Tim A. McAllister, Ph.D.

Image Tim A. McAllister
Chercheur scientifique, Nutrition des ruminants et microbiologie

Recherche et / ou projets en cours

  • Évaluation de la résistance aux antimicrobiens (RA) chez les animaux d’élevage dans la perspective Une santé.
  • Incidence sur la biodiversité de la production canadienne de bovins de boucherie
  • Rôle de l’industrie canadienne du bœuf dans le maintien et la préservation des stocks de carbone dans les systèmes agricoles.
  • Incidence des technologies d’accroissement du rendement sur les émissions de gaz à effet de serre issus des systèmes de production du bœuf.
  • Évaluation de l’utilisation des enzymes pour améliorer l’utilisation des aliments par les ruminants.
  • Évaluation de l’utilisation du biocharbon dans les rations des bovins de boucherie pour réduire les émissions de gaz à effet de serre en agriculture.
  • Élaboration de méthodes de contrôle de la vitesse de fermentation des céréales chez les bovins.
  • Caractérisation des effets des tannins sur la digestion de cellulose chez les ruminants.
  • Caractérisation des propriétés digestives des céréales chez les bovins de boucherie.
  • Évaluation du rôle des champignons du rumen sur la digestion des aliments chez les ruminants.
  • Estimation des émissions de gaz à effet de serre des systèmes de production des bovins de boucherie.
  • Stratégies de réduction de l’excrétion fécale d’Escherichia coli O157:H7 chez les bovins.
  • Quantification et caractérisation des émissions de méthane issues de la production du bétail.
  • Compostage comme méthode d’élimination des carcasses d’animaux et de confinement des agents biologiques dangereux.
  • Enquête sur la stabilité des prions dans le compost.
  • Utilisation de la métagénomique pour élaborer des stratégies de réduction de la colonisation par Escherichia coli O157:H7 chez les bovins.

Énoncés de recherches/projets

Évaluation de la résistance aux antimicrobiens (RA) chez les animaux d’élevage dans la perspective Une santé et stratégies de réduction d’E. coli O157:H7 tout au long de la chaîne de production du bœuf, incluant la thérapie bactériophagique, l’immunothérapie passive, l’eau d’anode oxydante électrolysée, les stratégies de gestion et les interventions alimentaires. Rôles des microbiomes dans la salubrité des aliments, la qualité des aliments du bétail et les émissions de méthane entérique. Élaboration de méthodes de caractérisation et de réduction des émissions de gaz à effet de serre issues des systèmes de production des bovins de boucherie et des émissions de méthane entérique et incidence du changement de l’utilisation des terres sur la séquestration du carbone et la biodiversité dans les systèmes de production des bovins de boucherie. Caractérisation des propriétés digestives des céréales et de l’utilisation de sous-produits dans les rations des bovins de boucherie et élaboration de méthodes d’amélioration de l’ensilage des céréales fourragères et de la valeur des fourrages de faible qualité. Prévention de la météorisation dans les pâturages et les parcs d’engraissement; compostage comme méthode d’élimination des carcasses d’animaux et de confinement des agents biologiques dangereux; évaluation du sort de l’ADN transgénique ingérée par les animaux d’élevage par le biais des cultures génétiquement modifiées utilisées comme aliments du bétail; caractérisation des effets des tannins sur la digestion de cellulose chez les ruminants; utilisations possibles des extraits de végétaux et des probiotiques comme produits de rechanges aux antibiotiques dans la production animale. Ses collaborations ont généré plus de 800 publications scientifiques évaluées par des pairs.

Prix et études

Doctorat, nutrition des ruminants/microbiologie (avec distinction) (1991) – Université de Guelph (Ontario)

Maîtrise en biochimie animale (1987) – Université de l’Alberta (Edmonton)

Baccalauréat en agriculture (avec distinction) (1985) - Université de l’Alberta (Edmonton)

  • Bourse de recherche de la Société canadienne de science animale (2018)

  • Prix de l’industrie canadienne du bœuf pour l’excellence en recherche et en innovation - présenté par le Conseil de recherche sur les bovins de boucherie (CRBB) (2016)

  • Prix H.R. MacMillan Laureate en agriculture – Université de Guelph (2015)

  • Prix d’excellence de la fonction publique – Contribution scientifique – Fonction publique du Canada – remis par l’honorable Stephen Harper, premier ministre du Canada (2014)

  • Médaille du jubilé de diamant de la reine Elizabeth II - Gouverneur général du Canada. Mis en candidature par la Canadian Cattlemen’s Association (2012)

  • Prix de la American Society of Animal Science / American Feed Industry Association pour la recherche en nutrition des ruminants (2010)

  • Prix d’excellence en nutrition et en science de la viande de la Société canadienne de science animale (2008)

  • Prix Nobel de la paix (à titre de membre du Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat, qui a partagé le prix avec l’ancien vice-président des É.-U. Al Gore) – remis pour avoir accru la sensibilisation à l’échelle internationale aux gaz à effet de serre et au réchauffement climatique (2007)

  • Prix Moisson d’or du ministre d’AAC (2005) (prix individuel)

  • Prix Alberta Agriculture Performance Excellence (AAPEX) pour travail d’équipe exceptionnel – Argent – pour son travail au sein de l’équipe de recherche du projet Alfasure (2005)

  • Prix Alberta Agriculture Performance Excellence (AAPEX) pour travail d’équipe exceptionnel – Argent – pour son travail au sein de l’équipe de recherche du projet Biostel (2005)

  • Prix de l’innovation technique pour l’amélioration de la production d’aliments salubres et abordables de la Société canadienne de science animale (2004)

  • Prix Moisson d’or du ministre d’AAC (à titre de membre de l’équipe www.foragebeef.ca) (2003)

  • Prix d’excellence en vulgarisation et service public – Industries canadiennes de production animale - Société canadienne de science animale (2000)

  • Prix d’excellence en agriculture d’AAC pour contribution à l’agriculture canadienne (1998)

  • Prix du jeune scientifique exceptionnel de la Société canadienne de science animale (1996)

Expérience et / ou de travail international

  • Comité consultatif d’experts d’E. coli O157:H7 de la Canadian Cattlemen's Association (2001 – aujourd’hui)

  • Partenariat pour l’évaluation et la performance environnementale de l’élevage (LEAP) de l’Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture – Président du Comité consultatif technique sur la biodiversité

  • Organisation mondiale de la santé- Membre du Comité consultatif sur les stratégies de réduction de l’E. coli productrice de toxine Shiga dans la chaîne de production alimentaire

Principales publications

  1. Klassen, L., Reintjes, G., Tingley, J.P., Jones, D.R., Hehemann, J.H., Smith, A.D., Schwinghamer, T.D., Arnosti, C., Jin, L., Alexander, T.W., Amundsen, C., Thomas, D., Amann, R., McAllister, T.A., Abbott, D.W. (2021). Quantifying fluorescent glycan uptake to elucidate strain-level variability in foraging behaviors of rumen bacteria. Microbiome, [online] 9(1), http://dx.doi.org/10.1186/s40168-020-00975-x

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  2. Holman, D.B., Klima, C.L., Gzyl, K.E., Zaheer, R., Service, C., Jones, T.H., McAllister, T.A. (2021). Antimicrobial Resistance in Enterococcus Spp. Isolated from a Beef Processing Plant and Retail Ground Beef. Microbiology Spectrum, [online] 9(3), http://dx.doi.org/10.1128/Spectrum.01980-21

    2021 - View publication details

  3. Nair, J., Lima, P.M.T., Abdalla, A.L., Molnar, L.J., Wang, Y., McAllister, T., and Geddes, C.M. 2021. Kochia (Bassia scoparia) harvest date impacts nutrient composition, in vitro degradability, and feed value more than pre-harvest herbicide treatment or herbicide resistance traits. 2021 American Society of Agronomy (ASA) – Crop Science Society of America (CSSA) – Soil Science Society of America (SSSA) International Annual Meeting Nov 07-10, 2021. Salt Lake City, UT. (Poster Presentation).

    2021 - View publication details

  4. Nordi, W.M., Marti, S., Gellatly, D., Meléndez, D.M., González, L.A., McAllister, T.A., Fierheller, E.E., Caulkett, N.A., Janzen, E., Schwartzkopf-Genswein, K.S. (2020). Effect of preemptive flunixin meglumine and lidocaine on behavioral and physiological indicators of pain post-band and knife castration in 6-mo-old beef calves.. Livestock Science, [online] 230 http://dx.doi.org/10.1016/j.livsci.2019.103838

    2020 - View publication details

  5. Owens, J.L., Thomas, B.W., Stoeckli, J.L., Beauchemin, K.A., McAllister, T.A., Larney, F.J., Hao, X. (2020). Greenhouse gas and ammonia emissions from stored manure from beef cattle supplemented 3-nitrooxypropanol and monensin to reduce enteric methane emissions. Scientific Reports, [online] 10(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-75236-w

    2020 - View publication details

  6. Terry, S.A., Ribeiro, G.O., Conrad, C.C., Beauchemin, K.A., McAllister, T.A., Gruninger, R.J. (2020). Pretreatment of crop residues by ammonia fiber expansion (AFEX) alters the temporal colonization of feed in the rumen by rumen microbes. FEMS Microbiology Ecology, [online] 96(6), http://dx.doi.org/10.1093/femsec/fiaa074

    2020 - View publication details

  7. Ribeiro, G.O., Gruninger, R.J., Jones, D.R., Beauchemin, K.A., Yang, W.Z., Wang, Y., Abbott, D.W., Tsang, A., McAllister, T.A. (2020). Effect of ammonia fiber expansion-treated wheat straw and a recombinant fibrolytic enzyme on rumen microbiota and fermentation parameters, total tract digestibility, and performance of lambs. Journal of Animal Science, [online] 98(5), http://dx.doi.org/10.1093/jas/skaa116

    2020 - View publication details

  8. Ma, Z., Stanford, K., Bie, X.M., Niu, Y.D., McAllister, T.A. (2020). Effects of Beef Juice on Biofilm Formation by Shiga Toxin-Producing Escherichia coli on Stainless Steel. Foodborne Pathogens and Disease, [online] 17(4), 235-242. http://dx.doi.org/10.1089/fpd.2019.2716

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  9. Challis, J.K., Cantin, J.L., Curtis, A.W., Sura, S., Shade, S., Giesy, J.P., McAllister, T.A.,Jones, P.D. and Larney, F.J. 2020. Environmental fate of melengestrol acetate, trenbolone acetate, and ractopamine in beef cattle feedlots Poster Abstr., 57th Annual Alberta Soil Science Workshop, February 19-20, 2020, Lethbridge, AB.

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  10. Carlos M. Romero, Xiying Hao, Jen Owens, Hongjie Zhang, Erasmus Okine, Abby-Ann Redman, Paul Hazendonk, Tim A. McAllister. Enhancement of manure composting by biochar: An emerging benefit to the use of engineered carbon in animal feeding. 57th Alberta Soil Science Workshop. Lethbridge AB, Feb. 18-20, 2020.

    2020 - View publication details

  11. Azad, E., Derakhshani, H., Forster, R.J., Gruninger, R.J., Acharya, S., McAllister, T.A., Khafipour, E. (2019). Characterization of the rumen and fecal microbiome in bloated and non-bloated cattle grazing alfalfa pastures and subjected to bloat prevention strategies. Scientific Reports, [online] 9(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-41017-3

    2019 - View publication details

  12. Terry, S.A., Redman, A.A.P., Ribeiro, G.O., Chaves, A.V., Beauchemin, K.A., Okine, E., McAllister, T.A. (2019). Effect of a pine enhanced biochar on growth performance, carcass quality, and feeding behavior of feedlot steers. Translational Animal Science, [online] 4(2), http://dx.doi.org/10.1093/tas/txaa011

    2019 - View publication details

  13. Cameron, A., Zaheer, R., McAllister, T.A. (2019). Emerging Variants of the Integrative and Conjugant Element ICEMh1 in Livestock Pathogens: Structural Insights, Potential Host Range, and Implications for Bacterial Fitness and Antimicrobial Therapy, 10 http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2019.02608

    2019 - View publication details

  14. Terry, S.A., Ribeiro, G.O., Gruninger, R.J., Chaves, A.V., Beauchemin, K.A., Okine, E., McAllister, T.A. (2019). A Pine Enhanced Biochar Does Not Decrease Enteric CH4 Emissions, but Alters the Rumen Microbiota. Frontiers in Veterinary Science, [online] 6 http://dx.doi.org/10.3389/fvets.2019.00308

    2019 - View publication details

  15. Gruninger, R.J., Ribeiro, G.O., Cameron, A., McAllister, T.A. (2019). Invited review: Application of meta-omics to understand the dynamic nature of the rumen microbiome and how it responds to diet in ruminants, 13(9), 1843-1854. http://dx.doi.org/10.1017/S1751731119000752

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  16. Zaheer, R., Lakin, S.M., Polo, R.O., Cook, S.R., Larney, F.J., Morley, P.S., Booker, C.W., Hannon, S.J., Van Domselaar, G., Read, R.R., McAllister, T.A. (2019). Comparative diversity of microbiomes and Resistomes in beef feedlots, downstream environments and urban sewage influent. BMC Microbiology, [online] 19(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12866-019-1548-x

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  17. Klima, C.L., Holman, D.B., Ralston, B.J., Stanford, K., Zaheer, R., Alexander, T.W., McAllister, T.A. (2019). Lower Respiratory Tract Microbiome and Resistome of Bovine Respiratory Disease Mortalities. Microbial Ecology, [online] 78(2), 446-456. http://dx.doi.org/10.1007/s00248-019-01361-3

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  18. Nair, J., Turkington, T.K., Blackshaw, R., Geddes, C.M., Lupwayi, N.Z., Xu, S., Yang, J., Yang, H.E., Wang, Y., McAllister, T.A. (2019). Impact of field fungal contamination of barley on ensiling properties, nutritional quality and the microbiome of barley silage. Grass and Forage Science, [online] 74(2), 231-243. http://dx.doi.org/10.1111/gfs.12419

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  19. He, Z.X., Ribeiro, G.O., Beauchemin, K.A., McAllister, T.A., Yang, W.Z. (2019). Inoculum source and transfer of rumen contents from bison to cattle improved in vitro gas production and feed digestibility, but not the responses to exogenous enzymes supplementation. Animal Feed Science and Technology, [online] 248 37-46. http://dx.doi.org/10.1016/j.anifeedsci.2019.01.005

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  20. Terry, S.A., Badhan, A., Wang, Y., Chaves, A.V., McAllister, T.A. (2019). Fibre digestion by rumen microbiota — a review of recent metagenomic and metatranscriptomic studies, 99(4), 678-692. http://dx.doi.org/10.1139/cjas-2019-0024

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Installation de recherche

5403 1st Avenue South
Lethbridge, AB T1J 4B1
Canada

Affiliations

  • Université de Calgary, Faculté de médecine

  • Université de l'Alberta

  • L'Université de la Saskatchewan

  • Université de Lethbridge

  • Université du Manitoba

  • Université de Sydney

  • Université des sciences et technologies Kwame Nkrumah, Kumasi, Ghana

  • Université de Calgary, Département de santé animale de production

 

Language

Anglais