Samir Mechai
Recherche sur l’épidémiologie, la systématique (taxonomie), l’entomologie et la parasitologie
Recherche et / ou projets en cours
Le Dr Mechai a une excellente connaissance du travail moléculaire en laboratoire, de la manipulation des séquences, des analyses bioinformatiques et des analyses phylogénétiques. Sa formation en entomologie appliquée et en bioinformatique lui donne un bagage de compétences multidisciplinaires pertinentes : compétences entomologiques pratiques, compétences taxonomiques en entomologie, compétences en analyse statistique et compétences en géomatique.
Énoncés de recherches/projets
- Travaille à un carrefour multidisciplinaire avec plusieurs spécialisations (génomique, géomatique et modélisation spatiale) nécessaires pour créer de nouvelles idées sur l’application de la surveillance épidémiologique dans le contexte du changement climatique.
- Utilise une technologie de séquençage de nouvelle génération pour étudier l’ensemble du génome accessoire de la bactérie responsable de la maladie de Lyme au Canada.
- Élaborer et optimiser le protocole d’identification des moustiques et des virus transmis par les moustiques dans le cadre du projet IRDG-Écobiomique en utilisant les outils de la NGS et de la métagénomique.
- Trouve de nouveaux moyens pour améliorer les systèmes de surveillance des maladies transmises par les tiques et les moustiques.
Activités professionnelles / intérêts
Recherche en santé publique au sein d’une équipe pluridisciplinaire
Prix et études
Doctorat en épidémiologie, Université de Montréal, 2017
Maîtrise en bioinformatique, Université de Nantes, France, 2012
Maîtrise en agents infectieux, interactions avec leurs hôtes et l’environnement, Université Versailles Saint-Quentin et Institut AgroParisTech, France, 2011
Maîtrise en entomologie appliquée, École nationale supérieure d’agronomie, Algérie, 2009
Liens additionnels
Principales publications
Hannah J. Munro, Nicholas H. Ogden, Samir Mechai, L. Robbin Lindsay, Gregory J. Robertson, Hugh Whitney, Arew S. Lang: Genetic diversity of Borrelia garinii from Ixodes uriae collected in seabird colonies of the northwestern Atlantic Ocean. Ticks and Tick-borne Diseases 06/2019; 10(6).
http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2019.06.014
Salima Gasmi, Nicholas H. Ogden, Marion Ripoche, (…), Samir Mechai, Serge-Olivier Kotchi, Jules K. Koffi: Detection of municipalities at-risk of Lyme disease using passive surveillance of Ixodes scapularis as an early signal: A province-specific indicator in Canada. PLoS ONE 02/2019; 14(2):e0212637.
http://doi.org/10.1371/journal.pone.0212637
Shaun Tyler, Shari Tyson, Antonia Dibernardo, (…), Samir Mechai, Gary Van Domselaar, Harry A. Thorpe, Nick H. Ogden: Whole genome sequencing and phylogenetic analysis of strains of the agent of Lyme disease Borrelia burgdorferi from Canadian emergence zones. Scientific Reports 12/2018; 8(1).
http://doi.org/10.1038/s41598-018-28908-7
Samir Mechai, Gabriele Margos, Edward J. Feil, L. Robbin Lindsay, Pascal Michel, Serge Olivier Kotchi, Nick H. Ogden: Evidence for an effect of landscape connectivity on Borrelia burgdorferi sensu stricto dispersion in a zone of range expansion. Ticks and Tick-borne Diseases 07/2018; 9(6).
http://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2018.07.001
Nicholas H. Ogden, Julie Arsenault, Todd F. Hatchette, Samir Mechai, L. Robbin Lindsay: Antibody responses to Borrelia burgdorferi detected by western blot vary geographically in Canada. PLoS ONE 02/2017; 12(2):e0171731.,
http://doi.org/10.1371/journal.pone.0171731
Samir Mechai, Gabriele Margos, Edward J. Feil, Nicole Barairo, L. Robbin Lindsay, Pascal Michel, Nicholas H. Ogden: Evidence for Host-Genotype Associations of Borrelia burgdorferi Sensu Stricto. PLoS ONE 02/2016; 11(2):e0149345.,
http://doi.org/10.1371/journal.pone.0149345
Nicholas H Ogden, Edward J Feil, Patrick Leighton, Leslie Robbin Lindsay, Gabriele Margos, Sam Mechai, Pascal Michel, Tara J Moriarty: Evolutionary aspects of an emerging Lyme Disease in Canada. Applied and Environmental Microbiology 08/2015; 81(21).
http://doi.org/10.1128/AEM.01671-15
S Mechai, G Margos, E J Feil, L R Lindsay, N H Ogden: Complex Population Structure of Borrelia burgdorferi in Southeastern and South Central Canada as Revealed by Phylogeographic Analysis. Applied and Environmental Microbiology 12/2014; 81(4).
http://doi.org/10.1128/AEM.03730-14
Nick H Ogden, Samir Mechai, Gabriele Margos: Changing geographic ranges of ticks and tick-borne pathogens: Drivers, mechanisms and consequences for pathogen diversity. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 08/2013; 3:46.
http://doi.org/10.3389/fcimb.2013.00046
S Mechai, E J Feil, T D Gariepy, T R Gregory, L R Lindsay, V Millien, N H Ogden: Investigation of the Population Structure of the Tick Vector of Lyme Disease Ixodes scapularis (Acari: Ixodidae) in Canada Using Mitochondrial Cytochrome C Oxidase Subunit I Gene Sequences. Journal of Medical Entomology 05/2013; 50(3):560-70.
http://doi.org/10.1603/ME12178