours des stades intermédiaire et final du développement de la graine ou dans des conditions de stress dû au froid. La comparaison des données de biopuces concernant l’orge, le riz et l’Arabidopsis corrobore ce profil d’expression du gène Prp1 chez l’orge. Quant au mécanisme moléculaire du profil d’expression, nous pensons que l’augmentation des ARN pré-messagers peut réguler à la hausse l’expression du gène Prp1, laquelle ne serait donc ni constitutive, ni ubiquitaire.