Paul McLaren
Chef du programme de génomique hôte, visant à étudier la façon dont la variation du génome humain influe sur la santé et les maladies aux laboratoires nationaux du VIH et de rétrovirologie.
Recherche et / ou projets en cours
Le groupe du Dr McLaren utilise les outils de la biologie systémique (y compris la génomique, la transcriptomique et les études sur le microbiome) pour répondre aux questions entourant la susceptibilité différentielle aux infections.
Dr McLaren souhaite notamment utiliser des renseignements sur la génétique humaine afin de déterminer des cibles médicamenteuses potentielles, d’améliorer la réaction au vaccin et la réponse des patients à la thérapie en faisant appel à une approche axée sur la médecine de précision
Énoncés de recherches/projets
- Dirige le programme de génomique hôte, en utilisant des techniques génématiques et moléculaire afin d’étudier la façon d’exploiter le génome humain en vue de connaître les catalyseurs de susceptibilité aux infections, la progression de la maladie et la réponse au traitement.
- Élabore à l’interne des tests d’édition de gènes en fusionnant de grandes bases de données génomiques humaines avec des analyses à l’échelle de la génomique pour définir les protéines hôtes qui peuvent servir de cibles médicamenteuses pour traiter et prévenir les infections.
- Élabore des outils d’analyse multiéchelle pour extraire un large ensemble de données et des types de données diversifiés afin de comprendre comment le système immunitaire humain interagit avec le microbiome et influe la fonction immunitaire et la susceptibilité aux infections.
Activités professionnelles / intérêts
Encadre des étudiants du PFETE, coop, de premier cycle ou de cycles supérieurs et des candidats au doctorat.
Réviseur pour plusieurs revues scientifiques, notamment Nature Medicine, PLoS Pathogens et Clinical Infectious Diseases and Immunity.
Invité à des conférences et séminaires internationaux sur la génomique et le VIH.
Prix et études
Éducation
Recherche postdoctorale à Brigham and Women’s Hospital/Harvard Medical Schoold et à Broad Institute visant à examiner la façon dont le génome humain contribue au contrôle élite du VIH
Ph. D., Microbiologie médicale et maladies infectieuses, Université du Manitoba, 2008
B. Sc., (hon.) Microbiologie, Université du Manitoba, 1999
Prix
Prix 2012 de la collaboration pour la découverte d’un vaccin contre le sida pour les jeunes/chercheur en début de carrière
Prix du jeune chercheur du colloque 2011 sur les rétrovirus et les infections opportunistes
Prix 2008 de la thèse de doctorat en biologie moléculaire sur la fermentation d’Apotex
Expérience et / ou de travail international
- Chef d’équipe junior en génématique à l’École Polytechnique Fédérale de Lausanne, en Suisse, 2012 - 2015
- A fondé un consortium international de chercheurs dans le domaine des maladies infectieuses axé sur l’étude des génomes humains de l’infection impliquant des collaborateurs œuvrant sur cinq continents.
- Collaborations internationales actives :
- Centre pour le programme de recherche sur le sida en Afrique du Sud (Afrique du Sud), Université de Nairobi (Kenya), Université pontificale bolivarienne (Colombie), École polytechnique fédérale de Lausanne (Suisse), Institut national du cancer (États-Unis), Institut de recherche biomédicale du Texas (États‑Unis), Réseau d’essais de vaccins contre le VIH (États-Unis), Institut Wellcome Trust Sanger (Royaume-Uni), Initiative internationale pour un vaccin contre le sida (Royaume-Uni)
Liens additionnels
Principales publications
Tough, R.H., McLaren, P.J. Interaction of the host and viral genome and their influence on HIV disease. 2019 Frontiers in Genetics, 10(JAN).
http://doi.org/10.3389/fgene.2018.00720
Raisaro, J.-L., McLaren, P.J., Fellay, J., (...), Klersy, C., Hubaux, J.-P. Are privacy-enhancing technologies for genomic data ready for the clinic? A survey of medical experts of the Swiss HIV Cohort Study. 2018 Journal of Biomedical Informatics, 79, pp. 1-6.
http://doi.org/10.1016/j.jbi.2017.12.013
McLaren, P.J., Pulit, S.L., Gurdasani, D., (...), De Bakker, P.I.W., Fellay, J. Evaluating the impact of functional genetic variation on HIV-1 Control. 2017 Journal of Infectious Diseases, 216(9), pp. 1063-1069.
http://doi.org/10.1093/infdis/jix470
Bartha, I., McLaren, P.J., Brumme, C., (...), Telenti, A., Fellay, J. Estimating the Respective Contributions of Human and Viral Genetic Variation to HIV Control. 2017 PLoS Computational Biology, 13(2),e1005339.
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005339
Asgari, S., McLaren, P.J., Peake, J., (...), Fellay, J., Schlapbach, L.J. Corrigendum: Exome sequencing reveals primary immunodeficiencies in children with community-acquired pseudomonas aeruginosa sepsis. 2016 Frontiers in Immunology, 7, 357, (2016).
https://doi.org/10.3389/fimmu.2016.00357
Asgari, S., McLaren, P.J., Peake, J., (...), Baer, W., Relly, C. Exome sequencing reveals primary immunodeficiencies in children with community-acquired Pseudomonas aeruginosa sepsis. 2016 Frontiers in Immunology, 7(SEP),357.
https://doi.org/10.3389/fimmu.2016.00357
Martinez-Picado, J., McLaren, P.J., Erkizia, I., (...), Izquierdo-Useros, N., Telenti, A. Identification of siglec-1 null individuals infected with HIV-1. 2016 Nature Communications, 7,12412.
https://doi.org/10.1038/ncomms12412
Mclaren, P.J., Raisaro, J.L., Aouri, M., (...), Hubaux, J.-P., Telenti, A. Privacy-preserving genomic testing in the clinic: A model using HIV treatment. 2016 Genetics in Medicine, 18(8), pp. 814-822.
https://doi.org/10.1038/gim.2015.167
McLaren PJ, Coulonges C, Bartha, I, (…), Zagury JF, Fellay J. Common variants of large effect explain the majority of the host genetic contribution to HIV-1 control. Proc Natl Acad Sci. 2015 Nov 24;112(47):14658-63.
https://doi.org/10.1073/pnas.1514867112
Pereyra F*, Jia X*, McLaren PJ* (…), and The International HIV Controllers Study*. The major genetic determinants of HIV-1 control affect HLA class I peptide presentation. Science. 2010 Dec 10;330(6010):1551-7.
https://doi.org/10.1126/science.1195271
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Professeur associé, départements de microbiologie médicale et de maladies infectieuses, Collège de médecine, Faculté des sciences de la santé, Université du Manitoba