Rishi R. Burlakoti, PhD

Image Rishi R. Burlakoti
Chercheur en phytopathologie

Je suis chercheur en phytopathologie pour le compte d’Agriculture et Agroalimentaire Canada (AAC) au Centre de recherche et développement d’Agassiz. Mes programmes de recherche portent sur la caractérisation des pathogènes, l’épidémiologie des maladies et la gestion durable des principales maladies qui touchent les cultures de petits fruits et de légumes de champ et de serre en Colombie-Britannique. J’ai des intérêts de recherche pour la lutte intégrée contre les maladies des plantes, l’épidémiologie des phytopathologies, les interactions hôte-pathogène ainsi que la génétique et la génomique des pathogènes. 

Je suis également professeur associé à la Faculty of Land and Food System de l’Université de la Colombie-Britannique (UBC) et à la Faculty of Plant Agriculture de l’Université de Guelph. Je participe aux comités de rédaction de la Revue canadienne de phytopathologie, de Plants et de PeerJ.

Recherche et / ou projets en cours

  • Étude génétique de populations de souches de Phytophthora infestans qui causent le mildiou de la pomme de terre et de la tomate au Canada
  • Caractérisation des pathogènes et gestion durable du complexe de pourritures racinaires et de la brûlure bactérienne qui touchent les cultures de petits fruits
  • Inventaire, épidémiologie et prévisions des maladies des petits fruits et des légumes
  • Surveillance des maladies et caractérisation des plantes indigènes alimentaires
  • Identification de sources de résistance aux viroses

Énoncés de recherches/projets

  • Étude génétique de populations de souches de Phytophthora infestans qui causent le mildiou de la pomme de terre et de la tomate au Canada
  • Caractérisation des pathogènes et gestion durable du complexe de pourritures racinaires et de la brûlure bactérienne qui touchent les cultures de petits fruits
  • Inventaire, épidémiologie et prévisions des maladies des petits fruits et des légumes
  • Surveillance des maladies et caractérisation des plantes indigènes alimentaires
  • Identification de sources de résistance aux viroses

Activités professionnelles / intérêts

  • Vice-président, The Professional Pest Management Association of British Columbia
  • Membre du conseil d’administration, Lower Mainland Horticultural Improvement Association (LMHIA)
  • Membre du conseil d’administration, Conseil de recherche et développement, BC Greenhouse Growers Association
  • Membre, Comité de l’éducation et Comité de la coopération internationale de la Société canadienne de phytopathologie
  • Assistant-éditeur, Revue canadienne de phytopathologie, juil. 2019 – aujourd’hui
  • Éditeur, Plants, MDPI AG, déc. 2014 – aujourd’hui
  • Éditeur, PeerJ, oct. 2020 – aujourd’hui
  • Éditeur de section, Revue canadienne de phytopathologie, juil. 2017 – juil. 2019
  • Assistant éditeur, Revue canadienne de phytotechnie, fév. 2018 – déc. 2020
  • Éditeur, Archives of Phytopathology and Plant Protection, nov. 2014 – juil. 2020

Prix et études

ÉTUDES

  • Ph. D. en phytopathologie, Université d’État du Dakota du Nord à Fargo (D.N.) É.-U.
  • M. Sc. en phytopathologie, Université Tribhuvan, Népal
  • B. Sc. en agronomie, Université Tribhuvan, Népal

Prix et distinctions

  • Best Graduate School Research Award 2008, Collège d’Agriculture et des Ressources naturelles, Université d’État du Dakota du Nord.
  • Graduate School Fellowship, Université d’État du Dakota du Nord, 2005-2008

Honorable Membership Awards 2008 : Phi Kappa Phi and Gamma Sigma Delta

Expérience et / ou de travail international

Avant de se joindre à AAC, M. Burlakoti a travaillé en qualité de phytopathologiste pour le World Vegetable Center et a dirigé les unités de mycologie et de bactériologie au siège social du centre à Taiwan. Durant cette période, il a collaboré à des projets de lutte intégrée avec les responsables de programmes nationaux de l’Asie du Sud-Est (Vietnam, Laos et Cambodge), de l’Asie du Sud (Inde et Népal) et de l’Afrique (Mali). Il a également collaboré auparavant à d’autres projets de lutte intégrée (épidémiologie et prévisions de maladies) dans plusieurs pays européens dont le R.-U., le Portugal et la Hongrie.

De plus, M. Burlakoti a été membre du comité de coordination canadien du Programme international de partenariat et de jumelage de l’Institut agricole du Canada de 2010 à 2012, dans un projet d’agriculture biologique au Népal. Actuellement, M. Burlakoti est membre du Comité de coopération internationale de la Société canadienne de phytopathologie.

Principales publications

  1. Betz, E. C. L., Burlakoti, R. R., Novinscak, A., and Sabaratnam, S. 2022. Characterization of cryptic species of Botrytis associated with fruit rot of highbush blueberry and raspberry in the Fraser Valley of British Columbia. British Columbia regional meeting, 2021/Réunion régionale de la Colombie-Britannique, 2021, Canadian Journal of Plant Pathology (Abstr.) Page 2. DOI: 10.1080/07060661.2022.2102280.

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  2. Novinscak, A., Burlakoti, R. R., Gill, S. and Slyadnev, M. N. 2022. Comparison of real-time PCR detection systems using naturally infected Botrytis cinerea berry samples. British Columbia regional meeting, 2021/Réunion régionale de la Colombie-Britannique, 2021, Canadian Journal of Plant Pathology (Abstr.) Page 4. DOI: 10.1080/07060661.2022.2102280.

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  3. Root rot and wilting complex (RRWC), primarily caused by several Phytophthora rubi, is an economically important disease of red raspberry in British Columbia. Reliable, rapid, and efficient screening methods are lacking for screening raspberry genotypes in raspberrybreeding programmes. The objective of this study was to compare intact plant root inoculation (IPRI) and detached tissue assays to develop rapid and efficient screening technique for conducting pathological trials and screening raspberry genotypes to RRWC. We compared four IPRI assays, two detached tissue assays and one intact plant stem inoculation (IPSI) assay. A virulent isolate of P. rubi was inoculated in cultivars ‘Chemainus’ and ‘Cascade Bounty’. Experiments were arranged in completely randomized design with three replications in each experiment. For IPRI assays, days to first symptoms development (DFSD), plant wilt progress, and root assessment were recorded. For detached tissue and IPSI assays, DFSD and lesion size were assessed. In susceptible cultivar ‘Chemainus’, all four IPRI assays were found effective assays. DFSD and plant wilt progress were similar among assays. However, variation was observed among four assays in resistant cultivar ‘Cascade Bounty’. Among the detached stem assays, node inoculation method performed better than other methods. Detached stem assays are useful for rapid pathogenicity test of P. rubi, whereas WPRI assays are better for screening germplasms for disease resistance.

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  4. Burlakoti R. R., Novinscak A., vanBaar K., and Griifiths J. 2022. Tomato Brown Rugose Fruit Virus-Global Threat to Greenhouse Tomato Production. Annual Symposium of Professional Pest Management Society of BC, February 24-25, 2022, Virtual.

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  5. Sapkota S. and Burlakoti R. R., Lubbert, M., Lamour K., and Punja Z. 2022. Molecular characterization of Phytophthora species associated with raspberry. Annual Symposium of Professional Pest Management Society of BC (Virtual), February 24-25, 2022

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  6. Burlakoti, R. R. and Percival D. 2021. Baseline sensitivity of Septoria species associated with lowbush blueberry foliar disease to chlorothalonil and propiconazole fungicides. 12th International Vaccinium Symposium (Virtual), August 30 to September 1, 2021.

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  7. Sapkota S. and Burlakoti R. R., Dossett, M., and Punja Z. 2021. Development of effective methods for pathogenicity and screening of Phytophthora spp. on red raspberry seedlings. BC Regional Annual Meeting of Canadian Phytopathological Society (Virtual), November 9-10, 2021.

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  8. Novinscak A., Burlakoti R. R., Gill S., Slyadnev M. N. 2021. Comparison of real time PCR detection systems using naturally infected Botrytis cinerea berry samples. BC Regional Annual Meeting of Canadian Phytopathological Society (Virtual), November 9-10, 2021.

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  9. Burlakoti R. R., Sapkota S. 2021. Recent Progress in Pathogen Characterization and Development of Disease Screening Protocols for Blueberry and Raspberry Selections. BC Berries Research Review Meeting October 21- 22, 2021.

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  10. Betz E.C.L, Burlakoti R. R., Novinscak A., and Sabaratnam, S. 2021. Characterization of cryptic species of Botrytis associated with fruit rot of highbush blueberry and raspberry in the Fraser Valley of British Columbia. BC Regional Annual Meeting of Canadian Phytopathological Society (Virtual), November 9-10, 2021.

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  11. Burlakoti R. R. 2021. Update on Development of Decision Support Tools in Berry Crops. BC Berries Research Review Meeting October 21- 22, 2021

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  12. Sapkota S. and Burlakoti R. R. 2022. Metalaxyl sensitivity of Phytophthora spp. associated with red raspberry in British Columbia. Tri-Society Virtual Conference: Canadian Phytopathological Society, Canadian Society for Horticultural Science, Canadian Society of Agronomy, 2021. Canadian Journal of Plant Pathology (Abstr.) Page 29, DOI: 10.1080/07060661.2021.2009254.

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  13. Latchman S. R. and Burlakoti R. R. 2022. Characterization and developing effective screening methods of bacterial blight of highbush blueberry in the Lower Mainland of British Columbia. Tri-Society Virtual Conference: Canadian Phytopathological Society, Canadian Society for Horticultural Science, Canadian Society of Agronomy, 2021. Canadian Journal of Plant Pathology (Abstr.) Page 18, DOI: 10.1080/07060661.2021.2009254.

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  14. Burlakoti R. R. and Peters R. 2021. Late Blight: Always an Issue for Potatoes – Implications for Home Gardeners. In: Kabaluk, T. and Frey, L (Eds.) 2021 Proceedings of the Lower Mainland Horticulture Improvement Association 63rd Annual Growers’ Short Course, January 28 to 30. Pages 22-24. ISSN 2560-7561.

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  15. Burlakoti, R. R., Chen, J.-R. 2018. Virulence spectrum of Ralstonia solanacearum strains isolated from grafted and non-grafted tomato plants. British Columbia Regional Meeting, 2017/Réunion régionale de la Colombie-Britannique, 2017, Canadian Journal of Plant Pathology, 40:1, 153-160, DOI: 10.1080/07060661.2017.1416041.

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  16. Sapkota S. and Burlakoti R. R. 2021. Root rot and wilting complex of red raspberry in the Fraser Valley of British Columbia. British Columbia regional meeting, 2020/, Canadian Journal of Plant Pathology (Abstr.), 43:2, 337, DOI: 10.1080/07060661.2021.1889804.

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  17. Sapkota S and Burlakoti RR. 2021. Investigating Management Options of the Raspberry Root Rot Complex. BC Berries Research Review Meeting February 26, 2021.

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  18. Burlakoti RR. 2021. Developing Decision Support Tools for Blueberry and Raspberry Diseases and Overview of Berry Pathology Research. BC Berries Research Review Meeting February 26, 2021.

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  19. Burlakoti RR, Latchman SR, Sapkota S. 2021. Characterizing Pathogens and Improving Disease Screening Methods to Support Raspberry and Blueberry Breeding. BC Berries Research Review Meeting February 26, 2021.

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  20. Sapkota S and Burlakoti, RR.2021. Metalaxyl sensitivity of Phytophthora spp. obtained from red raspberry fields in British Columbia. The Professional Pest Management Association of British Columbia 2021 Symposium, February 18-19, Virtual.

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Installation de recherche

6947, route 7 – C.P. 1000
Agassiz, BC V0M 1A2
Canada

Affiliations

  • Professeur associé, Faculty of Land and Food System, Université de la Colombie-Britannique
  • Professeur associé, Faculty of Plant Agriculture, Université de Guelph
  • Membre de la Société internationale de la science horticole
  • Membre de la Société canadienne de phytopathologie
  • Membre à vie de la Société népalaise d’agronomie
  • Membre à vie de la Société népalaise des sciences horticoles
  • Membre à vie de l’Association nord-américaine des professionnels népalais en agriculture

Language

Anglais
Français