Ryan S. Austin, PhD

Chercheur Scientifique

Research Scientist and Adjunct Professor in Genome Biology and Bioinformatics

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Centre de recherche et de développement de London

Énoncés de recherches/projets

1. Régulation transcriptionnelle génétique et épigénétique des gènes de stress abiotiques chez les plantes.

2. Cartographie des traits génétiques dans les cultures avec séquençage de prochaine génération.

Prix et études

Doctorat, Biologie du génome et bioinformatique, Université de Toronto, 2009

BSc., Honneurs Biologié, Université de Guelph, 1997

Principales publications

Austin, R.S. (2014). « Applications of NGS to crop research and development. », Canadian NGS Symposium, Toronto ON, Canada, September 25,2014. (Présentation)
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Zou, X., Shi, C., Austin, R.S., Merico, D., Munholland, S., Marsolais, F., Navabi, A., Crosby, W.L., Pauls, K.P., Yu, K., et Cui, Y. (2014). « Genome-wide single nucleotide polymorphism and Insertion-Deletion discovery through next-generation sequencing of reduced representation libraries in common bean. », Molecular Breeding, 33(4), p. 769-778. doi : 10.1007/s11032-013-9997-7
2014 - Consulter les détails de la publication
Na, R., Yu, D., Chapman, B. P., Zhang, Y., Zhang, Y., Kuflu, K., Austin, R.S., Qutob, D., Zhao, J., Wang, Y., et Gijzen, M. (2014). « Genome Re-Sequencing and Functional Analysis Places the Phytophthora sojae Avirulence Genes Avr1c and Avr1a in a Tandem Repeat at a Single Locus. », PLoS ONE, 9(2: Article e89738). doi : 10.1371/journal.pone.0089738
2014 - Consulter les détails de la publication
Austin, R.S., Chatfield, S.P., Desveaux, D., et Guttman, D.S. (2014). « Next-generation mapping of genetic mutations using bulk population sequencing. », Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.), 1062, p. 301-315. doi : 10.1007/978-1-62703-580-4_17
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Austin, R.S. (2013). « Exploring cell-type specific chromatin accessibility dynamics in the Arabidopsis root. », 9th Canadian Plant Genomics Workshop, Halifax, NS, Canada, August 12-15, 2013, Presentation.
2013 - Consulter les détails de la publication
Elhiti, M., Wang, H., Chen, B., Xu, A., Austin, R.S., Brown, R., et Wang, A.M. (2013). « Towards generation of peach (Prunus persica L. Batsch) mutants resistant to Plume pox virus (PPV). », 2013 CSPB/SCBV Annual General Meeting, Quebec City, Canada, June 25-28, 2013.
2013 - Consulter les détails de la publication
Austin, R.S., Wu, D., Zhou, S., et Brown, D.C.W. (2013). « The root transcriptome for North American ginseng assembled and profiled across seasonal development. », BMC Genomics, 14(1: Article number 564), p. 1-14. doi : 10.1186/1471-2164-14-564
2013 - Consulter les détails de la publication
Na, R., Yu, D., Chapman, A.D., Austin, R.S., Zhao, J., et Gijzen, M. (2012). « Mapping of the Phytophthora sojae avirulence gene Avr1c - a combined strategy of bulk segregant analysis and next generation sequencing. », Canadian Phytopathological Society (CPS) South Western Ontario Regional 2012 Meeting, Southern Crop Protection and Food Research Centre, AAFC, London, ON, Canada, November 3, 2012, Published in: Canadian Journal of Plant Pathology (2013), 35(1), 97 (Abstract).
2012 - Consulter les détails de la publication
Pandurangan, S., Pajak, A., Austin, R.S., et Marsolais, F. (2012). « Transcriptional responses to exogenous asparagine in Arabidopsis roots. », 51st Phytochemical Society of North America (PSNA) Annual Meeting, University of Western Ontario, London, ON, Canada, August 11-15, 2012.
2012 - Consulter les détails de la publication
Wu, D., Austin, R.S., Zhou, S., et Brown, D.C.W. (2012). « De novo assembly of the North American Ginseng root transcriptome and analysis of expression during development. », International Conference on Cultivating Natural Bioactives for Health & Disease, London Convention Centre, London, ON, Canada, July 9-11, 2012.
2012 - Consulter les détails de la publication
Zou, X., Shi, C., Austin, R.S., Navabi, A., Yu, K., et Cui, Y. (2012). « Genome Wide SNP discovery and transcriptional profiling of CBB resistance in common bean. », 9th Canadian Pulse Research Workshop, Niagara Falls Marriott Gateway, Niagara Falls, ON, Canada, November 6-12, 2012. (Affiche)
2012 - Consulter les détails de la publication
Pandurangan, S., Pajak, A., Marsolais, F., et Austin, R.S. (2012). « Transcriptional responses to exogenous asparagine in Arabidopsis roots. », Pharmaceutical Biology, 50, p. 1341. (Résumé)
2012 - Consulter les détails de la publication
Schreiber, K.J., Austin, R.S., Gong, Y., Zhang, J., Fung, P., Wang, P.W., Guttman, D.S., et Desveaux, D. (2012). « Forward chemical genetic screens in Arabidopsis identify genes that influence sensitivity to the phytotoxic compound sulfamethoxazole. », BMC Plant Biology, 12:226. doi : 10.1186/1471-2229-12-226
2012 - Consulter les détails de la publication
Liao, D., Pajak, A., Karcz, S.R., Chapman, B. P., Austin, R.S., Sharpe, A.G., Datla, R.S.S., Dhaubhadel, S., et Marsolais, F. (2012). « Transcripts of sulfur metabolic genes are coordinately regulated in developing seeds of common bean lacking phaseolin and major lectins. », Journal of Experimental Botany, 63(17), p. 6283-6295. doi : 10.1093/jxb/ers280
2012 - Consulter les détails de la publication
Lo, T., Chatfield, S.P., Austin, R.S., Lewis, J., Breit, R., Santos-Severino, A., Provart, N.J., Fung, P., Wang, P.W., Guttman, D.S., et Desveaux, D. (2011). « Next-generation mapping of disease resistance genes in Arabidopsis: Exploiting natural variation. », Canadian Society of Plant Physiologists Eastern Regional Meeting & Plant Development Workshop / Congrès de la Société Canadienne de Physiologie Végétale & Congrès de Développement Végétale (Congrès Régional de l’Est), Carleton University, Ottawa, ON, Canada, December 2-3, 2011, SC-5, p. 22.
2011 - Consulter les détails de la publication
Austin, R.S., Vidaurre, D., Stamatiou, G., Breit, R., Provart, N.J., Bonetta, D., Zhang, J., Fung, P., Gong, Y., Wang, P.W., McCourt, P., et Guttman, D.S. (2011). « Next-generation mapping of Arabidopsis genes. », Plant Journal, 67(4), p. 715-725. doi : 10.1111/j.1365-313X.2011.04619.x
2011 - Consulter les détails de la publication
Winter, C.M., Austin, R.S., Blanvillain-Baufumé, S., Reback, M.A., Monniaux, M., Wu, M.F., Sang, Y., Yamaguchi, A., Yamaguchi, N., Parker, J.E., Parcy, F., Jensen, S.T., Li, H., et Wagner, D. (2011). « LEAFY target genes reveal floral regulatory logic, cis motifs, and a link to biotic stimulus response. », Developmental Cell, 20(4), p. 430-443. doi : 10.1016/j.devcel.2011.03.019
2011 - Consulter les détails de la publication
Austin, R.S., Yang, L., Zhang, J., Fung, P., Gong, Y., Wang, P.W., Laberge, S., Guttman, D.S., et McCourt, P. (2010). « Toward a transcriptomic reference assembly for Alfalfa. », Cellulosic Biofuel Network (CBN) 2nd Annual General Meeting, Ottawa Marriott Hotel, Ottawa, ON, Canada, March 11-12, 2010, Poster #69, p. 46. (Affiche)
2010 - Consulter les détails de la publication
Morris, P.F., Schlosser, L.R., Onasch, K.D., Wittenschlaeger, T., Austin, R.S., et Provart, N.J. (2009). « Multiple horizontal gene transfer events and domain fusions have created novel regulatory and metabolic networks in the oomycete genome. », PLoS ONE, 4(7, Article No. e6133). doi : 10.1371/journal.pone.0006133
2009 - Consulter les détails de la publication
Austin, R.S., Provart, N.J., et Cutler, S.R. (2007). « C-terminal motif prediction in eukaryotic proteomes using comparative genomics and statistical over-representation across protein families. », BMC Genomics, 8:191. doi : 10.1186/1471-2164-8-191
2007 - Consulter les détails de la publication