Odile Carisse

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Chercheur scientifique

Odile Carisse (Ph. D.) exerce les fonctions de phytopathologiste à Agriculture et Agroalimentaire Canada depuis 1992. Elle est aussi une spécialiste mondiale de l’aérobiologie moléculaire, de la lutte contre les maladies des cultures et de la modélisation théorique des maladies des cultures. Au cours de la dernière décennie, elle s’est spécialisée de plus en plus en intégrant diverses disciplines à ses recherches, notamment l’aérobiologie, l’épidémiologie, la modélisation mathématique, la théorie de la décision et de l’échantillonnage et la quantification moléculaire de l’inoculum des pathogènes et de leur résistance aux fongicides. Les connaissances qui en résultent aident grandement à résoudre les problèmes posés par les maladies des cultures et à faire adopter les solutions par les intervenants. Mme Carisse travaille avec le secteur pour établir des réseaux de surveillance des pathogènes aériens et de la résistance aux fongicides ainsi que des systèmes améliorés de décisions en matière de lutte contre les maladies. Elle a reçu le prix pour réalisations exceptionnelles en recherche (2015) de la Société canadienne de phytopathologie et a été élue correspondante étrangère de l’Académie d’agriculture de France. Mme Carisse est porte‑parole de la Plateforme de recherche en biovigilance, une orientation de recherche qui vise à promouvoir la recherche sur l’évolution temporelle et spatiale des ennemis des cultures sous l’influence des systèmes agricoles, des produits de protection, des cultivars, des pratiques agricoles et des changements climatiques.

Recherche et / ou projets en cours

Expertise:

Épidémiologie et aérobiologie moléculaires : Mise au point de méthodes moléculaires pour la quantification absolue des spores fongiques, de leurs génotypes (Formae specialis, lignées clonales, races, biotypes, pathotypes, etc.) et de la résistance aux fongicides à partir de divers types d’échantillons.

 

Analyse de la distribution spatiale : Analyse de la distribution spatiale de l’inoculum aérien et élaboration de nouvelles théories aérobiologiques pour des applications à la lutte contre les maladies des cultures. Analyse de la distribution spatiale et de la coexistence des individus résistants aux fongicides. Élaboration de plans d’échantillonnage améliorés pour surveiller la résistance aux fongicides.

 

Prévision des risques de maladies des cultures pour la prise de décisions optimales dans la lutte contre les maladies : Élaboration d’indicateurs proactifs des risques de maladies à partir de la surveillance et de la prévision de l’inoculum (qui se manifeste toujours avant l’infection), de façon à permettre aux producteurs de réagir à temps et d’appliquer des fongicides au besoin seulement.

 

Élaboration et intégration de méthodes mathématiques pour résoudre les problèmes de modélisation des maladies des cultures.

 

Élaboration de cadres de lutte intégrée contre les maladies.

 

Énoncés de recherches/projets

Education

B.Sc.                                       1984-1987                  McGill University, Agronomy

M.Sc.                                      1987-1989                  McGill University, Phytopathology

Doctorate                               1989-1992                   McGill University, Quantitative epidemiology

Postdoctoral Fellowship          1992 (6 months)          Wageningen University Holland (J.C. Zadoks)

Sabbatical leave                      2004 (6 months)          National Institute of Research in Agronomy,             

                                                                                   Bordeaux, France (Drs S. Savary and L. Willocquet)

Professional experience

1987    Teaching assistant in plant pathology, Macdonald campus of McGill University

1999    Research assistant in plant pathology, Macdonald campus of McGill University

1990    Contract teacher for Plant disease Epidemiology summer courses, Macdonald campus of McGill University

1992-   Research scientist, Agriculture and Agri-food Canada

 

University appointments

1992- 1998                  Adjunct professor, McGill University

2000-2004                   Adjunct professor, Sherbrooke University

2003-                          Adjunct professor, Laval University

2010-                          Adjunct professor, Sherbrooke University

Activités professionnelles / intérêts

Expertise:

Épidémiologie et aérobiologie moléculaires : Mise au point de méthodes moléculaires pour la quantification absolue des spores fongiques, de leurs génotypes (Formae specialis, lignées clonales, races, biotypes, pathotypes, etc.) et de la résistance aux fongicides à partir de divers types d’échantillons.

 

Analyse de la distribution spatiale : Analyse de la distribution spatiale de l’inoculum aérien et élaboration de nouvelles théories aérobiologiques pour des applications à la lutte contre les maladies des cultures. Analyse de la distribution spatiale et de la coexistence des individus résistants aux fongicides. Élaboration de plans d’échantillonnage améliorés pour surveiller la résistance aux fongicides.

 

Prévision des risques de maladies des cultures pour la prise de décisions optimales dans la lutte contre les maladies : Élaboration d’indicateurs proactifs des risques de maladies à partir de la surveillance et de la prévision de l’inoculum (qui se manifeste toujours avant l’infection), de façon à permettre aux producteurs de réagir à temps et d’appliquer des fongicides au besoin seulement.

 

Élaboration et intégration de méthodes mathématiques pour résoudre les problèmes de modélisation des maladies des cultures.

 

Élaboration de cadres de lutte intégrée contre les maladies.

 

 

Prix et études

Recognition

  • Recipient of the The Canadian Coalition of Women in Engineering, Science and Technology’ Award, 2004.

  • Recipient of the ‘Achievement in Grape Disease Management’ award from the French Phytopathological Society in 2010.

  • Keynote speaker: International Congress of Plant Pathology (ICPP-2013, Beijing, China). Carisse, O., Tremblay, D.M., and Van der Heyden, H. 2013. Integration of molecular biology tools into conventional epidemiology: the example of molecular tools to assess risk of disease and efficacy of management actions.

  • Keynote speaker: 11th International Epidemiology Workshop (11th IWE, 2013, Beijing, China). Carisse. O., and Caffi, T. 2013. The ‘for and against’ the various approaches used to develop Disease Decision Support System (DDSS).

  • Elected as foreign correspondent of the Académie d’Agriculture de France (French Academy of Agriculture).

Expérience et / ou de travail international

Work as external review expert

  • External scientific expert (2005): Research Commission ETH Zentrum.

  • International expert invited by the French Minister of Agriculture and Ecology to chair the symposium ‘Pesticide, Agriculture and Environment’ December 2005, Paris, France (expenses paid). The resulting book served as a framework for the French policy on pesticide reduction.

  • External scientific expert (2008-2009): National Institute of Research in Agronomy (INRA), France

  • External scientific expert (2009-2010): National centre for Scientific Research (CNRS), France

  • External scientific expert for FAO: programs review of the International Rice Research Institute (IRRI), Los Banos, Philippines, 2011

  • External scientific expert (2010-2012): Belgium National Scientific Research Funds

  • External reviewers for the Belgium National Research Funding Program (FNRS, Fonds de la Recherche Scientifique), 2011-2014.

  • External reviewers for the French National Research agency (ANR, Agence Nationale dela Recherche), 2009-2014

  • External examiner for three Ph.D. students in Canada, two from France (AGROPARISTECH, NAPG-INRA) and one from Spain (Universidad del Pais Vasco).

  • Jury on scientist promotion committees: INRA France, and Plant Pathology, Institute of Plant Sciences Federal Institute of Technology Switzerland

  • External scientific expert for the Biological Sciences Research Council (BBSRC) in the UK (2014).

  • Scientific reviewer for several funding agencies (total of 48 proposals-last 10 years): AAC, MII, CAAP, FCAR, FCAR-FAQDD, VRQ, IRSST, CDAQ, CRSNG, PrimeVert, Agri-science cluster.

     

Principales publications

  1. (2023) Annual meeting, the Canadian phytopathological society, 2022/Réunion annuelle, la société canadienne de phytopathologie, 2022, Canadian Journal of Plant Pathology, 45:3, 210-235, DOI: 10.1080/07060661.2023.2202486

    2023 - Consulter les détails de la publication

  2. Makela, K., et al. (2021). Biovigilance: A Modern Approach to Plant Pest Management (Vision Statement), Agriculture and Agri-Food Canada, Science and Technology Branch: 29 pp.

    2021 - Consulter les détails de la publication

  3. Minville et al. 2021. Grass cover crops during vineyard establishment in southern Quebec: Their effects on weed control and soil aggregate stability to water. Tri-Society (CSP, CSA, CSHS ) Virtual Conference, 5-9 July 2021.

    2021 - Consulter les détails de la publication

  4. Minville, A.-K., Simard, M.-J., Halde, C. et Carisse, O. 2021. Comparaison des régies de culture dans l’entre-rang pour la répression des adventicces et la prévention de l’érosion hydrique dans la vigne (Vitis sp.) semi-rustique en implantation au Québec. 5e Édition des Journées SERVO. 8-9 avril 2021. En ligne.

    2021 - Consulter les détails de la publication

  5. Minville, A-K., Simard, M.-J., Halde, C. and Carisse, O. 2020. Can cover crops control weeds and mitigate soil water erosion during the establishment of grapevine (Vitis vinifera L.) in southern Quebec? Canadian Weed Science Society meeting November 23-26, Online.

    2020 - Consulter les détails de la publication

  6. Fall, M.L., Xu, D., Lemoyne, P., Ben Moussa, I.E., Beaulieu, C., Carisse, O. (2020). A diverse virome of leafroll-infected grapevine unveiled by dsRNA sequencing. Viruses, [online] 12(10), http://dx.doi.org/10.3390/v12101142

    2020 - Consulter les détails de la publication

  7. Lu, W., Newlands, N.K., Carisse, O., Atkinson, D.E., Cannon, A.J. (2020). Disease risk forecasting with Bayesian learning networks: Application to grape powdery mildew (Erysiphe necator) in vineyards. Agronomy, [online] 10(5), http://dx.doi.org/10.3390/agronomy10050622

    2020 - Consulter les détails de la publication

  8. Lu, W., Carisse, O., Atkinson, D. 2018. Forecasting of grape powdery mildew disease risk in vineyards using a Bayesian learning network model. Joint Statistical Meetings (JSM), Vancouver, B.C., Canada, July 28 - August 2

    2018 - Consulter les détails de la publication

  9. Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Carisse, O., Diarra, M.S., Peters, R.D., Lowe, C., Chapados, J.T., Lévesque, C.A. (2018). Assessing performance of spore samplers in monitoring aeromycobiota and fungal plant pathogen diversity in Canada. Applied and Environmental Microbiology, [online] 84(9), http://dx.doi.org/10.1128/AEM.02601-17

    2018 - Consulter les détails de la publication

  10. Chen W, Hambleton S, Seifert KA, Lévesque CA, Carisse O, Moussa SD, Peters RD, Lowe C, Chapados JT. 2017. Assessing performance of spore samplers in monitoring and forecasting aeromycobiota diversity and fungal plant pathogen distribution patterns. Applied and Environmental Microbiology Submitted, under peer review.

    2017 - Consulter les détails de la publication

  11. Vincent, C., Carisse, O., et Mason, P.G. (2016). « Integrated pest management practices, ecological services and agroecosystem resilience. », Workshop “Making Agro-Ecosystems More Resilient”, Agriculture and Agri-Food Canada, Ottawa, Canada, June 6, 2016. (Présentation)

    2016 - Consulter les détails de la publication

  12. Marie-Claude Gagnon, Lawrence Kawchuk, D. Mathieu Tremblay, Odile Carisse, Giovanna Danies, William E. Fry, C. André Lévesque et Guillaume J. Bilodeau. (2016). Identification des génotypes dominants de Phytophthora infestans au Canada à l’aide de la PCR en temps réel et de l’ASO-PCR. Plant Disease 100 (7): 1482-1491. http://apsjournals.apsnet.org/doi/pdf/10.1094/PDIS-07-15-0763-RE

    2016 - Consulter les détails de la publication

  13. Gagnon, M.C., Kawchuk, L., Mathieu Tremblay, D., Carisse, O., Danies, G., Fry, W.E., Lévesque, C.A., Bilodeau, G.J. (2016). Identification of the dominant genotypes of phytophthora infestans in Canada using real-time PCR with ASO-PCR Assays. Plant Disease, [online] 100(7), 1482-1491. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-07-15-0763-RE

    2016 - Consulter les détails de la publication

  14. Gobeil-Richard, M., Tremblay, D.M., Beaulieu, C., Van der Heyden, H., et Carisse, O. (2015). « A pyrosequencing-based method to quantify genetic substitutions associated with resistance to succinate dehydrogenase inhibitor fungicides in Botrytis spp. Populations. », Pest Management Science. doi : 10.1002/ps.4026

    2016 - Consulter les détails de la publication

  15. Carisse, O., Kawchuk, L.M., Peters, R.D., Bilodeau, G.J., Lévesque, C.A., Vincent, C., et Laforest, M. (2015). « Biovigilance: un canevas conceptuel pour la lutte contre les ravageurs. Journée Nationale de la science sur la Biovigilance et l’horticulture de précision. », National Science Day on Biovigilance and Precision Agriculture, Agriculture and Agri-Food Canada, Saint-Jean-sur-Richelieu, QC, Canada, July 9, 2015. (Présentation)

    2015 - Consulter les détails de la publication

  16. Carisse, O. (2015). « Influence du mildiou d’automne sur le développement de la maladie la saison suivante Implication pour la lutte. Symposium », Symposium Vigne et Vins, Drumondville, Quebec, Canada, February, 2015. (Présentation)

    2015 - Consulter les détails de la publication

  17. Carisse, O. et Jobin, T. (2015). « A host growth based model to time fungicide sprays against Venturia inaequalis. », Acta Horticulturae (ISHS), 1068, p. 163-170.

    2015 - Consulter les détails de la publication

  18. Carisse, O., Van der Heyden, H., et Morissette-Thomas, V. (2015). « Quantitative relationships between Erisyphe necator airborne inoculum density above grape canopy and weather variables. », Acta Horticulturae (ISHS), 1068, p. 179-188.

    2015 - Consulter les détails de la publication

  19. Carisse, O. et Van der Heyden, H. (2015). « Relationship of airborne botrytis cinerea conidium concentration to tomato flower and stem infections: A threshold for de-leafing operations. », Plant Disease, 99(1), p. 137-142. doi : 10.1094/PDIS-05-14-0490-RE

    2015 - Consulter les détails de la publication

  20. Barros, L.B., Biasi, L.A., Carisse, O., et De Mio, L.L.M. (2015). « Incidence of grape anthracnose on different VITIS labrusca and hibrid cultivars and rootstocks combination under humid subtropical climate. », Australasian Plant Pathology, 44(4), p. 397-403. doi : 10.1007/s13313-015-0353-8

    2015 - Consulter les détails de la publication

Installation de recherche

430, boul. Gouin
Saint-Jean-sur-Richelieu, QC J3B 3E6
Canada

Affiliations

Editorial activities

  • Senior Editor Phytopathology (2012- )

  • Editor Canadian Journal of Plant Pathology, section epidemiology (2007-2012)

  • Editor Canadian Journal of Plant Pathology, section Articles in French (2007- )

  • Reviewer for (85 manuscripts- last 10 years): APS-Press (3), APS Education centre (2), Aerobiologia (1); Agr. & Chemistry J. (2); Agriculture, Ecosystems and Environment (2); Biological Control (2); Can. J. Plant Science (1); Canadian Journal of Botany (1); Canadian Journal of Microbiology (1); Canadian Journal of Plant Pathology (9); Crop protection (7); European Journal of Plant Pathology (12); Hort science (2); International Journal of Biometeorology (2); Journal of Plant Pathology (1); Mycologia (1); Parasitica (1); Pest Management Science (1); Phytopathology (11); Phytoprotection (1); Plant Disease (12); Plant Pathology (7); Tropical Plant Pathology (1)

     

     

    Involvement in scientific societies

     

    Canadian Society of Plant Pathology

    1987-présent   Member

    2001-2005       Directeur 

    2003                President of the scientific program/local organization committee: Annual meeting, Montreal.

    2004                Member of the committee 75Th anniversary special events

    2008-2012       Member and chair of the awards committee (chair 2012)

     

    Canadian Forum for Biological control:

    2002-2006       Member (vice-president 2003, president 2004)

     

    American Phytopathological Society

    1987-présent   Member

    2001-2003.      Board of the North-east division

    2002-2005.      Member of the symposium committee

    2002.               President of the scientific program and local organization committee: Annual meeting, Bromont, Qc. 

     

    International Society of Plant Pathology

    1992-               Delegate for the Quebec Society of Plant Protection

    2004                Member of the committee: Epidemiology.

    2005.               Member of the scientific committee: 9th workshop on Plant disease epidemiology, Landerneau, France. Presentation of the closing remarks

    2008-2013       Chair Epidemiology committee.

    2009                Member of the scientific committee: 10th workshop on Plant disease epidemiology, Geneva, NY.

     

    Quebec Society for Plant Protection

    1987-               Member         

    2003-2008       Member of the committee: French names of plant diseases

    2002                President of the scientific program and local organization committee.

     

     

    Work as external review expert

  • External scientific expert (2005): Research Commission ETH Zentrum.

  • International expert invited by the French Minister of Agriculture and Ecology to chair the symposium ‘Pesticide, Agriculture and Environment’ December 2005, Paris, France (expenses paid). The resulting book served as a framework for the French policy on pesticide reduction.

  • External scientific expert (2008-2009): National Institute of Research in Agronomy (INRA), France

  • External scientific expert (2009-2010): National centre for Scientific Research (CNRS), France

  • External scientific expert for FAO: programs review of the International Rice Research Institute (IRRI), Los Banos, Philippines, 2011

  • External scientific expert (2010-2012): Belgium National Scientific Research Funds

  • External reviewers for the Belgium National Research Funding Program (FNRS, Fonds de la Recherche Scientifique), 2011-2014.

  • External reviewers for the French National Research agency (ANR, Agence Nationale dela Recherche), 2009-2014

  • External examiner for three Ph.D. students in Canada, two from France (AGROPARISTECH, NAPG-INRA) and one from Spain (Universidad del Pais Vasco).

  • Jury on scientist promotion committees: INRA France, and Plant Pathology, Institute of Plant Sciences Federal Institute of Technology Switzerland

  • External scientific expert for the Biological Sciences Research Council (BBSRC) in the UK (2014).

  • Scientific reviewer for several funding agencies (total of 48 proposals-last 10 years): AAC, MII, CAAP, FCAR, FCAR-FAQDD, VRQ, IRSST, CDAQ, CRSNG, PrimeVert, Agri-science cluster.

     

    Research grants and collaborations

  • Dr. Carisse initiated and led studies that have attracted over $12M in research funding from growers, research funding agencies, government, industry etc. A portion of the funds were from a matching fund initiative of Agriculture and Agri-food Canada.

  • For the majority of these grants she prepared, initiated and was responsible for the concepts, ideas, and work plans, selection of partners, reporting, staffing, and budgeting.

  • She developed extensive collaborations both nationally and internationally with scientists, production specialists, industry personnel and government decision makers from Federal, Provincial, Industry, University and Private Concerns. Many of these collaborations have been long-lasting and resulted in several peer reviewed and non peer reviewed publications (see list of contributions).

     

    Work on commeettes

  • Jury on scientist promotion committees (2007-2008: RES-02-03, 2013-2014: RES-03-04): Agriculture and Agrifood Canada.

  • Program leader (2008-2011): Development, evaluation and implementation of reduced risk strategies for diseases of horticultural crops, Agriculture and Agrifood Canada.

  • Plant disease specialist, Expert Committee on Apple, Agriculture and Agrifood Canada.

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    Plant disease specialist, Expert Committee on muck vegetables, Agriculture and Agrifood Canada.

  • (1996- 2009).

  • Plant disease specialist, Expert Committee on Grape, Agriculture and Agrifood Canada.

  • < >

    2013. Carisse, O., Madden, L.V., and Xiao-Bing Yang. Organization of the symposium entitled: Disease Modeling and Epidemiology. International Congress of Plant Pathology, August 2013, Beijing, China.

  • 2013. Carisse, O., Zeng, S.M., and Peng, Y. 11th International Epidemiology Workshop August 2013, Beijing, China.

  • 2009. Carisse, O., Gadoury, D. Scientific program, 10th International Epidemiology Workshop, June 2009, Geneva, NY.

  • 2004. Carisse, O. and Jenny, S. 17th International Lettuce and Leafy Vegetable: President of the scientific program and local organization committee: Annual meeting. Chair of the session Disease management.

  • 2003. Carisse, O. Canadian Phytopathological Society, Annual meeting, June, 2003, Montréal, Qc., Canada.

  • 2002. Carisse, O. American Phytopathological Society, Annual meeting, North Eastern Division, October 2002, Bromont, Qc., Canada.

  • 2000. Carisse, O. and McHardy, W. 60th Annual meeting of the American Phytopathological Society Northesatern Division, November 2000, Cape Cod, USA.

  • 1999. Carisse, O. Quebec Society for Plant Protection, Annual meeting, June 1999, St-Jean-sur-Richelieu, Qc., Canada.

Langue

Anglais
Français