Tim Dumonceaux

Image Tim Dumonceaux
Chercheur scientifique

Mener des recherches scientifiques et en communiquer les résultats.

Recherche et / ou projets en cours

Je suis microbiologiste et je m’intéresse à la recherche sur les diagnostics moléculaires, les écosystèmes microbiens et les biocarburants. J’utilise des méthodes moléculaires pour identifier les agents pathogènes infectant les cultures et autres plantes et élaborer de nouvelles méthodes de détection rapides et précises.

Énoncés de recherches/projets

1. Détection et identification des bactéries et phytoplasmes infectant les cultures et autres plantes.

2. Diagnostics moléculaires, y compris la mise au point de méthodes en laboratoire et sur le terrain.

3. Analyse des écosystèmes microbiens agricoles et mise au point de nouvelles méthodes de caractérisation des communautés microbiennes.

4. Application de champignons qui dégradent les tissus ligneux à la production de biocarburants.

Activités professionnelles / intérêts

recherche scientifique

enseignement

supervision des étudiants des cycles supérieurs

Prix et études

B. Sc. (avec distinction) en microbiologie, Université de la Saskatchewan

M. Sc. en microbiologie, Université de la Saskatchewan

Ph. D. en microbiologie, Université McGill

Principales publications

  1. Olivier, C.Y., Dumonceaux, T.J., Hammond, C., Saguez, J., et Vincent, C. (2014). « New phytoplasma strains in Quebec vineyards. », Joint meeting, Entomological Society of Canada / Entomological Society of Saskatchewan, Saskatoon, Sask., Canada, September 30-October 1, 2014, Poster 26. (Affiche)

    2014 - Consulter les détails de la publication

  2. Boyetchko, S.M., Audy, P., Sawchyn, K., Desgagnés, R., Zhou, T., et Dumonceaux, T.J. (2014). « Application of bacterial strains as microbial biopesticides for control of potato late blight disease (AAFC Inventions Disclosure, 8 pages). ».

    2014 - Consulter les détails de la publication

  3. Olivier, C.Y., Vincent, C., Saguez, J., Dumonceaux, T.J., et Lasnier, J. (2014). « Phytoplasma biodiversity in grapevines and leafhoppers sampled in vineyards of Quebec. », Entomological Society of America 2014 Annual Meeting, Portland, Oregon, USA, November 18, 2014. (Affiche)

    2014 - Consulter les détails de la publication

  4. Dumonceaux, T.J., Green, M., Hammond, C., Perez, E., et Olivier, C.Y. (2014). « Molecular Diagnostic Tools for Detection and Differentiation of Phytoplasmas Based on Chaperonin-60 Reveal Differences in Host Plant Infection Patterns. », PLoS ONE, 9(12: e116039). doi : 10.1371/journal.pone.0116039

    2014 - Consulter les détails de la publication

  5. Town, J.R., Annand, H., Pratt, D.L., Dumonceaux, T.J., et Fonstad, T.A. (2014). « Microbial community composition is consistent across anaerobic digesters processing wheat-based fuel ethanol waste streams. », Bioresource Technology, 157, p. 127-133. doi : 10.1016/j.biortech.2014.01.074

    2014 - Consulter les détails de la publication

  6. Iroba, K., Tabil, L.G., Sokhansanj, S., et Dumonceaux, T.J. (2014). « Pretreatment and fractionation of barley straw using steam explosion at low severity factor. », Biomass and Bioenergy, 66, p. 286-300. doi : 10.1016/j.biombioe.2014.02.002

    2014 - Consulter les détails de la publication

  7. Links, M.G., Demeke, T., Gräfenhan, T., Hill, J.E., Hemmingsen, S.M., et Dumonceaux, T.J. (2014). « Simultaneous profiling of seed-associated bacteria and fungi reveals antagonistic interactions between microorganisms within a shared epiphytic microbiome on Triticum and Brassica seeds. », New Phytologist, 202(2), p. 542-553. doi : 10.1111/nph.12693

    2014 - Consulter les détails de la publication

  8. Dumonceaux, T.J., Town, J.R., Links, M.G., et Boyetchko, S.M. (2014). « High-quality draft genome sequence of Pseudomonas sp. BRG100, a strain with bioherbicidal properties against Setaria viridis (green foxtail) and other pests of agricultural significance. », Genome Announcements, 2(5: e00995-14). doi : 10.1128/genomeA.00995-14

    2014 - Consulter les détails de la publication

  9. Town, J.R., Links, M.G., Fonstad, T.A., et Dumonceaux, T.J. (2014). « Molecular characterization of anaerobic digester microbial communities identifies microorganisms that correlate to reactor performance. », Bioresource Technology, 151, p. 249-257. doi : 10.1016/j.biortech.2013.10.070

    2014 - Consulter les détails de la publication

  10. Canam, T., Town, J.R., Iroba, K., Tabil, L.G., et Dumonceaux, T.J. (2013). « Pretreatment of lignocellulosic biomass using microorganisms: approaches, advantages, and limitations. », dans Chandel, A.K. and da Silva, S.S. (dir.) - Sustainable Degradation of Lignocellulosic Biomass - Techniques, Applications and Commercialization, InTech, Open Access Publisher, Chapitre 8, p. 181-206.

    2013 - Consulter les détails de la publication

  11. Town, J.R., Links, M.G., Fonstad, T.A., et Dumonceaux, T.J. (2013). « Molecular characterization of digestate identifies microorganisms that correlate to reactor performance. », CSBE/SCGAB 2013 Annual Conference, University of Saskatechewan, Saskatoon, SK, Canada, July 7-10, 2013, Presentation, No. CSBE13-128.

    2013 - Consulter les détails de la publication

  12. Iroba, K., Tabil, L.G., Dumonceaux, T.J., et Baik, O.-D. (2013). « Effect of alkaline pretreatment on chemical composition of ignocellulosic biomass using radio frequency heating. », Biosystems Engineering, 116(4), p. 385-398. doi : 10.1016/j.biosystemseng.2013.09.004

    2013 - Consulter les détails de la publication

  13. Canam, T., Dumonceaux, T.J., Record, E., et Li, Y.B. (2013). « White-rot fungi: the key to sustainable biofuel production? (Editorial) », Biofuels, 4(3), p. 247-250. doi : 10.4155/bfs.13.6

    2013 - Consulter les détails de la publication

  14. Canam, T., Li, X., Holowachuk, J., Yu, M., Xia, J., Mandal, R., Krishnamurthy, R., Bouatra, S., Sinelnikov, I., Yu, B., Grenkow, L.F., Wishart, D.S., Steppuhn, H., Falk, K.C., Dumonceaux, T.J., et Gruber, M.Y. (2012). « Differential metabolite profiles and salinity tolerance between two genetically related brown-seeded and yellow-seeded Brassica carinata lines. », Plant Science, 198(January 2013), p. 17-26. doi : 10.1016/j.plantsci.2012.09.011

    2013 - Consulter les détails de la publication

  15. Pratt, D.L., Dumonceaux, T.J., Links, M.G., et Fonstad, T.A. (2012). « Influence of Mass Burial of Animal Carcasses on the Types and Quantities of Microorganisms within a Burial Site. », Transactions of the ASABE, 55(6), p. 2195-2212.

    2012 - Consulter les détails de la publication

  16. Dumonceaux, T.J. (2012). « Analysis of microbial community composition and dynamics using the chaperonin-60 molecular target: Methods and applications. », 2nd Annual Progress and Applications of Next-Generation Sequencing Workshop, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada, May 4, 2012, Presentation.

    2012 - Consulter les détails de la publication

  17. Links, M.G., Dumonceaux, T.J., Hemmingsen, S.M., et Hill, J.E. (2012). « The Chaperonin-60 Universal Target Is a Barcode for Bacteria That Enables De Novo Assembly of Metagenomic Sequence Data. », PLoS ONE, 7(11, Article No. e49755). doi : 10.1371/journal.pone.0049755

    2012 - Consulter les détails de la publication

  18. Schellenberg, J.J., Dumonceaux, T.J., Hill, J.E., Kimani, J., Jaoko, W., Wachihi, C., Mungai, J.N., Lane, M., Fowke, K.R., Ball, T.B., et Plummer, F.A. (2012). « Selection, phenotyping and identification of acid and hydrogen peroxide producing bacteria from vaginal samples of Canadian and East African women. », PLoS ONE, 7(7, Article No. e41217). doi : 10.1371/journal.pone.0041217

    2012 - Consulter les détails de la publication

  19. Severini, A., Goleski, V., et Dumonceaux, T.J. (2011). « Improved Detection and Quantitation of Human BK Polyomavirus by PCR Assay (Reply). », Journal of Clinical Microbiology, 49(7), p. 2778-2779.

    2011 - Consulter les détails de la publication

  20. Adapa, P.K., Tabil, L.G., Schoenau, G.J., Canam, T., et Dumonceaux, T.J. (2011). « Quantitative analysis of lignocellulosic components of non-treated and steam exploded barley, canola, oat and wheat straw using fourier transform infrared spectroscopy. », Journal of Agricultural Science and Technology B, 1(12), p. 177-188.

    2011 - Consulter les détails de la publication

Installation de recherche

107 Science Place
Saskatoon, SK S7N 0X2
Canada

Affiliations

Professeur auxiliaire, département de microbiologie vétérinaire, Université de la Saskatchewan

Language

Anglais