Sébastien Clément
En tant que biologiste et bio-informaticien au sein de l'équipe de génomique du Centre canadien sur la fibre de bois, mon rôle consiste à gérer et analyser les données sur les arbres, soit leur génotype (profil génétique) et leur phénotype (caractéristiques physiques et mécaniques). Ainsi, je développe des bases de données telles TreeSource, plateforme nationale de la qualité des arbres et du bois, qui regroupe près de 7500 sites de recherche en foresterie à travers le Canada. Également, je développe des programmes pour transformer et analyser les données reçues des fournisseurs (ex: données de génotypage, analyse des propriété du bois avec SilviScan, etc.).
Recherche et / ou projets en cours
Projet principal: administrer et développer TreeSource. L'objectif de cette base de données nationale est de regrouper le maximum d'informations sur la qualité du bois et des arbres chez les espèces à valeur économique au Canada. Les données qui y sont disponibles vont du descriptif détaillé de 7500 sites de recherche forestière à travers le Canada, jusqu'au propriétés physico-mécaniques de l'arbre (densité du bois, angle microfibrillaire, dimensions des trachéïdes, etc.). Près de 500 000 arbres de 45 espèces ont des mesures individuelles détaillées.
Ce projet est un service essentiel à plusieurs autres thèmes de recherche d'envergure au Centre canadien sur la fibre de bois:
Silviculture, évaluation de la qualité de la ressource, génomique et modélisation de croissance.
Énoncés de recherches/projets
- TreeSource contribue à la conservation et à la dissémination de la science pour tout le secteur forestier: industrie, milieu académique, gouvernements fédéral et provincial.
- Il contient de l'information exclusive sur la qualité du bois, incluant des données de propriété physico-mécaniques sur près de 11 000 arbres, une référence en la matière.
Activités professionnelles / intérêts
- Bases de données
- Biologie
- Programmation
- Supervision d'étudiants
Prix et études
Dispositifs expérimentaux, Université Laval, 2017
Certification Administration PostgreSQL, EnterpriseDB, 2014
Modèles et langages de bases de données, Université Laval, 2008
M.Sc. Microbiologie, Université de Montréal, 1998
B.Sc. (Distinction) Zootechnie, Université McGill, 1995
Liens additionnels
https://ts.rncan.gc.ca/fr
Principales publications
BMC Genomics 18:335 (2017) |DOI: 10.1186/s12864-017-3715-5
Factors affecting the accuracy of genomic selection for growth and wood quality traits in an advanced-breeding population of black spruce (Picea mariana)
Patrick R.N. Lenz, Jean Beaulieu, Shawn D. Mansfield, Sébastien Clément, Mireille Desponts and Jean Bousquet
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3715-5
Heredity 113, 343-352 (October 2014) | doi:10.1038/hdy.2014.36
Accuracy of genomic selection models in a large population of open-pollinated families in white spruce
J Beaulieu, T Doerksen, S Clément, J MacKay and J Bousquet
Molecular Ecology Resources. 2013 Mar;13(2):324-36.
Development of high-density SNP genotyping arrays for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeners.
Pavy N, Gagnon F, Rigault P, Blais S, Deschênes A, Boyle B, Pelgas B, Deslauriers M, Clément S, Lavigne P, Lamothe M, Cooke JE, Jaramillo-Correa JP, Beaulieu J, Isabel N, Mackay J, Bousquet J.
Genetics. 2011 May;188(1):197-214. Epub 2011 Mar 8.
Association genetics of wood physical traits in the conifer white spruce and relationships with gene expression.
Beaulieu J, Doerksen T, Boyle B, Clément S, Deslauriers M, Beauseigle S, Blais S, Poulin PL, Lenz P, Caron S, Rigault P, Bicho P, Bousquet J, Mackay J.
Tree Genetics & Genomes 2010; 6(3):435-438.
TreeSNPs: a laboratory information management system (LIMS) dedicated to SNP discovery in trees.
Clément S, Fillon K, Bousquet J, Beaulieu J.
J Biol Chem. 2003 Mar 14;278(11):9698-705. Epub 2002 Dec 24.
Lipoprotein lipase affects the survival and differentiation of neural cells exposed to very low density lipoprotein.
Paradis E, Clement S, Julien P, Ven Murthy MR.
FEMS Microbiol Lett. 1997 Jul 15;152(2):307-12.
Expression of P, S, and F1C adhesins by cytotoxic necrotizing factor 1-producing Escherichia coli from septicemic and diarrheic pigs.
Dozois CM, Clément S, Desautels C, Oswald E, Fairbrother JM.