Nilusha Malmuthuge, Ph. D.

Chercheuse scientifique

5403 1st Avenue South Lethbridge, AB T1J 4B1

Recherche et / ou projets en cours

Interventions précoces pour améliorer la santé intestinale néonatale : prévention durable de la diarrhée virale néonatale bovine.

Impact des bonnes pratiques vaccinales (BPV) sur le terrain sur l’efficacité des vaccins

Identification des mécanismes de régulation impliqués dans l’établissement postnatal de l’homéostasie épithéliale-microbienne à l’aide de multiomiques fonctionnelles comparatives.

Révéler le véritable microbiome des animaux destinés à l’alimentation grâce au séquençage de nouvelle génération : surmonter les effets des artefacts de séquençage.

Énoncés de recherches/projets

Je suis immunologiste et microbiologiste pour animaux destinés à l’alimentation avec une expérience de recherche en immunologie, biologie moléculaire, microbiologie et bioinformatique. Mon programme de recherche vise à accroître la résilience des systèmes d’élevage, à réduire l’utilisation d’antimicrobiens dans le système de production de produits animaux vivants et à faciliter la production de produits animaux appréciés par le consommateur (sans antibiotiques) grâce à une meilleure santé animale.

Activités professionnelles / intérêts

Recherche OMICS - Immunomics, Microbiome

Santé intestinale et respiratoire néonatale

Immunologie des muqueuses

Prix et études

2011-2016 Doctorat en sciences animales, Université de l’Alberta, Canada

2009-2011 M.Sc. en sciences animales, Université de l’Alberta, Canada

2003-2007 B.Sc. en agriculture (avec distinction), Université de Peradeniya, Sri Lanka

Expérience et / ou de travail international

Exploratory Research Space at the RWTH Aachen University, Germany

Collaboration with Dr. Mathias Hornef

"Identification of regulatory mechanisms involved in the postnatal establishment of epithelial-microbial homeostasis using comparative functional multi-omics"

Principales publications

Since 2017;

Bridgman, S.L., N. Malmuthuge, R. Mandal, C. J. Field, A. M. Haqq, P. J. Mandhane, T. J. Moraes, S. E. Turvey, E. Simons, P. Subbarao, J.A. Scott, D. S. Wishart, A. L Kozyrskyj. 2022. Childhood body mass index and associations with infant gut metabolites and secretory IgA: findings from a prospective cohort study. Int J Obes (Lond). 46:1712-1719
Pratt, J., A. Hormadokova, N. Malmuthuge*, L.L. Guan. 2022. Gut microbiota and the gut-brain axis in neonatal calves: Implications for psychobiotic usage for stress regulation. Gut microbiota, Immunity, and Health in Production Animals. Edited by MH Kogut and G Zhang. Springer Nature. PP295-325.
Malmuthuge, N. A. Howell, N. Arsic, P.J. Griebel. 2021. Effect of maternal separation and transportation stress on the bovine upper respiratory tract microbiome and the immune response to resident opportunistic pathogens. Animal Microbiome. 3:62
Malmuthuge, N. and L.L. Guan. 2021 Noncoding RNAs: Regulatory molecules of host-microbiome crosstalk. Invited Review. Trend Microbiol. 29: 713-724
Malmuthuge, N., G. Liang, L.L. Guan. 2019. Regulation of rumen development in neonatal ruminants through microbial metagenomes and host transcriptomes. Genome Biol. 20:172. doi: 10.1186/s13059-019-1786-0
Malmuthuge, N.*, P.J. Griebel. 2019. A novel animal model for regional microbial dysbiosis of the pioneer microbial community. Front. Microbiol. 10:1706. doi: 10.3389/fmicb.2019.01706.
Malmuthuge, N., G. Liang, P.J. Griebel, L.L. Guan. 2019. Taxonomic and functional composition of the small intestinal microbiome in neonatal calves provide a novel framework for understanding early life gut health. Appl. Environ. Microbiol. 85:e02534-18. doi: 10.1128/AEM.02534-18.
Malmuthuge, N.*, P.J. Griebel. 2018. Fetal environment and fetal intestine are sterile during the third trimester of pregnancy. Vet Immunol. Immunopathol. 204:59-64. doi: 10.1016/j.vetimm.2018.09.005.
Song, Y., N. Malmuthuge, F. Li, L.L. Guan. 2018. Colostrum feeding shapes the hindgut microbiota of dairy calves during the first 12h of life. FEMS Microbiol. Ecol. 95(1). doi: 10.1093/femsec/fiy203.
Song, Y., N. Malmuthuge, M.A. Steele, L.L. Guan. 2018. Shift of hindgut microbiota and microbial short chain fatty acids profiles in dairy calves from birth to pre-weaning. FEMS Microbiol. Ecol. 94: doi: 10.1093/femsec/fix179.
Fisher, A., N. Malmuthuge, L.L. Guan, M.A. Steele. 2018. The effect of heat-treatment of bovine colostrum on the concentration of oligosaccharides in colostrum and in the intestine of neonatal male Holstein calves. J. Dairy Sci. 101:401-407. doi: 10.3168/jds.2017-13533.
Osman, R. N. Malmuthuge, P. Gonzalez-Cano, P.J. Griebel. 2018. Development and function of the mucosal immune system in the upper respiratory tract of neonatal calves. Annu. Rev. Anim. Biosci. 6: 141-155. doi: 10.1146/annurev-animal-030117-014611.
Malmuthuge, N., L.L. Guan. 2017. Understanding the gut microbiome of dairy calves: opportunities to improve early life gut health. Invited Review. J. Dairy Sci. 100:5996-6005. doi: 10.3168/jds.2016-12239.
Malmuthuge, N., L.L. Guan. 2017. Understanding host-microbial interactions in rumen: Searching the best opportunity for microbiota manipulation. Invited Review. J. Anim. Sci. Biotechnol. 8:8. doi: 10.1186/s40104-016-0135-3.